EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000018185 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC4
Alias: C1orf169|FLJ25691|MGC26594|RP1-127C7.4
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6696 bases
Position: chrKN123200.1:834689-841384
Accession: 32152
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000010423	APOBEC_N	PF08210.11	1.2e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000030037	APOBEC4-201	2417	-	ENSFDAP00000010423	317 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000018185's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000018185's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.885	ENSG00000173627	APOBEC4	85	77.885	Homo_sapiens
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	80.769	ENSAMEG00000002503	APOBEC4	82	80.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	77	63.525	ENSACAG00000015192	APOBEC4	70	63.525	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	78.526	ENSBTAG00000047395	APOBEC4	85	78.526	Bos_taurus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	76.603	ENSCJAG00000040026	APOBEC4	85	76.603	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	78.205	ENSCAFG00000013349	APOBEC4	85	78.205	Canis_familiaris
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	78.205	ENSCAFG00020015526	APOBEC4	85	78.205	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.244	ENSCHIG00000011987	APOBEC4	81	77.244	Capra_hircus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	75.321	ENSCSAG00000000243	APOBEC4	85	75.321	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.244	ENSCHOG00000012387	APOBEC4	85	77.244	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	94	56.902	ENSCPBG00000015714	APOBEC4	80	56.902	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	65.815	ENSCGRG00001004553	Apobec4	87	65.815	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	77.987	ENSDNOG00000044664	APOBEC4	86	77.987	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	69.872	ENSDORG00000007335	Apobec4	86	69.872	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	79.245	ENSEASG00005006513	APOBEC4	86	79.245	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	78.931	ENSECAG00000019734	APOBEC4	86	78.931	Equus_caballus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	80.128	ENSFCAG00000010909	APOBEC4	85	80.128	Felis_catus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	92	53.020	ENSGALG00000053078	APOBEC4	86	53.020	Gallus_gallus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.885	ENSGGOG00000042217	APOBEC4	85	77.885	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	81	59.375	ENSLACG00000014504	APOBEC4	71	59.375	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	76.282	ENSMMUG00000031303	APOBEC4	85	76.282	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	88	52.281	ENSMGAG00000017190	APOBEC4	84	52.281	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	66.454	MGP_CAROLIEiJ_G0014701	Apobec4	81	66.454	Mus_caroli
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	65.495	ENSMUSG00000055547	Apobec4	81	65.495	Mus_musculus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	100	63.522	MGP_PahariEiJ_G0027937	Apobec4	83	63.522	Mus_pahari
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	65.495	MGP_SPRETEiJ_G0015508	Apobec4	81	65.495	Mus_spretus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	77.358	ENSMPUG00000011756	APOBEC4	84	77.358	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	76.452	ENSMLUG00000002458	APOBEC4	84	76.452	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	58.621	ENSNGAG00000017599	Apobec4	84	58.621	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	78.526	ENSNLEG00000035610	APOBEC4	85	78.526	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	96	81.967	ENSODEG00000009778	APOBEC4	87	81.967	Octodon_degus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	93	59.459	ENSOANG00000001000	APOBEC4	81	59.459	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	96	80.328	ENSOGAG00000003118	APOBEC4	83	80.328	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.885	ENSOARG00000005287	APOBEC4	85	77.885	Ovis_aries
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	74.679	ENSPPAG00000038272	APOBEC4	85	74.679	Pan_paniscus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	79.808	ENSPPRG00000014706	APOBEC4	85	79.808	Panthera_pardus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	79.487	ENSPTIG00000005518	APOBEC4	85	79.487	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.244	ENSPTRG00000047181	APOBEC4	85	77.244	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	69.649	ENSPEMG00000019164	Apobec4	85	69.649	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	68	34.310	ENSPMAG00000006156	APOBEC4	79	32.534	Petromyzon_marinus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	66.038	ENSPCIG00000003817	APOBEC4	84	66.038	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	76.923	ENSPPYG00000000424	APOBEC4	85	76.923	Pongo_abelii
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	56.289	ENSPCAG00000015174	APOBEC4	86	56.289	Procavia_capensis
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	78.616	ENSPVAG00000001100	APOBEC4	87	78.616	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	67.516	ENSRNOG00000028089	Apobec4	79	67.516	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	96	67.105	ENSSHAG00000013804	APOBEC4	82	67.105	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	94	55.892	ENSSPUG00000010884	APOBEC4	80	55.892	Sphenodon_punctatus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	77.987	ENSSSCG00000015561	APOBEC4	87	77.987	Sus_scrofa
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	78.526	ENSTBEG00000006476	APOBEC4	85	78.526	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	99	79.245	ENSTTRG00000014784	APOBEC4	87	79.245	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	79.808	ENSUAMG00000005088	APOBEC4	85	79.808	Ursus_americanus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	79.487	ENSUMAG00000016285	APOBEC4	85	79.487	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	98	77.885	ENSVVUG00000009054	APOBEC4	85	77.885	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000018185	APOBEC4	78	56.275	ENSXETG00000017441	apobec4	66	56.275	Xenopus_tropicalis