EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000004334 (Gene tree)
Gene ID: 105930668
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 54765 bases
Position: chrKN811357.1:690285-745049
Accession: 105930668
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000003452	MIF4G	PF02854.19	3.6e-25	1	1
ENSFHEP00000023359	MIF4G	PF02854.19	3.6e-25	1	1
ENSFHEP00000023371	MIF4G	PF02854.19	3.6e-25	1	1
ENSFHEP00000003423	MIF4G	PF02854.19	1.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000010509	-	2529	XM_012868989	ENSFHEP00000023371	705 (aa)	XP_012724443	A0A146NPG9
ENSFHET00000010518	-	2381	XM_021319690	ENSFHEP00000003452	705 (aa)	XP_021175365	A0A146NPG9
ENSFHET00000010565	-	1737	-	ENSFHEP00000003423	578 (aa)	-	-
ENSFHET00000010532	-	2953	XM_021319689	ENSFHEP00000023359	705 (aa)	XP_021175364	A0A146NPG9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.374	ENSG00000134030	CTIF	100	59.712	Homo_sapiens
ENSFHEG00000004334	ctif	92	83.880	ENSAPOG00000020192	ctif	100	80.645	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000004334	ctif	87	56.250	ENSAMEG00000006759	CTIF	78	56.496	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000004334	ctif	99	90.385	ENSACIG00000017099	ctif	100	78.200	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	76.771	ENSAOCG00000014275	ctif	100	77.054	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000004334	ctif	100	82.062	ENSAPEG00000016975	ctif	100	82.203	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	ENSATEG00000016752	ctif	100	79.520	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000004334	ctif	98	89.583	ENSACAG00000018006	CTIF	87	89.583	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.933	ENSANAG00000024925	CTIF	99	57.143	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	ENSACLG00000005956	ctif	100	79.915	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000004334	ctif	51	62.634	ENSAMXG00000015964	ctif	100	61.964	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000004334	ctif	89	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.772	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	55.974	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000004334	ctif	97	55.464	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	56.331	Canis_familiaris
ENSFHEG00000004334	ctif	97	55.464	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	56.331	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.040	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	55.233	Capra_hircus
ENSFHEG00000004334	ctif	89	55.744	ENSTSYG00000030461	CTIF	95	55.977	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000004334	ctif	99	53.115	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	53.300	Cavia_aperea
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.255	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	55.609	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.585	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	56.792	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.212	ENSCATG00000038134	CTIF	98	65.823	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.863	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	56.607	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.766	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	55.962	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000004334	ctif	98	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	98	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.352	ENSCANG00000030916	CTIF	99	57.087	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	58.333	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	58.553	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.488	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	54.675	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000004334	ctif	100	83.051	ENSCSEG00000019857	ctif	100	76.578	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000004334	ctif	100	91.525	ENSCVAG00000017158	ctif	100	87.960	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	63.764	ENSDARG00000090617	ctif	100	65.638	Danio_rerio
ENSFHEG00000004334	ctif	74	56.278	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	56.561	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.375	ENSDORG00000003221	Ctif	99	55.375	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000004334	ctif	79	87.500	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.935	ENSECAG00000020473	CTIF	99	56.137	Equus_caballus
ENSFHEG00000004334	ctif	85	56.189	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	56.436	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	88.462	ENSELUG00000008733	ctif	90	88.462	Esox_lucius
ENSFHEG00000004334	ctif	89	87.500	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSFHEG00000004334	ctif	96	56.566	ENSFALG00000008943	CTIF	98	56.661	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.662	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	55.859	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000004334	ctif	98	89.583	ENSGALG00000035912	-	98	89.583	Gallus_gallus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	93.220	ENSGAFG00000011896	ctif	97	93.220	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000004334	ctif	70	53.606	ENSGAGG00000020663	CTIF	91	58.098	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.189	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	57.398	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	ENSHBUG00000018092	ctif	100	80.057	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.301	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	56.507	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.301	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	56.507	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000004334	ctif	99	61.398	ENSHCOG00000011784	ctif	98	67.624	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000004334	ctif	97	95.122	ENSIPUG00000014050	ctif	85	84.000	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.954	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	56.281	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.886	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	55.008	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	78.562	ENSKMAG00000014651	ctif	100	78.867	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	77.217	ENSLBEG00000018277	ctif	99	76.125	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000004334	ctif	99	90.000	ENSLOCG00000011697	ctif	88	90.000	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	50.935	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	75.000	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.212	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	65.823	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.212	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	65.823	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.212	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	65.823	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.027	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	65.823	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	94.000	ENSMAMG00000014741	ctif	90	94.000	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000004334	ctif	89	84.746	ENSMZEG00005019767	ctif	90	78.110	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000004334	ctif	87	40.073	ENSMGAG00000001378	CTIF	65	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.913	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	57.120	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.678	ENSMICG00000010167	CTIF	99	57.213	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.236	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	57.447	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000004334	ctif	98	97.727	ENSMMOG00000000831	ctif	89	97.727	Mola_mola
ENSFHEG00000004334	ctif	99	52.836	ENSMODG00000003464	CTIF	99	53.018	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000004334	ctif	88	67.704	ENSMALG00000020553	ctif	100	78.205	Monopterus_albus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.189	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	55.380	Mus_caroli
ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.859	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	55.047	Mus_musculus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.259	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	57.471	Mus_pahari
ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.773	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.352	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	56.557	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.169	ENSMLUG00000003025	CTIF	99	56.373	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.678	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	56.885	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	ENSNBRG00000008679	ctif	100	75.530	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.189	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	57.398	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000004334	ctif	99	50.484	ENSMEUG00000000218	CTIF	85	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.954	ENSOPRG00000003558	CTIF	99	56.158	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000004334	ctif	99	54.259	ENSODEG00000018390	CTIF	99	53.943	Octodon_degus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	75.581	ENSONIG00000007750	ctif	100	75.914	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000004334	ctif	88	49.826	ENSOANG00000001337	CTIF	99	50.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.209	ENSOCUG00000024842	CTIF	99	56.414	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	77.856	ENSORLG00000005786	ctif	100	77.856	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000004334	ctif	100	76.945	ENSORLG00020005385	ctif	100	76.945	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000004334	ctif	100	77.292	ENSORLG00015011872	ctif	100	77.292	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000004334	ctif	100	77.935	ENSOMEG00000007917	ctif	100	77.935	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.772	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	56.078	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.149	ENSOARG00000003754	CTIF	99	56.352	Ovis_aries
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.189	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	65.823	Pan_paniscus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.515	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	56.515	Panthera_pardus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.979	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	56.979	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.189	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	65.823	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.027	ENSPANG00000017087	CTIF	98	65.823	Papio_anubis
ENSFHEG00000004334	ctif	88	57.480	ENSPKIG00000011234	ctif	98	62.887	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000004334	ctif	89	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000004334	ctif	99	88.462	ENSPMGG00000022958	ctif	100	69.859	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.981	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	57.190	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000004334	ctif	77	56.114	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	60.725	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	ENSPFOG00000009243	ctif	100	89.972	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	ENSPLAG00000019171	ctif	100	90.113	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	ENSPMEG00000020089	ctif	100	90.113	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000004334	ctif	100	94.915	ENSPREG00000017326	ctif	100	87.006	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000004334	ctif	88	57.915	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	58.171	Pongo_abelii
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.096	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	57.307	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.699	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	56.579	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	84.746	ENSPNYG00000007879	ctif	99	81.425	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000004334	ctif	98	86.000	ENSPNAG00000029174	ctif	100	64.888	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.444	ENSRNOG00000018342	Ctif	99	56.650	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.704	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	56.911	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000004334	ctif	99	56.543	ENSRROG00000006039	CTIF	99	56.748	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000004334	ctif	99	58.516	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	58.744	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000004334	ctif	99	53.125	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	53.311	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000004334	ctif	98	90.000	ENSSFOG00015022594	ctif	99	64.448	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	86.441	ENSSMAG00000005707	ctif	100	79.349	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	79.473	ENSSDUG00000016033	ctif	100	80.444	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000004334	ctif	100	73.285	ENSSLDG00000007282	ctif	100	78.955	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000004334	ctif	99	57.947	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	57.956	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	73.544	ENSSPAG00000003721	ctif	100	73.710	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.155	ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.354	Sus_scrofa
ENSFHEG00000004334	ctif	99	50.611	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	54.502	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000004334	ctif	59	66.474	ENSTRUG00000002320	ctif	99	69.942	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000004334	ctif	99	65.837	ENSTNIG00000018763	ctif	96	70.801	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000004334	ctif	75	87.500	ENSTBEG00000002613	CTIF	70	87.500	Tupaia_belangeri
ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.863	ENSTTRG00000004347	CTIF	99	56.066	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000004334	ctif	84	54.839	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	55.067	Ursus_americanus
ENSFHEG00000004334	ctif	89	87.500	ENSUMAG00000002735	CTIF	98	87.500	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000004334	ctif	87	87.500	ENSVVUG00000014347	CTIF	98	85.417	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000004334	ctif	96	44.595	ENSXETG00000026836	ctif	77	67.176	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000004334	ctif	67	80.357	ENSXCOG00000002477	ctif	89	84.864	Xiphophorus_couchianus
ENSFHEG00000004334	ctif	100	88.136	ENSXMAG00000004236	ctif	100	88.418	Xiphophorus_maculatus