EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000016917 (Gene tree)
Gene ID: 104858930
Gene Symbol: POLR1E
Alias: FLJ13390|FLJ13970|PAF53|PRAF1
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23851 bases
Position: chrKN121817.1:4260402-4284252
Accession: 104858930
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000008719	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	1.5e-107	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000021784	POLR1E-201	1434	XM_010619405	ENSFDAP00000008719	418 (aa)	XP_010617707	A0A091DWD0

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000016917's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000016917's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.450	ENSG00000137054	POLR1E	99	84.450	Homo_sapiens
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	45.084	ENSAPOG00000012452	polr1e	99	45.084	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	76.724	ENSAMEG00000010193	POLR1E	97	76.724	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	46.154	ENSACIG00000009884	polr1e	99	46.154	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	47.343	ENSAOCG00000005665	polr1e	99	47.343	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	47.962	ENSAPEG00000020581	polr1e	99	47.962	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	48.284	ENSATEG00000020609	polr1e	98	48.284	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	80	55.497	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	55.497	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.450	ENSANAG00000038046	POLR1E	99	84.450	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.047	ENSACLG00000013685	polr1e	99	46.047	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	43.614	ENSAMXG00000018181	polr1e	98	43.614	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.885	ENSBTAG00000012243	POLR1E	99	85.885	Bos_taurus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	89	84.492	ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	84.492	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	86.364	ENSCAFG00000002377	POLR1E	99	86.364	Canis_familiaris
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	86.603	ENSCAFG00020017851	POLR1E	99	86.603	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.407	ENSCHIG00000019479	POLR1E	99	85.407	Capra_hircus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.646	ENSTSYG00000002075	POLR1E	99	85.646	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000016917	POLR1E	69	88.850	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	88.850	Cavia_aperea
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	90.431	ENSCPOG00000009965	POLR1E	100	90.431	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	76.555	ENSCCAG00000029460	POLR1E	99	76.555	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.493	ENSCATG00000031732	POLR1E	99	83.721	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000016917	POLR1E	88	93.716	ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	93.716	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.254	ENSCSAG00000010782	POLR1E	99	83.254	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	73.791	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	73.791	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	65.937	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	66.180	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.014	ENSCANG00000036112	POLR1E	99	83.014	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.493	ENSCGRG00001006197	Polr1e	96	83.493	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.014	ENSCGRG00000006430	Polr1e	96	83.014	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	43.890	ENSCSEG00000005121	polr1e	96	43.890	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	44.853	ENSCVAG00000019759	polr1e	98	44.853	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	44.332	ENSDARG00000006434	polr1e	98	43.689	Danio_rerio
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	75.161	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	75.161	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	85	78.873	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	78.873	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000016917	POLR1E	53	38.806	ENSEBUG00000010635	-	76	38.806	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.928	ENSEASG00005000675	POLR1E	99	84.928	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.167	ENSECAG00000014669	POLR1E	99	85.167	Equus_caballus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	70.738	ENSEEUG00000011928	POLR1E	87	69.287	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	47.585	ENSELUG00000008150	polr1e	97	47.585	Esox_lucius
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.254	ENSFCAG00000013081	POLR1E	99	83.254	Felis_catus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	59.747	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	59.747	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	45.000	ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.000	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	93	40.000	ENSGMOG00000003336	POLR1E	93	40.648	Gadus_morhua
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	60.964	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	60.964	Gallus_gallus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	46.715	ENSGAFG00000004850	polr1e	98	46.715	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	43.614	ENSGACG00000016087	polr1e	98	43.614	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	58.780	ENSGAGG00000001659	POLR1E	98	58.838	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.211	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	84.211	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.512	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	46.512	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	93.541	ENSHGLG00000002036	POLR1E	100	93.541	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	93.780	ENSHGLG00100012784	POLR1E	100	93.780	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	44.853	ENSHCOG00000002774	polr1e	98	45.343	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	42.961	ENSIPUG00000003019	polr1e	98	42.961	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	87.081	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	87.081	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	85.577	ENSJJAG00000020731	Polr1e	96	85.577	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	43.645	ENSKMAG00000000046	polr1e	99	43.645	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	47.045	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	47.045	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000016917	POLR1E	86	63.158	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	63.158	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	50.957	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	50.957	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.450	ENSLAFG00000012831	POLR1E	99	84.450	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.732	ENSMFAG00000045465	POLR1E	99	83.721	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.732	ENSMMUG00000017892	POLR1E	99	83.732	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	77.336	ENSMNEG00000040283	POLR1E	99	81.333	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.732	ENSMLEG00000031135	POLR1E	99	83.732	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.556	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	46.556	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.047	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	46.047	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.014	ENSMAUG00000021044	Polr1e	96	83.014	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.407	ENSMICG00000003673	POLR1E	99	85.407	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.014	ENSMOCG00000012920	Polr1e	96	83.014	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	45.721	ENSMMOG00000007391	polr1e	98	45.301	Mola_mola
ENSFDAG00000016917	POLR1E	95	74.242	ENSMODG00000002884	POLR1E	97	74.242	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	45.327	ENSMALG00000002665	polr1e	99	45.327	Monopterus_albus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	82.651	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	83.461	Mus_caroli
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	82.892	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	83.461	Mus_musculus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	84.096	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	84.733	Mus_pahari
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	82.651	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	83.206	Mus_spretus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	76.282	ENSMPUG00000006040	POLR1E	99	76.282	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.971	ENSMLUG00000012688	POLR1E	96	83.971	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	87.260	ENSNGAG00000002520	Polr1e	96	87.260	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.512	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	46.512	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.971	ENSNLEG00000003616	POLR1E	99	83.971	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000016917	POLR1E	73	77.500	ENSMEUG00000015372	-	80	77.500	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	86	71.229	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	71.229	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	92.344	ENSODEG00000014565	POLR1E	97	92.344	Octodon_degus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.744	ENSONIG00000008921	polr1e	99	46.744	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	82.536	ENSOCUG00000024773	POLR1E	99	82.536	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	44.418	ENSORLG00000005143	polr1e	99	44.418	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	42.184	ENSORLG00020007271	polr1e	99	44.020	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	44.048	ENSORLG00015000137	polr1e	99	44.181	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	43.237	ENSOMEG00000013264	polr1e	96	43.237	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.689	ENSOGAG00000012981	POLR1E	97	84.689	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.407	ENSOARG00000011465	POLR1E	96	85.407	Ovis_aries
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.211	ENSPPAG00000034566	POLR1E	99	84.211	Pan_paniscus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.254	ENSPPRG00000005649	POLR1E	99	83.254	Panthera_pardus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.254	ENSPTIG00000009774	POLR1E	99	83.254	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	84.211	ENSPTRG00000020944	POLR1E	99	84.211	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.732	ENSPANG00000025563	POLR1E	99	83.732	Papio_anubis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	46.283	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.523	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000016917	POLR1E	95	61.461	ENSPSIG00000003274	POLR1E	92	61.461	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	46.384	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	46.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	82.297	ENSPEMG00000019151	-	96	82.297	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	67.780	ENSPEMG00000022300	-	96	67.780	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	95	73.990	ENSPCIG00000014798	POLR1E	97	73.990	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	44.292	ENSPFOG00000019627	polr1e	97	44.292	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	46.190	ENSPLAG00000022679	polr1e	99	46.190	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000016917	POLR1E	85	46.175	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	46.175	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	46.135	ENSPREG00000009470	polr1e	98	46.135	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.254	ENSPPYG00000019061	POLR1E	99	83.254	Pongo_abelii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	56	81.277	ENSPCAG00000004891	POLR1E	77	81.277	Procavia_capensis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.646	ENSPCOG00000027448	POLR1E	99	85.646	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	87.023	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	87.023	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	46.279	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	46.279	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	42.092	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	42.092	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	84.096	ENSRNOG00000012664	Polr1e	96	84.096	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	99	79.710	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	82.368	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	83.254	ENSRROG00000031986	POLR1E	99	83.721	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	82.775	ENSSBOG00000021415	POLR1E	99	82.775	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	86	71.031	ENSSHAG00000016084	POLR1E	99	71.031	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	48.049	ENSSFOG00015002293	polr1e	98	48.049	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	48.605	ENSSMAG00000011672	polr1e	94	48.605	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	48.529	ENSSDUG00000022279	polr1e	97	48.529	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	48.284	ENSSLDG00000024918	polr1e	97	48.284	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	64	68.966	ENSSARG00000009810	-	67	68.966	Sorex_araneus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	64.806	ENSSPUG00000009499	POLR1E	99	64.806	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	47.343	ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.343	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	87.081	ENSSSCG00000005347	POLR1E	99	87.081	Sus_scrofa
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	51.016	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	51.016	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	43.128	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	43.669	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	44.743	ENSTNIG00000017812	polr1e	98	44.743	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	82.297	ENSTBEG00000013786	POLR1E	88	82.297	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000016917	POLR1E	94	85.101	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	85.101	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.407	ENSUAMG00000012474	POLR1E	100	86.921	Ursus_americanus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	85.407	ENSUMAG00000011496	POLR1E	99	85.407	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	82	79.179	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	79.179	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	86.603	ENSVVUG00000019954	POLR1E	99	86.603	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	52.300	ENSXETG00000006533	polr1e	99	52.300	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	45.742	ENSXCOG00000013706	polr1e	98	45.742	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000016917	POLR1E	97	47.202	ENSXMAG00000012484	polr1e	98	47.202	Xiphophorus_maculatus