EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000019578 (Gene tree)
Gene ID: 104868615
Gene Symbol: TNPO3
Alias: IPO12|LGMD1F|MTR10A|TRN-SR|TRN-SR2
Full Name: transportin 3
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 92674 bases
Position: chrKN122609.1:2738450-2831123
Accession: 104868615
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000012175	Xpo1	PF08389.12	1.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000030357	TNPO3-201	5468	XM_010633466	ENSFDAP00000012175	925 (aa)	XP_010631768	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSG00000064419	TNPO3	100	99.135	Homo_sapiens
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	86.162	ENSAPOG00000018347	tnpo3	100	86.162	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	95.702	ENSAMEG00000005135	TNPO3	98	95.702	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000019578	TNPO3	96	83.729	ENSACIG00000005897	tnpo3	99	83.729	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	86.270	ENSAOCG00000008264	tnpo3	100	86.270	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000019578	TNPO3	96	86.215	ENSAPEG00000024300	tnpo3	100	86.215	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.189	ENSATEG00000003197	tnpo3	100	85.189	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	72	92.453	ENSAPLG00000005946	TNPO3	91	92.453	Anas_platyrhynchos
ENSFDAG00000019578	TNPO3	82	92.529	ENSACAG00000013470	TNPO3	95	92.529	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.919	ENSANAG00000037940	TNPO3	100	98.919	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.514	ENSACLG00000005561	tnpo3	100	85.514	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.838	ENSAMXG00000016236	tnpo3	100	85.838	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.486	ENSBTAG00000004992	TNPO3	100	98.486	Bos_taurus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.919	ENSCJAG00000018085	TNPO3	100	98.919	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSCAFG00000001543	TNPO3	100	99.243	Canis_familiaris
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSCAFG00020022462	TNPO3	99	98.813	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.486	ENSCHIG00000011721	TNPO3	100	98.486	Capra_hircus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.027	ENSTSYG00000002989	TNPO3	100	99.027	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000019578	TNPO3	70	96.774	ENSCAPG00000005843	TNPO3	91	96.774	Cavia_aperea
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.811	ENSCPOG00000039784	TNPO3	100	98.811	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.027	ENSCCAG00000033826	TNPO3	100	99.027	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSCATG00000030018	TNPO3	100	99.135	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.278	ENSCLAG00000016298	TNPO3	100	98.278	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.027	ENSCSAG00000009966	TNPO3	100	99.027	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	70.619	ENSCHOG00000011547	TNPO3	99	70.619	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000019578	TNPO3	93	94.063	ENSCPBG00000017497	TNPO3	100	94.063	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	48.913	ENSCING00000005042	-	99	48.913	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	47.225	ENSCSAVG00000008623	-	94	54.182	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSCANG00000033070	TNPO3	100	99.135	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.811	ENSCGRG00001015925	Tnpo3	100	98.811	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.811	ENSCGRG00000010379	Tnpo3	100	98.811	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.973	ENSCSEG00000005952	tnpo3	100	84.973	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.297	ENSCVAG00000020285	tnpo3	100	85.297	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.405	ENSDARG00000045680	tnpo3	100	85.405	Danio_rerio
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSDNOG00000002556	TNPO3	100	99.135	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	62	97.237	ENSDORG00000002433	Tnpo3	95	97.237	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	42.320	FBgn0031456	Tnpo-SR	99	42.320	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000019578	TNPO3	95	99.121	ENSETEG00000002101	TNPO3	90	99.121	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	70.919	ENSEBUG00000016931	tnpo3	100	70.919	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.027	ENSEASG00005008677	TNPO3	100	99.027	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.027	ENSECAG00000012815	TNPO3	100	99.027	Equus_caballus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	92.994	ENSEEUG00000005178	TNPO3	98	92.994	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	61	32.701	ENSEEUG00000011681	IPO13	73	30.493	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	86.536	ENSELUG00000012153	tnpo3	99	86.536	Esox_lucius
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSFCAG00000018186	TNPO3	100	99.243	Felis_catus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	96	88.877	ENSFALG00000010667	TNPO3	100	88.877	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.297	ENSFHEG00000012859	tnpo3	100	85.297	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.973	ENSGMOG00000007324	tnpo3	100	84.973	Gadus_morhua
ENSFDAG00000019578	TNPO3	61	93.950	ENSGALG00000039420	TNPO3	98	93.950	Gallus_gallus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.405	ENSGACG00000000699	tnpo3	100	85.405	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	93	93.946	ENSGAGG00000006777	TNPO3	100	93.946	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSGGOG00000008339	TNPO3	100	99.135	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.514	ENSHBUG00000008351	tnpo3	100	85.514	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSHGLG00000004463	TNPO3	100	99.243	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSHGLG00100005509	TNPO3	100	99.243	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.649	ENSHCOG00000007221	tnpo3	100	84.649	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.757	ENSIPUG00000014979	TNPO3	99	84.757	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSSTOG00000004885	TNPO3	100	99.135	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	91.524	ENSJJAG00000013530	Tnpo3	100	91.524	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.730	ENSKMAG00000010497	tnpo3	100	85.730	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	96	81.356	ENSLBEG00000011988	-	99	81.356	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000019578	TNPO3	96	83.955	ENSLBEG00000016595	tnpo3	100	83.955	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000019578	TNPO3	84	90.270	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	90.270	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	87.351	ENSLOCG00000015556	tnpo3	100	87.351	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.708	ENSLAFG00000002738	TNPO3	100	98.708	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSMFAG00000032385	TNPO3	100	99.135	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSMMUG00000004311	TNPO3	100	99.135	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSMNEG00000045277	TNPO3	100	99.135	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSMLEG00000037881	TNPO3	100	99.135	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.838	ENSMAMG00000021096	tnpo3	100	85.838	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.514	ENSMZEG00005015084	tnpo3	100	85.514	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000019578	TNPO3	78	88.721	ENSMGAG00000002839	TNPO3	99	88.721	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.703	ENSMAUG00000013463	Tnpo3	100	98.703	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSMICG00000000140	TNPO3	100	99.243	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	68	35.659	ENSMICG00000011003	IPO13	77	33.136	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.811	ENSMOCG00000013264	Tnpo3	100	98.811	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.973	ENSMMOG00000005887	tnpo3	100	84.973	Mola_mola
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	96.973	ENSMODG00000014700	TNPO3	100	96.973	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.297	ENSMALG00000006675	tnpo3	100	85.297	Monopterus_albus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.703	MGP_CAROLIEiJ_G0028176	Tnpo3	100	98.703	Mus_caroli
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.703	ENSMUSG00000012535	Tnpo3	100	98.703	Mus_musculus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.595	MGP_PahariEiJ_G0021934	Tnpo3	100	98.595	Mus_pahari
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.595	MGP_SPRETEiJ_G0029176	Tnpo3	100	98.595	Mus_spretus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSMPUG00000006021	TNPO3	100	99.243	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	88.649	ENSMLUG00000000947	TNPO3	100	88.649	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSNGAG00000008722	Tnpo3	100	99.135	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.000	ENSNBRG00000019001	tnpo3	100	85.264	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	95.412	ENSNLEG00000012491	TNPO3	100	95.412	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000019578	TNPO3	92	80.305	ENSMEUG00000002445	TNPO3	91	80.305	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000019578	TNPO3	91	98.370	ENSOPRG00000006163	TNPO3	90	98.370	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000019578	TNPO3	98	98.783	ENSODEG00000012826	TNPO3	100	98.783	Octodon_degus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	85.730	ENSONIG00000007604	tnpo3	100	85.730	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	95	92.524	ENSOANG00000011451	TNPO3	100	92.524	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	99	95.283	ENSOCUG00000010105	TNPO3	99	95.283	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.216	ENSORLG00000029369	tnpo3	100	84.216	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.216	ENSORLG00020003464	tnpo3	100	84.216	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.324	ENSORLG00015002610	tnpo3	100	84.324	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	84.649	ENSOMEG00000021006	tnpo3	100	84.649	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.027	ENSOGAG00000015340	TNPO3	100	99.027	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.270	ENSOARG00000004026	TNPO3	100	98.270	Ovis_aries
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSPPAG00000034975	TNPO3	100	99.135	Pan_paniscus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSPPRG00000002050	TNPO3	100	99.243	Panthera_pardus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.243	ENSPTIG00000016167	TNPO3	100	99.243	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	99.135	ENSPTRG00000019676	TNPO3	100	99.135	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000019578	TNPO3	98	99.008	ENSPANG00000022226	TNPO3	99	99.008	Papio_anubis
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	80.280	ENSPKIG00000008628	-	100	80.280	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	83.459	ENSPKIG00000023234	tnpo3	100	83.459	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000019578	TNPO3	61	79.754	ENSPMGG00000009763	tnpo3	99	79.754	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000019578	TNPO3	100	98.703	ENSPEMG00000000422	Tnpo3	100	98.703	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000019578	TNPO3	95	72.203	ENSPMAG00000008621	tnpo3	100	72.203	Petromyzon_marinus
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