EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFDAG00000021347 (Gene tree)
Gene ID: 104852142
Gene Symbol: SRRT
Alias: ARS2|Asr2|serrate
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Fukomys_damarensis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14121 bases
Position: chrKN121214.1:807556-821676
Accession: 104852142
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFDAP00000023122	ARS2	PF04959.13	5.4e-80	1	1
ENSFDAP00000023123	ARS2	PF04959.13	8.8e-80	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFDAT00000008956	SRRT-201	1428	-	ENSFDAP00000023123	475 (aa)	-	-
ENSFDAT00000027527	SRRT-202	2553	XM_010609669	ENSFDAP00000023122	850 (aa)	XP_010607971	-

Gene Model

Click here to download ENSFDAG00000021347's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFDAG00000021347's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.381	ENSG00000087087	SRRT	99	100.000	Homo_sapiens
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.316	ENSAPOG00000002304	srrt	54	69.048	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	90.607	ENSAMEG00000014506	SRRT	52	92.391	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.316	ENSACIG00000015795	srrt	85	72.845	Amphilophus_citrinellus
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	55.741	ENSAOCG00000009189	-	52	62.473	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.536	ENSAOCG00000009693	srrt	86	72.185	Amphiprion_ocellaris
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	55.741	ENSAPEG00000020016	-	52	62.473	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.095	ENSAPEG00000003646	srrt	85	71.983	Amphiprion_percula
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	54.415	ENSATEG00000003652	-	85	61.028	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.363	ENSATEG00000014425	srrt	85	71.018	Anabas_testudineus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	76.265	ENSACAG00000001014	SRRT	96	75.779	Anolis_carolinensis
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.224	ENSANAG00000031718	SRRT	100	93.379	Aotus_nancymaae
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	55.602	ENSACLG00000009423	-	52	61.171	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	67.991	ENSACLG00000013156	srrt	50	70.640	Astatotilapia_calliptera
ENSFDAG00000021347	SRRT	87	70.112	ENSAMXG00000016671	srrt	50	73.034	Astyanax_mexicanus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.056	ENSBTAG00000001134	SRRT	100	92.237	Bos_taurus
ENSFDAG00000021347	SRRT	73	44.503	WBGene00017085	E01A2.2	85	43.197	Caenorhabditis_elegans
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.757	ENSCJAG00000014917	SRRT	100	92.922	Callithrix_jacchus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.450	ENSCAFG00000023538	SRRT	100	93.600	Canis_familiaris
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	94.007	ENSCAFG00020013358	SRRT	100	94.145	Canis_lupus_dingo
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.407	ENSCHIG00000010495	SRRT	100	92.580	Capra_hircus
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	87.379	ENSTSYG00000036426	SRRT	99	89.784	Carlito_syrichta
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	94.782	ENSCAPG00000013586	SRRT	100	94.782	Cavia_aperea
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.185	ENSCPOG00000001739	SRRT	100	94.185	Cavia_porcellus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.224	ENSCCAG00000015877	SRRT	100	93.379	Cebus_capucinus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.662	ENSCATG00000036306	SRRT	100	93.807	Cercocebus_atys
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.406	ENSCLAG00000007568	SRRT	100	94.406	Chinchilla_lanigera
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSCSAG00000017996	SRRT	100	93.493	Chlorocebus_sabaeus
ENSFDAG00000021347	SRRT	69	85.119	ENSCHOG00000007815	SRRT	67	94.083	Choloepus_hoffmanni
ENSFDAG00000021347	SRRT	74	81.992	ENSCPBG00000011553	SRRT	83	81.955	Chrysemys_picta_bellii
ENSFDAG00000021347	SRRT	97	45.489	ENSCING00000003506	-	54	50.207	Ciona_intestinalis
ENSFDAG00000021347	SRRT	99	45.205	ENSCSAVG00000008394	-	81	54.039	Ciona_savignyi
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.779	ENSCANG00000034556	SRRT	100	93.922	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	91.725	ENSCGRG00001001594	Srrt	98	91.259	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	84.302	ENSCGRG00000007292	Srrt	98	83.372	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	55.741	ENSCSEG00000005233	-	54	57.391	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	67.735	ENSCSEG00000017878	srrt	50	67.277	Cynoglossus_semilaevis
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	63.879	ENSCVAG00000019848	srrt	96	63.120	Cyprinodon_variegatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	70.419	ENSDARG00000017762	srrt	51	73.731	Danio_rerio
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.224	ENSDNOG00000003851	SRRT	100	93.379	Dasypus_novemcinctus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	90.845	ENSDORG00000005584	Srrt	98	90.962	Dipodomys_ordii
ENSFDAG00000021347	SRRT	96	47.350	FBgn0033062	Ars2	67	54.545	Drosophila_melanogaster
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	84.061	ENSETEG00000016175	SRRT	82	92.208	Echinops_telfairi
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	58.388	ENSEBUG00000008517	-	76	63.889	Eptatretus_burgeri
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.991	ENSEASG00005016956	SRRT	100	93.151	Equus_asinus_asinus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.107	ENSECAG00000012292	SRRT	100	93.265	Equus_caballus
ENSFDAG00000021347	SRRT	82	97.321	ENSEEUG00000009117	SRRT	85	96.970	Erinaceus_europaeus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	63.616	ENSELUG00000006651	srrt	50	68.132	Esox_lucius
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	54.545	ENSELUG00000021216	-	53	61.538	Esox_lucius
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSFCAG00000006855	SRRT	100	93.493	Felis_catus
ENSFDAG00000021347	SRRT	90	65.359	ENSFHEG00000002756	srrt	89	71.358	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	53.222	ENSFHEG00000004105	-	93	53.030	Fundulus_heteroclitus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	59.977	ENSGMOG00000018619	srrt	51	70.246	Gadus_morhua
ENSFDAG00000021347	SRRT	85	56.335	ENSGMOG00000018694	-	53	55.856	Gadus_morhua
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	52.723	ENSGAFG00000020383	-	54	59.130	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.027	ENSGAFG00000005423	srrt	51	71.681	Gambusia_affinis
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	66.392	ENSGACG00000020387	srrt	51	71.209	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	52.990	ENSGACG00000001100	-	53	58.495	Gasterosteus_aculeatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.692	ENSGGOG00000001508	SRRT	99	93.836	Gorilla_gorilla
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.212	ENSHBUG00000002942	srrt	50	70.861	Haplochromis_burtoni
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	93.964	ENSHGLG00000008344	Srrt	100	93.964	Heterocephalus_glaber_female
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.839	ENSHGLG00100018857	Srrt	100	94.839	Heterocephalus_glaber_male
ENSFDAG00000021347	SRRT	89	55.098	ENSHCOG00000008904	-	56	58.079	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	62.194	ENSHCOG00000005403	srrt	52	68.958	Hippocampus_comes
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	63.027	ENSIPUG00000021150	srrt	51	73.068	Ictalurus_punctatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.151	ENSSTOG00000013776	SRRT	100	94.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.426	ENSJJAG00000010446	Srrt	98	92.544	Jaculus_jaculus
ENSFDAG00000021347	SRRT	94	65.833	ENSKMAG00000013599	srrt	54	71.239	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	55.444	ENSKMAG00000008468	-	53	60.127	Kryptolebias_marmoratus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.547	ENSLBEG00000016308	srrt	54	71.367	Labrus_bergylta
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	61.831	ENSLACG00000001089	SRRT	96	62.146	Latimeria_chalumnae
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	63.288	ENSLOCG00000013658	srrt	52	65.342	Lepisosteus_oculatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	90.070	ENSLAFG00000007725	SRRT	100	93.151	Loxodonta_africana
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.897	ENSMFAG00000033745	SRRT	100	94.037	Macaca_fascicularis
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSMMUG00000021255	SRRT	100	93.493	Macaca_mulatta
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSMNEG00000041864	SRRT	100	93.493	Macaca_nemestrina
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.897	ENSMLEG00000029479	SRRT	100	94.037	Mandrillus_leucophaeus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.293	ENSMAMG00000014311	srrt	51	71.619	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	56.224	ENSMAMG00000010681	-	52	62.039	Mastacembelus_armatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	55.602	ENSMZEG00005028002	-	52	61.171	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	67.991	ENSMZEG00005016135	srrt	50	70.640	Maylandia_zebra
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	91.472	ENSMAUG00000011386	Srrt	98	90.654	Mesocricetus_auratus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.692	ENSMICG00000009471	SRRT	98	93.224	Microcebus_murinus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	91.355	ENSMOCG00000001971	Srrt	100	92.009	Microtus_ochrogaster
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	64.149	ENSMMOG00000016399	srrt	54	74.330	Mola_mola
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	59.081	ENSMMOG00000011137	-	55	62.256	Mola_mola
ENSFDAG00000021347	SRRT	89	80.679	ENSMODG00000004862	SRRT	90	83.966	Monodelphis_domestica
ENSFDAG00000021347	SRRT	99	50.520	ENSMALG00000005567	-	84	51.716	Monopterus_albus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.080	ENSMALG00000018604	srrt	53	71.652	Monopterus_albus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.781	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	100	92.237	Mus_caroli
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.781	ENSMUSG00000037364	Srrt	100	92.237	Mus_musculus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.781	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	100	92.237	Mus_pahari
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.781	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	100	92.237	Mus_spretus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.224	ENSMPUG00000015839	SRRT	100	93.379	Mustela_putorius_furo
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.640	ENSMLUG00000009975	SRRT	100	92.808	Myotis_lucifugus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	91.822	ENSNGAG00000023715	Srrt	100	92.580	Nannospalax_galili
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.374	ENSNBRG00000019100	srrt	52	70.889	Neolamprologus_brichardi
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	84.140	ENSNLEG00000011987	SRRT	99	82.051	Nomascus_leucogenys
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	71.995	ENSMEUG00000011941	SRRT	98	69.778	Notamacropus_eugenii
ENSFDAG00000021347	SRRT	80	87.500	ENSOPRG00000002502	-	67	100.000	Ochotona_princeps
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	95.607	ENSODEG00000016856	SRRT	100	95.607	Octodon_degus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.433	ENSONIG00000004242	srrt	52	69.913	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000021347	SRRT	93	56.289	ENSONIG00000016080	-	52	60.907	Oreochromis_niloticus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	65.560	ENSORLG00000008120	srrt	52	70.575	Oryzias_latipes
ENSFDAG00000021347	SRRT	96	64.118	ENSORLG00020003058	srrt	52	70.354	Oryzias_latipes_hni
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	65.353	ENSORLG00015008062	srrt	52	70.354	Oryzias_latipes_hsok
ENSFDAG00000021347	SRRT	96	64.085	ENSOMEG00000003155	srrt	56	70.796	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	55.501	ENSOMEG00000006963	-	53	62.309	Oryzias_melastigma
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.808	ENSOGAG00000017242	SRRT	98	93.341	Otolemur_garnettii
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.958	ENSOARG00000015645	SRRT	100	93.119	Ovis_aries
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.266	ENSPPAG00000041090	SRRT	100	94.266	Pan_paniscus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.310	ENSPPRG00000009557	SRRT	100	93.463	Panthera_pardus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.224	ENSPTIG00000014355	SRRT	100	93.379	Panthera_tigris_altaica
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	94.266	ENSPTRG00000019511	SRRT	100	94.266	Pan_troglodytes
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	92.289	ENSPANG00000020763	SRRT	98	90.930	Papio_anubis
ENSFDAG00000021347	SRRT	94	66.423	ENSPKIG00000022212	-	52	73.451	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000021347	SRRT	96	67.343	ENSPKIG00000005434	srrt	54	73.134	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	76.517	ENSPSIG00000016311	SRRT	96	78.872	Pelodiscus_sinensis
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	66.594	ENSPMGG00000002841	srrt	56	69.197	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	92.663	ENSPEMG00000010834	Srrt	98	92.426	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFDAG00000021347	SRRT	99	55.086	ENSPMAG00000009614	-	55	61.311	Petromyzon_marinus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	87.921	ENSPCIG00000000816	SRRT	98	86.760	Phascolarctos_cinereus
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	52.351	ENSPFOG00000016554	-	54	59.348	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.316	ENSPFOG00000005704	srrt	51	71.965	Poecilia_formosa
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	52.163	ENSPLAG00000004526	-	55	59.002	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	63.133	ENSPLAG00000021992	srrt	51	72.383	Poecilia_latipinna
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.874	ENSPMEG00000001182	srrt	85	70.897	Poecilia_mexicana
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	63.679	ENSPREG00000022308	srrt	51	71.965	Poecilia_reticulata
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	83.447	ENSPPYG00000017432	SRRT	100	83.447	Pongo_abelii
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	88.657	ENSPCAG00000001621	SRRT	100	88.914	Procavia_capensis
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.692	ENSPCOG00000025751	SRRT	98	93.224	Propithecus_coquereli
ENSFDAG00000021347	SRRT	90	80.679	ENSPVAG00000000834	SRRT	100	84.265	Pteropus_vampyrus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	67.991	ENSPNYG00000018710	srrt	52	70.640	Pundamilia_nyererei
ENSFDAG00000021347	SRRT	94	60.626	ENSPNAG00000010629	srrt	70	72.289	Pygocentrus_nattereri
ENSFDAG00000021347	SRRT	90	81.046	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	93	80.174	Rattus_norvegicus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSRBIG00000035718	SRRT	100	93.493	Rhinopithecus_bieti
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSRROG00000030622	SRRT	100	93.493	Rhinopithecus_roxellana
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.224	ENSSBOG00000033570	SRRT	100	93.379	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	81.179	ENSSHAG00000007349	-	100	81.260	Sarcophilus_harrisii
ENSFDAG00000021347	SRRT	89	72.967	ENSSFOG00015017293	srrt	51	76.264	Scleropages_formosus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	62.840	ENSSMAG00000015342	srrt	54	71.397	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	54.095	ENSSMAG00000018195	-	87	58.621	Scophthalmus_maximus
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	56.027	ENSSDUG00000002051	-	93	57.044	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.469	ENSSDUG00000012049	srrt	53	72.345	Seriola_dumerili
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.248	ENSSLDG00000017477	srrt	81	73.707	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFDAG00000021347	SRRT	84	59.036	ENSSPAG00000018943	-	93	55.142	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	68.202	ENSSPAG00000005665	srrt	51	70.833	Stegastes_partitus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	90.678	ENSSSCG00000024789	SRRT	99	90.678	Sus_scrofa
ENSFDAG00000021347	SRRT	96	61.727	ENSTRUG00000016075	srrt	52	70.130	Takifugu_rubripes
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	65.812	ENSTNIG00000011779	srrt	72	70.299	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000021347	SRRT	94	52.977	ENSTNIG00000003111	-	53	58.606	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000021347	SRRT	68	57.988	ENSTNIG00000019765	-	95	64.038	Tetraodon_nigroviridis
ENSFDAG00000021347	SRRT	84	91.599	ENSTBEG00000005212	SRRT	63	96.382	Tupaia_belangeri
ENSFDAG00000021347	SRRT	100	92.237	ENSTTRG00000011104	SRRT	100	92.580	Tursiops_truncatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	95	93.182	ENSUAMG00000027997	SRRT	98	93.182	Ursus_americanus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.341	ENSUMAG00000011295	SRRT	100	93.493	Ursus_maritimus
ENSFDAG00000021347	SRRT	98	93.450	ENSVVUG00000023572	SRRT	100	93.600	Vulpes_vulpes
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	67.241	ENSXETG00000025124	srrt	84	71.336	Xenopus_tropicalis
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	50.922	ENSXCOG00000013105	-	90	51.515	Xiphophorus_couchianus
ENSFDAG00000021347	SRRT	92	52.664	ENSXMAG00000002090	-	54	59.607	Xiphophorus_maculatus
ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.469	ENSXMAG00000007627	srrt	56	71.711	Xiphophorus_maculatus