EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000017210 (Gene tree)
Gene ID: 104876986
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 39026 bases
Position: chrKN123614.1:2498242-2537267
Accession: 104876986
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000009118	PAZ	PF02170.22	7.7e-29	1	1
ENSFDAP00000009125	PAZ	PF02170.22	7.7e-29	1	1
ENSFDAP00000009118	Piwi	PF02171.17	9.8e-111	1	1
ENSFDAP00000009125	Piwi	PF02171.17	9.8e-111	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000022140	AGO1-202	6569	XM_010645252	ENSFDAP00000009125	857 (aa)	XP_010643554	UPI00053F4ACE
ENSFDAT00000022137	AGO1-201	2571	-	ENSFDAP00000009118	856 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000017210's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000017210's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000017210	AGO1	98	83.890	ENSFDAG00000004759	AGO2	99	83.274
ENSFDAG00000017210	AGO1	98	83.489	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	83.489
ENSFDAG00000017210	AGO1	98	84.923	ENSFDAG00000012874	AGO3	99	84.923

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSAPOG00000024299	ago1	100	96.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	99.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000017210	AGO1	82	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSAOCG00000017727	ago1	100	96.154	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSAPEG00000004458	ago1	100	96.154	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSATEG00000008523	ago1	100	96.154	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	93.677	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.677	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSANAG00000037711	AGO1	100	99.883	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.921	ENSACLG00000000890	ago1	100	95.921	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000017210	AGO1	80	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	99.767	Bos_taurus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	99.883	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	99.883	Canis_familiaris
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.289	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	98.956	ENSCHIG00000011848	-	100	98.956	Capra_hircus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	78.763	ENSTSYG00000032426	-	100	78.763	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSTSYG00000009767	-	100	99.883	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000017210	AGO1	89	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	99.883	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	99.883	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.184	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	99.883	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	99.883	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000017210	AGO1	85	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	99.767	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCANG00000039798	AGO1	100	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	99.883	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.882	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.882	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.921	ENSCVAG00000018173	ago1	100	95.921	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.620	ENSDARG00000092644	ago1	100	96.620	Danio_rerio
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000017210	AGO1	93	98.817	ENSDORG00000008494	Ago1	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000017210	AGO1	84	93.065	ENSETEG00000007626	AGO1	100	93.065	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSEASG00005012086	AGO1	100	99.883	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSECAG00000024353	AGO1	100	99.883	Equus_caballus
ENSFDAG00000017210	AGO1	92	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	99.883	Felis_catus
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.680	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000017210	AGO1	87	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSGALG00000002249	AGO1	100	99.767	Gallus_gallus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSGAFG00000009775	ago1	100	96.154	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000017210	AGO1	87	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	99.883	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.921	ENSHBUG00000010459	ago1	100	95.921	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	99.883	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.270	ENSIPUG00000023216	ago1	100	96.270	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	99.883	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	99.883	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSKMAG00000019464	ago1	100	96.154	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSLBEG00000007694	ago1	100	96.154	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	94.172	ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.172	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.882	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.765	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	99.883	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	95.065	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.916	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSMAMG00000008381	ago1	100	96.154	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.921	ENSMZEG00005007996	ago1	100	95.921	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	94.393	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.393	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	99.883	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSMICG00000016147	AGO1	100	99.883	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	99.767	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000017210	AGO1	78	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.650	ENSMODG00000023335	AGO1	100	99.650	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	96.458	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.539	Monopterus_albus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.883	Mus_caroli
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.883	Mus_musculus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.883	Mus_pahari
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.883	Mus_spretus
ENSFDAG00000017210	AGO1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000017210	AGO1	61	99.425	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.425	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	99.767	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	99.767	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000017210	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000017210	AGO1	93	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	100.000	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSODEG00000005321	AGO1	100	99.883	Octodon_degus
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	96.340	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.340	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	91.003	ENSOANG00000002080	AGO1	100	91.977	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	99.767	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSORLG00000014965	ago1	100	96.154	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSORLG00020018253	ago1	100	96.154	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSORLG00015003287	ago1	100	96.154	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSOMEG00000020528	ago1	100	96.154	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.882	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.882	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSOARG00000019591	AGO1	100	99.767	Ovis_aries
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	99.883	Pan_paniscus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	99.883	Panthera_pardus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.650	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	99.650	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	99.883	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPANG00000009060	AGO1	100	99.883	Papio_anubis
ENSFDAG00000017210	AGO1	98	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000017210	AGO1	80	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	99.883	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.650	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	99.650	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSPFOG00000005867	ago1	100	96.154	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSPREG00000006534	ago1	100	96.154	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	99.883	Pongo_abelii
ENSFDAG00000017210	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	66	100.000	Procavia_capensis
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSPVAG00000005082	AGO1	100	99.883	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	92.219	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.219	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000017210	AGO1	93	92.356	ENSPNAG00000000597	ago1	99	92.356	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.767	ENSRNOG00000055915	Ago1	100	99.767	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSRBIG00000032611	AGO1	100	99.883	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSRROG00000044469	AGO1	100	99.883	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSSBOG00000020867	AGO1	100	99.883	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	98.595	ENSSHAG00000017468	AGO1	100	98.480	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.270	ENSSFOG00015020982	ago1	100	96.270	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.037	ENSSMAG00000002841	ago1	100	96.037	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSSDUG00000010864	ago1	100	96.154	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSSLDG00000000386	ago1	100	96.154	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000017210	AGO1	74	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	74	100.000	Sorex_araneus
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.646	ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSSPAG00000019154	ago1	100	96.154	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.266	ENSTRUG00000024431	ago1	100	96.442	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	95.925	ENSTNIG00000012102	ago1	100	95.925	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000017210	AGO1	84	99.445	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	99.445	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	98.250	ENSTTRG00000015088	AGO1	100	98.250	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSUAMG00000027154	AGO1	100	99.883	Ursus_americanus
ENSFDAG00000017210	AGO1	99	96.357	ENSUMAG00000002480	AGO1	99	96.108	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000017210	AGO1	95	92.166	ENSVPAG00000006663	AGO1	100	92.166	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	99.883	ENSVVUG00000000405	AGO1	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	98.021	ENSXETG00000004364	ago1	100	98.021	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000017210	AGO1	91	96.419	ENSXCOG00000007669	ago1	100	96.419	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000017210	AGO1	100	96.154	ENSXMAG00000021899	ago1	100	96.154	Xiphophorus_maculatus