EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000019586 (Gene tree)
Gene ID: 104848204
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21088 bases
Position: chrKN123755.1:9839075-9860162
Accession: 104848204
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000012201	RRM_1	PF00076.22	5.6e-29	1	2
ENSFDAP00000012201	RRM_1	PF00076.22	5.6e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000024877	MSI1-201	1029	XM_010604055	ENSFDAP00000012201	328 (aa)	XP_010602357	-

Gene Model

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFDAG00000019586	MSI1	51	35.606	ENSFDAG00000004675	TARDBP	54	34.211
ENSFDAG00000019586	MSI1	57	39.744	ENSFDAG00000002891	-	51	39.744
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	68.807	ENSFDAG00000016118	MSI2	100	71.084
ENSFDAG00000019586	MSI1	50	40.000	ENSFDAG00000010106	-	55	40.000
ENSFDAG00000019586	MSI1	53	41.250	ENSFDAG00000001283	DAZAP1	52	40.741
ENSFDAG00000019586	MSI1	50	36.220	ENSFDAG00000020873	-	58	34.375

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSG00000135097	MSI1	98	99.695	Homo_sapiens
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.061	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSAPOG00000023458	-	94	85.061	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	81.053	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	81.053	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000019586	MSI1	96	81.587	ENSACIG00000017754	-	78	81.587	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	76.220	ENSAOCG00000009031	-	95	76.524	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.061	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSAPEG00000006857	-	79	85.061	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.061	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.756	ENSATEG00000017059	MSI1	95	84.756	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	82.067	ENSATEG00000023779	-	93	82.067	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	96.646	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.646	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSANAG00000027151	MSI1	98	99.695	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000019586	MSI1	80	95.833	ENSANAG00000027901	-	92	95.833	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSACLG00000000117	-	100	84.451	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSACLG00000011230	MSI1	94	84.451	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.537	ENSAMXG00000038960	msi1	76	83.537	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	99.695	Bos_taurus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCJAG00000008578	MSI1	98	99.695	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.390	ENSCAFG00000010283	MSI1	98	99.390	Canis_familiaris
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.678	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	99.678	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	93.731	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	93.731	Capra_hircus
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.694	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	99.694	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	89.457	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.457	Cavia_aperea
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	99.695	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCCAG00000035567	MSI1	98	99.695	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCATG00000030019	MSI1	98	99.695	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	99.695	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000019586	MSI1	72	95.473	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.473	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	95.732	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	95.732	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCANG00000040651	MSI1	100	99.695	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCGRG00001018883	Msi1	98	99.695	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSCGRG00000002191	Msi1	73	99.695	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	77.134	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.134	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.756	ENSCSEG00000005834	-	94	84.756	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.537	ENSCSEG00000008352	-	94	83.537	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000019586	MSI1	70	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	85.061	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	81.098	ENSDARG00000010710	msi1	100	84.581	Danio_rerio
ENSFDAG00000019586	MSI1	88	81.659	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	81.659	Danio_rerio
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	89.634	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.634	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSDORG00000005610	Msi1	93	99.695	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	95.427	ENSETEG00000004756	MSI1	100	95.427	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSEASG00005004736	MSI1	98	99.695	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSECAG00000017526	MSI1	98	99.695	Equus_caballus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	79.310	ENSELUG00000023219	MSI1	92	79.310	Esox_lucius
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	80.183	ENSELUG00000023280	-	100	79.878	Esox_lucius
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSFCAG00000011007	MSI1	98	99.695	Felis_catus
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	95.498	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.498	Ficedula_albicollis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSFHEG00000003560	-	94	85.061	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.366	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	85.366	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	76.524	ENSGMOG00000017838	-	90	76.524	Gadus_morhua
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	82.622	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	82.317	Gadus_morhua
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	94.872	ENSGALG00000007227	MSI1	96	85.994	Gallus_gallus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	68.085	ENSGAFG00000005860	-	89	68.085	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.451	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.841	ENSGACG00000012679	MSI1	94	83.841	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	80.793	ENSGACG00000008674	-	94	80.793	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	95.732	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	95.732	Gopherus_agassizii
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.682	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	99.682	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	84.451	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSHBUG00000011841	-	94	84.451	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	100.000	ENSHGLG00000012782	MSI1	98	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	100.000	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	79.878	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	79.878	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.537	ENSHCOG00000012067	-	89	83.537	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	82.927	ENSIPUG00000001976	msi1	99	79.268	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.678	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	82.622	ENSJJAG00000010643	-	94	82.317	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSJJAG00000010463	Msi1	98	99.695	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.146	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	84.146	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	82.622	ENSKMAG00000019877	-	100	82.622	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	84.451	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSLBEG00000001375	-	94	84.451	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	86.585	ENSLACG00000018287	MSI1	100	86.585	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	89.091	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	89.091	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	99.695	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	99.695	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSMNEG00000040034	MSI1	98	99.695	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	99.695	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.841	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	83.841	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSMAMG00000018426	-	94	85.061	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	84.451	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSMZEG00005000340	-	94	84.451	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000019586	MSI1	63	98.225	ENSMGAG00000016518	-	100	98.225	Meleagris_gallopavo
ENSFDAG00000019586	MSI1	70	99.563	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	99.563	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSMICG00000033181	MSI1	98	99.695	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.390	ENSMOCG00000002286	Msi1	98	99.390	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	75.000	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.000	Mola_mola
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	81.707	ENSMMOG00000012265	-	99	81.707	Mola_mola
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	67.674	ENSMODG00000003189	-	100	67.674	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSMALG00000017889	MSI1	94	84.451	Monopterus_albus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.146	ENSMALG00000001426	-	100	84.146	Monopterus_albus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.085	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	98	99.085	Mus_caroli
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.085	ENSMUSG00000054256	Msi1	98	99.085	Mus_musculus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	98.780	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	98.780	Mus_pahari
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.085	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	98	99.085	Mus_spretus
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.678	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	99.678	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	89.851	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	89.851	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	99.695	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000019586	MSI1	97	77.043	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.043	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSNBRG00000000841	-	94	84.451	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	89.329	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	89.329	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	77.744	ENSMEUG00000015759	MSI1	100	77.744	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000019586	MSI1	96	91.746	ENSOPRG00000016879	MSI1	100	91.746	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSODEG00000006328	MSI1	100	99.695	Octodon_degus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.756	ENSONIG00000019452	-	94	84.756	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.451	ENSONIG00000011182	MSI1	94	84.451	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.357	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	99.357	Oryctolagus_cuniculus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSORLG00000019978	-	94	85.061	Oryzias_latipes
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ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSORLG00020008266	MSI1	99	82.012	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSORLG00015013672	-	71	81.402	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSORLG00015003916	MSI1	99	82.012	Oryzias_latipes_hsok
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ENSFDAG00000019586	MSI1	100	91.463	ENSPSIG00000011608	-	93	91.463	Pelodiscus_sinensis
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ENSFDAG00000019586	MSI1	100	83.232	ENSPNAG00000019337	msi1	94	83.232	Pygocentrus_nattereri
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ENSFDAG00000019586	MSI1	100	99.695	ENSRROG00000041076	MSI1	93	99.695	Rhinopithecus_roxellana
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ENSFDAG00000019586	MSI1	100	81.098	ENSSLDG00000018706	-	96	82.371	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSFDAG00000019586	MSI1	90	80.519	ENSTRUG00000016249	MSI1	100	73.408	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	79.154	ENSTNIG00000011469	MSI1	94	79.154	Tetraodon_nigroviridis
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ENSFDAG00000019586	MSI1	100	91.489	ENSXETG00000012216	msi1	95	91.541	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	70.427	ENSXCOG00000017605	MSI1	89	70.427	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	ENSXMAG00000027103	MSI1	95	78.419	Xiphophorus_maculatus
ENSFDAG00000019586	MSI1	100	84.756	ENSXMAG00000018237	-	94	84.756	Xiphophorus_maculatus