EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000002756 (Gene tree)
Gene ID: 105929344
Gene Symbol: srrt
Alias: CHUNP6881|ars2|zgc:92060
Full Name: serrate%2C RNA effector molecule
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10184 bases
Position: chrKN811338.1:1251021-1261204
Accession: 105929344
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000001968	ARS2	PF04959.13	2.9e-88	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000012997	-	2211	XM_021318800	ENSFHEP00000001968	736 (aa)	XP_021174475	-

Gene Model

Click here to download ENSFHEG00000002756's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFHEG00000002756's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000002756	srrt	54	62.315	ENSFHEG00000004105	-	82	61.330

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSG00000087087	SRRT	98	87.097	Homo_sapiens
ENSFHEG00000002756	srrt	90	93.651	ENSAPOG00000002304	srrt	79	93.651	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.225	ENSAMEG00000014506	SRRT	71	76.225	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000002756	srrt	94	71.521	ENSACIG00000015795	srrt	84	89.157	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	93.651	ENSAOCG00000009693	srrt	81	89.398	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000002756	srrt	82	66.093	ENSAOCG00000009189	-	71	67.076	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000002756	srrt	90	93.254	ENSAPEG00000003646	srrt	95	78.590	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000002756	srrt	82	66.093	ENSAPEG00000020016	-	71	67.076	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000002756	srrt	90	91.667	ENSATEG00000014425	srrt	81	91.667	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000002756	srrt	54	65.617	ENSATEG00000003652	-	76	66.586	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000002756	srrt	85	76.108	ENSACAG00000001014	SRRT	73	76.108	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSANAG00000031718	SRRT	74	74.672	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000002756	srrt	82	66.667	ENSACLG00000009423	-	73	66.256	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000002756	srrt	90	91.270	ENSACLG00000013156	srrt	73	91.270	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000002756	srrt	86	84.848	ENSAMXG00000016671	srrt	71	84.716	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.163	ENSBTAG00000001134	SRRT	74	74.163	Bos_taurus
ENSFHEG00000002756	srrt	67	40.143	WBGene00017085	E01A2.2	88	38.897	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSCJAG00000014917	SRRT	74	74.672	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSCAFG00000023538	SRRT	74	74.672	Canis_familiaris
ENSFHEG00000002756	srrt	91	76.866	ENSCAFG00020013358	SRRT	77	74.458	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000002756	srrt	88	74.458	ENSCHIG00000010495	SRRT	74	74.163	Capra_hircus
ENSFHEG00000002756	srrt	88	74.458	ENSTSYG00000036426	SRRT	77	74.458	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000002756	srrt	88	75.735	ENSCAPG00000013586	SRRT	91	67.653	Cavia_aperea
ENSFHEG00000002756	srrt	89	73.986	ENSCPOG00000001739	SRRT	74	74.672	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSCCAG00000015877	SRRT	74	74.672	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSCATG00000036306	SRRT	75	74.236	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.163	ENSCLAG00000007568	SRRT	82	73.508	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSCSAG00000017996	SRRT	74	74.402	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000002756	srrt	52	75.847	ENSCHOG00000007815	SRRT	55	75.847	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000002756	srrt	82	74.123	ENSCPBG00000011553	SRRT	78	71.616	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000002756	srrt	91	51.852	ENSCING00000003506	-	65	51.613	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000002756	srrt	93	52.970	ENSCSAVG00000008394	-	91	48.142	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSCANG00000034556	SRRT	74	74.699	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.293	ENSCGRG00001001594	Srrt	74	75.546	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000002756	srrt	75	81.699	ENSCGRG00000007292	Srrt	90	67.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000002756	srrt	97	81.295	ENSCSEG00000017878	srrt	79	81.323	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000002756	srrt	80	64.398	ENSCSEG00000005233	-	72	64.865	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000002756	srrt	90	95.257	ENSCVAG00000019848	srrt	80	95.257	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000002756	srrt	79	66.142	ENSCVAG00000017344	-	74	66.142	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000002756	srrt	87	85.714	ENSDARG00000017762	srrt	72	85.590	Danio_rerio
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.000	ENSDNOG00000003851	SRRT	74	74.402	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	75.362	ENSDORG00000005584	Srrt	80	74.879	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000002756	srrt	96	49.237	FBgn0033062	Ars2	68	50.108	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000002756	srrt	81	71.362	ENSETEG00000016175	SRRT	65	72.727	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000002756	srrt	74	51.311	ENSEBUG00000008517	-	58	61.614	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSEASG00005016956	SRRT	74	74.672	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSECAG00000012292	SRRT	74	74.672	Equus_caballus
ENSFHEG00000002756	srrt	77	77.083	ENSEEUG00000009117	SRRT	60	92.593	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	86.694	ENSELUG00000006651	srrt	73	86.585	Esox_lucius
ENSFHEG00000002756	srrt	84	66.905	ENSELUG00000021216	-	72	66.518	Esox_lucius
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSFCAG00000006855	SRRT	74	74.672	Felis_catus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	71.358	ENSFDAG00000021347	SRRT	90	65.359	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000002756	srrt	90	81.569	ENSGMOG00000018619	srrt	74	79.167	Gadus_morhua
ENSFHEG00000002756	srrt	73	67.734	ENSGMOG00000018694	-	68	67.079	Gadus_morhua
ENSFHEG00000002756	srrt	85	63.235	ENSGAFG00000020383	-	79	63.725	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000002756	srrt	90	94.841	ENSGAFG00000005423	srrt	76	94.841	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000002756	srrt	90	89.764	ENSGACG00000020387	srrt	76	89.683	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000002756	srrt	82	65.385	ENSGACG00000001100	-	73	65.534	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSGGOG00000001508	SRRT	74	74.699	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000002756	srrt	90	91.270	ENSHBUG00000002942	srrt	73	91.270	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000002756	srrt	89	73.571	ENSHGLG00000008344	Srrt	91	67.089	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.458	ENSHGLG00100018857	Srrt	90	68.017	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000002756	srrt	84	63.591	ENSHCOG00000008904	-	76	64.352	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000002756	srrt	93	84.727	ENSHCOG00000005403	srrt	82	84.252	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000002756	srrt	87	80.387	ENSIPUG00000021150	srrt	75	80.145	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSSTOG00000013776	SRRT	74	74.699	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.225	ENSJJAG00000010446	Srrt	90	68.443	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000002756	srrt	82	64.846	ENSKMAG00000008468	-	75	65.083	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	89.683	ENSKMAG00000013599	srrt	80	89.683	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000002756	srrt	51	67.241	ENSLBEG00000028983	-	63	67.241	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000002756	srrt	97	86.842	ENSLBEG00000016308	srrt	87	87.081	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000002756	srrt	87	75.417	ENSLACG00000001089	SRRT	76	77.632	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000002756	srrt	69	82.663	ENSLOCG00000013658	srrt	70	83.282	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSLAFG00000007725	SRRT	74	74.672	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSMFAG00000033745	SRRT	77	74.236	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSMMUG00000021255	SRRT	74	74.402	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSMNEG00000041864	SRRT	75	74.236	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSMLEG00000029479	SRRT	76	74.236	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	91.667	ENSMAMG00000014311	srrt	76	91.667	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000002756	srrt	85	67.157	ENSMAMG00000010681	-	74	67.402	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	91.270	ENSMZEG00005016135	srrt	73	91.270	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000002756	srrt	82	66.667	ENSMZEG00005028002	-	73	66.256	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.862	ENSMAUG00000011386	Srrt	91	67.932	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSMICG00000009471	SRRT	76	74.672	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.293	ENSMOCG00000001971	Srrt	91	68.565	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000002756	srrt	90	92.857	ENSMMOG00000016399	srrt	80	92.857	Mola_mola
ENSFHEG00000002756	srrt	74	67.407	ENSMMOG00000011137	-	65	66.998	Mola_mola
ENSFHEG00000002756	srrt	54	70.784	ENSMODG00000004862	SRRT	80	71.496	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000002756	srrt	65	47.885	ENSMALG00000005567	-	100	48.269	Monopterus_albus
ENSFHEG00000002756	srrt	84	85.167	ENSMALG00000018604	srrt	78	81.643	Monopterus_albus
ENSFHEG00000002756	srrt	88	76.225	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	99	72.761	Mus_caroli
ENSFHEG00000002756	srrt	88	76.225	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	72.761	Mus_musculus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.293	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	99	72.761	Mus_pahari
ENSFHEG00000002756	srrt	88	76.225	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	99	72.761	Mus_spretus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSMPUG00000015839	SRRT	74	74.672	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.862	ENSMLUG00000009975	SRRT	74	75.109	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSNGAG00000023715	Srrt	74	77.869	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000002756	srrt	91	89.818	ENSNBRG00000019100	srrt	75	89.683	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000002756	srrt	88	67.315	ENSNLEG00000011987	SRRT	76	72.811	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000002756	srrt	89	61.151	ENSMEUG00000011941	SRRT	72	64.055	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000002756	srrt	72	74.242	ENSOPRG00000002502	-	67	75.758	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.980	ENSODEG00000016856	SRRT	90	68.017	Octodon_degus
ENSFHEG00000002756	srrt	82	67.883	ENSONIG00000016080	-	73	66.423	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000002756	srrt	88	92.116	ENSONIG00000004242	srrt	75	92.116	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000002756	srrt	93	89.011	ENSORLG00000008120	srrt	76	88.492	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000002756	srrt	93	88.645	ENSORLG00020003058	srrt	76	88.095	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000002756	srrt	93	89.011	ENSORLG00015008062	srrt	76	88.492	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000002756	srrt	93	88.278	ENSOMEG00000003155	srrt	95	77.124	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000002756	srrt	87	67.734	ENSOMEG00000006963	-	77	67.079	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSOGAG00000017242	SRRT	74	75.109	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.000	ENSOARG00000015645	SRRT	74	74.458	Ovis_aries
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSPPAG00000041090	SRRT	75	74.672	Pan_paniscus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSPPRG00000009557	SRRT	73	74.672	Panthera_pardus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSPTIG00000014355	SRRT	74	74.672	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.699	ENSPTRG00000019511	SRRT	76	73.272	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000002756	srrt	88	72.770	ENSPANG00000020763	SRRT	75	74.236	Papio_anubis
ENSFHEG00000002756	srrt	97	79.562	ENSPKIG00000005434	srrt	84	78.261	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000002756	srrt	84	80.049	ENSPKIG00000022212	-	74	80.049	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000002756	srrt	85	75.109	ENSPSIG00000016311	SRRT	73	74.877	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000002756	srrt	91	89.057	ENSPMGG00000002841	srrt	82	85.036	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	76.724	ENSPEMG00000010834	Srrt	85	71.854	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000002756	srrt	86	62.411	ENSPMAG00000009614	-	75	62.676	Petromyzon_marinus
ENSFHEG00000002756	srrt	88	72.381	ENSPCIG00000000816	SRRT	73	74.236	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	96.032	ENSPFOG00000005704	srrt	76	96.032	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000002756	srrt	85	64.461	ENSPFOG00000016554	-	79	64.706	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000002756	srrt	90	96.032	ENSPLAG00000021992	srrt	75	96.032	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000002756	srrt	85	64.059	ENSPLAG00000004526	-	78	64.303	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000002756	srrt	90	95.635	ENSPMEG00000001182	srrt	79	95.370	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000002756	srrt	80	64.481	ENSPMEG00000001520	-	78	63.377	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000002756	srrt	90	96.032	ENSPREG00000022308	srrt	76	96.032	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000002756	srrt	89	68.679	ENSPPYG00000017432	SRRT	72	74.672	Pongo_abelii
ENSFHEG00000002756	srrt	89	72.877	ENSPCAG00000001621	SRRT	74	74.561	Procavia_capensis
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSPCOG00000025751	SRRT	74	74.672	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000002756	srrt	61	72.911	ENSPVAG00000000834	SRRT	69	72.911	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	91.270	ENSPNYG00000018710	srrt	76	91.270	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000002756	srrt	76	87.975	ENSPNAG00000010629	srrt	67	87.821	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000002756	srrt	53	68.395	ENSRNOG00000048277	AABR07035787.1	82	68.227	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSRBIG00000035718	SRRT	75	74.236	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSRROG00000030622	SRRT	76	74.236	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000002756	srrt	89	74.402	ENSSBOG00000033570	SRRT	75	74.699	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000002756	srrt	54	72.275	ENSSHAG00000007349	-	66	72.512	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000002756	srrt	87	84.367	ENSSFOG00015017293	srrt	74	84.367	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	90.873	ENSSMAG00000015342	srrt	80	90.873	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000002756	srrt	70	69.231	ENSSMAG00000018195	-	74	62.559	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000002756	srrt	53	60.250	ENSSDUG00000002051	-	95	53.503	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000002756	srrt	90	93.651	ENSSDUG00000012049	srrt	78	93.651	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000002756	srrt	90	93.254	ENSSLDG00000017477	srrt	79	93.254	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000002756	srrt	74	66.474	ENSSPAG00000018943	-	81	63.636	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000002756	srrt	90	93.254	ENSSPAG00000005665	srrt	75	93.254	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000002756	srrt	88	74.699	ENSSSCG00000024789	SRRT	77	74.699	Sus_scrofa
ENSFHEG00000002756	srrt	93	87.591	ENSTRUG00000016075	srrt	76	86.166	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000002756	srrt	79	64.398	ENSTRUG00000000023	-	73	63.255	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000002756	srrt	65	82.436	ENSTNIG00000011779	srrt	76	82.436	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000002756	srrt	85	64.493	ENSTNIG00000003111	-	73	64.146	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000002756	srrt	63	78.723	ENSTBEG00000005212	SRRT	52	78.723	Tupaia_belangeri
ENSFHEG00000002756	srrt	90	75.093	ENSTTRG00000011104	SRRT	74	74.402	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000002756	srrt	85	75.109	ENSUAMG00000027997	SRRT	76	74.672	Ursus_americanus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSUMAG00000011295	SRRT	74	74.672	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000002756	srrt	86	75.431	ENSVVUG00000023572	SRRT	74	74.672	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000002756	srrt	78	75.843	ENSXETG00000025124	srrt	66	75.796	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000002756	srrt	51	59.151	ENSXCOG00000013105	-	85	60.363	Xiphophorus_couchianus
ENSFHEG00000002756	srrt	93	95.238	ENSXMAG00000007627	srrt	95	79.112	Xiphophorus_maculatus
ENSFHEG00000002756	srrt	82	64.039	ENSXMAG00000002090	-	75	65.356	Xiphophorus_maculatus