EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000017881 (Gene tree)
Gene ID: 104871232
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35382 bases
Position: chrKN122849.1:9868433-9903814
Accession: 104871232
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000010015	RF-1	PF00472.20	1.2e-38	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000029969	MTRF1-201	6211	XM_010637100	ENSFDAP00000010015	446 (aa)	XP_010635402	UPI00053F4C80

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000017881's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000017881's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000017881	MTRF1	73	48.160	ENSFDAG00000007828	MTRF1L	85	48.160

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.426	ENSG00000120662	MTRF1	100	85.426	Homo_sapiens
ENSFDAG00000017881	MTRF1	77	58.621	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	58.621	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.960	ENSAMEG00000008696	MTRF1	100	82.960	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000017881	MTRF1	54	67.364	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	67.364	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	56.701	ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	56.701	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	55.928	ENSAPEG00000014844	mtrf1	87	55.928	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000017881	MTRF1	80	57.103	ENSATEG00000017403	mtrf1	86	57.103	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	99	63.371	ENSAPLG00000009317	MTRF1	99	63.371	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000017881	MTRF1	98	59.050	ENSACAG00000000897	MTRF1	98	59.050	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	78.076	ENSANAG00000023063	-	100	78.076	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	80.570	ENSANAG00000025310	-	97	84.573	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	56.995	ENSACLG00000023945	mtrf1	86	56.995	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000017881	MTRF1	52	67.965	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	67.965	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	99	83.747	ENSBTAG00000012260	MTRF1	99	83.747	Bos_taurus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.184	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	89.080	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.221	ENSCAFG00000004795	MTRF1	100	83.221	Canis_familiaris
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.221	ENSCAFG00020018178	MTRF1	100	83.221	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.735	ENSCHIG00000011810	MTRF1	100	82.735	Capra_hircus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.305	ENSTSYG00000006976	MTRF1	100	84.305	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000017881	MTRF1	97	90.046	ENSCAPG00000013163	MTRF1	100	90.046	Cavia_aperea
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	89.238	ENSCPOG00000005264	MTRF1	100	89.238	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.857	ENSCCAG00000035116	MTRF1	100	83.857	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.202	ENSCATG00000009909	MTRF1	100	85.202	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	89.238	ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	89.238	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.202	ENSCSAG00000017835	MTRF1	100	85.202	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	92	75.306	ENSCHOG00000011915	-	100	75.306	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	71.392	ENSCPBG00000007969	MTRF1	86	71.392	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.978	ENSCANG00000040353	MTRF1	100	84.978	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	80.045	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	100	80.045	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	80.045	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	100	80.045	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	56.693	ENSCSEG00000005667	mtrf1	86	56.693	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	88	54.156	ENSCVAG00000021729	mtrf1	91	54.156	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	52	59.829	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	59.829	Danio_rerio
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	81.696	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	90.968	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	99	83.820	ENSDORG00000016429	Mtrf1	100	83.820	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	78.251	ENSETEG00000014811	MTRF1	100	78.251	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000017881	MTRF1	52	57.692	ENSEBUG00000000778	mtrf1	96	57.692	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.857	ENSEASG00005015715	MTRF1	100	83.857	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.408	ENSECAG00000014389	MTRF1	97	83.408	Equus_caballus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	62.723	ENSEEUG00000004450	-	100	63.170	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	54.026	ENSELUG00000006544	mtrf1	89	54.026	Esox_lucius
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	81.390	ENSFCAG00000031635	MTRF1	100	81.390	Felis_catus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	89	66.667	ENSFALG00000008036	MTRF1	99	66.667	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	53.525	ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.525	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	84	52.116	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	52.116	Gadus_morhua
ENSFDAG00000017881	MTRF1	98	63.697	ENSGALG00000016951	MTRF1	97	63.697	Gallus_gallus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.789	ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	55.789	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	84	57.067	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	57.067	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	70	75.241	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	75.241	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.978	ENSGGOG00000002529	MTRF1	100	84.978	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	89.686	ENSHGLG00000003210	MTRF1	100	89.686	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	89.686	ENSHGLG00100011843	MTRF1	100	89.686	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	55.440	ENSHCOG00000009449	mtrf1	87	55.440	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.408	ENSSTOG00000021682	MTRF1	100	83.408	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.063	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	100	82.063	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	55.325	ENSKMAG00000003231	mtrf1	85	55.325	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	54	65.021	ENSLBEG00000027169	-	98	65.021	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000017881	MTRF1	54	65.021	ENSLBEG00000023151	mtrf1	98	65.021	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000017881	MTRF1	99	60.722	ENSLACG00000010582	MTRF1	99	61.261	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000017881	MTRF1	88	58.270	ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	58.270	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	81.390	ENSLAFG00000022177	-	100	81.390	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000017881	MTRF1	99	67.195	ENSLAFG00000030499	-	99	67.195	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.202	ENSMFAG00000037972	MTRF1	100	85.202	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.426	ENSMNEG00000035487	MTRF1	100	85.426	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.202	ENSMLEG00000033582	MTRF1	100	85.202	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	83	58.333	ENSMAMG00000022048	mtrf1	83	58.333	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	56.995	ENSMZEG00005017922	mtrf1	86	56.995	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	69.330	ENSMGAG00000014971	MTRF1	93	69.330	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	80.493	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	100	80.493	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.753	ENSMICG00000033131	MTRF1	100	84.753	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	77.578	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	100	77.578	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000017881	MTRF1	51	59.825	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	59.825	Mola_mola
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	70.246	ENSMODG00000014772	MTRF1	100	70.246	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	56.021	ENSMALG00000013274	mtrf1	87	56.021	Monopterus_albus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	79.372	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	99	79.372	Mus_caroli
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	80.493	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	100	80.493	Mus_musculus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	78.924	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	100	78.924	Mus_pahari
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	79.596	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	100	79.596	Mus_spretus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	99	81.757	ENSMPUG00000001874	MTRF1	99	81.757	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.960	ENSMLUG00000017237	MTRF1	100	82.960	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.184	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	100	83.184	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000017881	MTRF1	51	68.122	ENSNBRG00000004634	mtrf1	97	68.122	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.202	ENSNLEG00000001236	MTRF1	100	85.202	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	65.778	ENSMEUG00000001846	MTRF1	100	65.778	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	74	53.030	ENSOPRG00000006450	-	100	53.030	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	86.099	ENSODEG00000005782	MTRF1	100	86.099	Octodon_degus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	57.784	ENSONIG00000012476	mtrf1	98	57.784	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	70	71.338	ENSOANG00000003383	-	99	71.338	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.063	ENSOCUG00000025207	MTRF1	100	82.063	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	57.592	ENSORLG00000003225	mtrf1	87	57.592	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	57.330	ENSORLG00020021048	mtrf1	86	57.330	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	57.330	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	57.330	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	58.158	ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	58.158	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000017881	MTRF1	73	77.914	ENSOGAG00000026411	-	100	77.914	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	80.045	ENSOGAG00000009719	-	100	80.045	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.511	ENSOARG00000006994	MTRF1	100	82.511	Ovis_aries
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.426	ENSPPAG00000000050	MTRF1	100	85.426	Pan_paniscus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.063	ENSPPRG00000009511	MTRF1	100	82.063	Panthera_pardus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.287	ENSPTIG00000006673	MTRF1	100	82.287	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.426	ENSPTRG00000005815	MTRF1	100	85.426	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.426	ENSPANG00000010809	MTRF1	100	85.426	Papio_anubis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	54.617	ENSPKIG00000015711	mtrf1	89	54.617	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	70.103	ENSPSIG00000004773	MTRF1	86	70.103	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	53	66.807	ENSPMGG00000006724	mtrf1	97	66.807	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	79.642	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	100	79.642	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	76	51.445	ENSPMAG00000009849	mtrf1	99	51.445	Petromyzon_marinus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	71.111	ENSPCIG00000012940	MTRF1	100	71.111	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.263	ENSPFOG00000000254	mtrf1	87	55.263	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.789	ENSPLAG00000014280	mtrf1	87	55.789	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	55.263	ENSPMEG00000023245	mtrf1	87	55.263	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000017881	MTRF1	52	63.090	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	63.090	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.081	ENSPPYG00000005313	MTRF1	100	84.081	Pongo_abelii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	85.874	ENSPCOG00000018133	MTRF1	100	85.874	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.287	ENSPVAG00000008573	MTRF1	100	82.287	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	54	67.782	ENSPNYG00000004357	mtrf1	96	67.782	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000017881	MTRF1	88	53.690	ENSPNAG00000010682	mtrf1	89	53.690	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	78.971	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	95.575	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.978	ENSRBIG00000007069	MTRF1	100	84.978	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	84.978	ENSRROG00000035345	MTRF1	100	84.978	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	87.831	ENSSBOG00000004572	MTRF1	100	87.831	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	92	71.046	ENSSHAG00000018109	MTRF1	100	71.046	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	57.403	ENSSFOG00015006191	mtrf1	87	57.403	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	55.814	ENSSMAG00000015740	mtrf1	87	55.814	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	57.545	ENSSDUG00000022608	mtrf1	76	57.545	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	57.545	ENSSLDG00000013584	mtrf1	76	57.545	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	77.803	ENSSARG00000002306	MTRF1	100	77.803	Sorex_araneus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	53	74.468	ENSSPUG00000007354	MTRF1	97	74.468	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	56.250	ENSSPAG00000000881	mtrf1	87	56.250	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.287	ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	82.287	Sus_scrofa
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	68.123	ENSTGUG00000012422	MTRF1	93	68.123	Taeniopygia_guttata
ENSFDAG00000017881	MTRF1	87	56.667	ENSTRUG00000000396	mtrf1	86	56.667	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000017881	MTRF1	83	58.919	ENSTNIG00000017149	-	98	58.575	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	54	79.079	ENSTBEG00000004696	-	100	79.079	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.632	ENSTTRG00000010370	MTRF1	100	83.632	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	83.632	ENSUMAG00000014772	MTRF1	100	83.632	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.327	ENSVPAG00000002565	MTRF1	100	82.327	Vicugna_pacos
ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.327	ENSVVUG00000028755	MTRF1	100	82.327	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	67.895	ENSXETG00000018904	mtrf1	98	67.895	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000017881	MTRF1	52	62.069	ENSXCOG00000020386	mtrf1	95	62.069	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000017881	MTRF1	85	54.211	ENSXMAG00000009853	mtrf1	86	54.211	Xiphophorus_maculatus