EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000017529 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49570 bases
Position: chrKN122133.1:4674632-4724201
Accession: 24085
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000009543	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000022531	SRPRB-201	3353	-	ENSFDAP00000009543	271 (aa)	-	A0A091DKV1

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000017529's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000017529's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000017529	SRPRB	51	30.216	ENSFDAG00000009197	-	72	30.216

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.882	ENSG00000144867	SRPRB	99	95.597	Homo_sapiens
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.037	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	90.037	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.299	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	89.299	Bos_taurus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.037	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	90.037	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.930	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	88.930	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.930	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	88.930	Capra_hircus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.037	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	90.037	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	86.347	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	86.347	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.299	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	89.299	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	92.251	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	93.358	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	93.358	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	92.251	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	81.919	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	81.919	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	76.015	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	76.015	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.668	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	89.668	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000017529	SRPRB	95	91.473	ENSCGRG00000014367	Srprb	99	91.473	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	87.085	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	87.085	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	90	81.569	ENSDORG00000000764	Srprb	85	89.954	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.406	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	90.406	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.406	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	90.406	Equus_caballus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	88.192	Felis_catus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.620	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	92.620	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	94.834	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	94.834	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	94.834	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	94.834	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	83.764	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	83.764	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	92.251	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	92.251	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	92.251	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	92.251	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.037	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	90.037	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.775	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	90.775	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	96	85.328	ENSMODG00000018493	SRPRB	97	85.328	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.561	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	88.561	Mus_caroli
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	88.192	Mus_musculus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.668	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	89.668	Mus_pahari
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.930	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	88.930	Mus_spretus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	87.823	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	87.823	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.930	ENSNGAG00000024311	-	100	88.930	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.513	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	91.513	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	93.727	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	93.727	Octodon_degus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.299	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	89.299	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.299	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	89.299	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000017529	SRPRB	84	89.912	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	92.694	Ovis_aries
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.882	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	91.882	Pan_paniscus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	88.192	Panthera_pardus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	87.823	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	87.823	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.882	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	91.882	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.882	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	91.882	Papio_anubis
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.299	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	89.299	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	92.251	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	92.251	Pongo_abelii
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	79.705	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	79.705	Procavia_capensis
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	90.037	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	90.037	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.882	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	91.882	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	91.882	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	91.882	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000017529	SRPRB	74	87.065	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	87.065	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	86.716	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	86.716	Sorex_araneus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.192	Sus_scrofa
ENSFDAG00000017529	SRPRB	93	90.119	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	88.764	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	81.181	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	81.181	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	88.192	Ursus_americanus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	87.823	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	87.823	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	89.299	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	89.299	Vulpes_vulpes