EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000007238 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11486 bases
Position: chrKN811291.1:2426195-2437680
Accession: 105925925
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000025100	SYF2	PF08231.12	5.4e-55	1	1
ENSFHEP00000025095	SYF2	PF08231.12	6.6e-55	1	1
ENSFHEP00000006040	SYF2	PF08231.12	1.1e-49	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000006177	-	672	XM_021316194	ENSFHEP00000006040	223 (aa)	XP_021171869	-
ENSFHET00000006075	-	672	-	ENSFHEP00000025100	223 (aa)	-	-
ENSFHET00000006091	-	720	-	ENSFHEP00000025095	239 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSFHEG00000007238's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFHEG00000007238's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	ENSG00000117614	SYF2	90	67.273	Homo_sapiens
ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.130	ENSAPOG00000001174	syf2	95	76.991	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000007238	syf2	70	79.487	ENSAMEG00000010134	-	82	78.750	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.818	ENSAMEG00000010115	-	90	66.818	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	ENSACIG00000023688	syf2	90	76.991	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000007238	syf2	92	75.120	ENSAOCG00000010912	syf2	65	75.120	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	ENSAOCG00000022046	syf2	96	76.991	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	ENSAPEG00000018858	syf2	87	76.991	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000007238	syf2	96	77.523	ENSATEG00000007745	syf2	95	77.434	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000007238	syf2	89	67.662	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	67.662	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000007238	syf2	91	66.829	ENSACAG00000013653	-	100	66.829	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000007238	syf2	72	67.702	ENSACAG00000026777	-	96	67.702	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	ENSANAG00000032473	SYF2	90	67.727	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.578	ENSACLG00000019916	syf2	95	77.434	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000007238	syf2	99	72.000	ENSAMXG00000004051	syf2	94	72.000	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.265	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	67.265	Bos_taurus
ENSFHEG00000007238	syf2	92	43.128	WBGene00019402	syf-2	90	42.453	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	67.727	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	62.212	ENSCAFG00000030331	-	92	62.212	Canis_familiaris
ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.820	ENSCAFG00000012895	-	89	66.818	Canis_familiaris
ENSFHEG00000007238	syf2	71	77.987	ENSCAFG00020021094	-	84	77.987	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.820	ENSCAFG00020021091	-	89	66.818	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.816	ENSCHIG00000020874	SYF2	92	66.816	Capra_hircus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.071	ENSTSYG00000005114	SYF2	92	66.071	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000007238	syf2	88	65.829	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	65.829	Cavia_aperea
ENSFHEG00000007238	syf2	97	68.182	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	68.182	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	67.727	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSCATG00000026917	SYF2	90	66.364	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	ENSCLAG00000008474	SYF2	91	67.411	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	66.364	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000007238	syf2	71	55.696	ENSCHOG00000005273	-	89	55.844	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.750	ENSCPBG00000025073	SYF2	90	68.750	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000007238	syf2	70	55.975	ENSCING00000003017	-	66	57.233	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000007238	syf2	70	52.830	ENSCSAVG00000006627	-	73	52.830	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000007238	syf2	97	56.881	ENSCANG00000037322	SYF2	89	56.881	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	ENSCGRG00001020733	Syf2	92	67.411	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000007238	syf2	70	80.128	ENSCGRG00000005095	Syf2	77	79.375	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000007238	syf2	97	73.516	ENSCSEG00000000117	syf2	94	73.451	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000007238	syf2	100	81.858	ENSCVAG00000019543	syf2	94	81.858	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	73.009	ENSDARG00000004706	syf2	95	73.009	Danio_rerio
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.518	ENSDNOG00000047605	SYF2	91	66.518	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	ENSDORG00000001274	Syf2	91	67.411	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000007238	syf2	99	47.577	FBgn0033556	CG12343	99	47.577	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000007238	syf2	92	52.885	ENSETEG00000015729	SYF2	99	49.351	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000007238	syf2	72	58.385	ENSEBUG00000015402	syf2	76	58.385	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.580	ENSEASG00005004224	-	89	67.580	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	58.108	ENSEASG00005004232	-	92	58.108	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.580	ENSECAG00000010440	-	92	67.580	Equus_caballus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSECAG00000012023	-	91	66.964	Equus_caballus
ENSFHEG00000007238	syf2	72	50.307	ENSEEUG00000015084	SYF2	89	50.920	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	72.646	ENSELUG00000003465	syf2	93	72.646	Esox_lucius
ENSFHEG00000007238	syf2	97	68.182	ENSFCAG00000010324	-	76	68.182	Felis_catus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSFCAG00000043095	-	91	66.964	Felis_catus
ENSFHEG00000007238	syf2	91	66.341	ENSFALG00000000460	SYF2	89	67.123	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.273	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	67.273	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000007238	syf2	96	72.222	ENSGMOG00000019138	syf2	96	72.222	Gadus_morhua
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	ENSGALG00000013639	SYF2	88	68.304	Gallus_gallus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.088	ENSGAFG00000019435	syf2	99	78.008	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000007238	syf2	99	74.888	ENSGACG00000007305	syf2	94	74.336	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	69.196	ENSGAGG00000010670	SYF2	90	69.196	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	67.273	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000007238	syf2	100	77.434	ENSHBUG00000020477	syf2	97	77.434	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000007238	syf2	99	64.126	ENSHGLG00000004304	-	91	67.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	60.887	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	60.887	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000007238	syf2	99	76.000	ENSHCOG00000012904	syf2	73	76.000	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000007238	syf2	100	71.681	ENSIPUG00000019859	syf2	94	71.681	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000007238	syf2	64	55.172	ENSSTOG00000023984	SYF2	99	55.172	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000007238	syf2	88	66.000	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	66.000	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	78.761	ENSKMAG00000013856	syf2	95	78.761	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	78.182	ENSLBEG00000014425	syf2	95	78.761	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000007238	syf2	100	67.699	ENSLACG00000012064	SYF2	93	68.919	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000007238	syf2	100	72.124	ENSLOCG00000002728	syf2	90	72.124	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000007238	syf2	81	39.130	ENSLAFG00000030814	-	100	40.217	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSLAFG00000023150	-	91	66.964	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	66.364	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.359	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	66.364	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	66.364	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	66.364	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	77.523	ENSMAMG00000010403	syf2	93	77.434	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	77.434	ENSMZEG00005006429	syf2	95	77.434	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000007238	syf2	88	67.500	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	67.500	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	ENSMAUG00000018974	Syf2	92	68.304	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	65.741	ENSMICG00000016191	SYF2	100	68.900	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.857	ENSMOCG00000022938	Syf2	92	67.857	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000007238	syf2	100	74.336	ENSMMOG00000002396	syf2	94	74.336	Mola_mola
ENSFHEG00000007238	syf2	99	63.717	ENSMODG00000013951	-	98	63.717	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.211	ENSMALG00000010706	syf2	94	76.652	Monopterus_albus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	68.304	Mus_caroli
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	68.304	Mus_musculus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	68.304	Mus_pahari
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	68.304	Mus_spretus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.820	ENSMPUG00000015802	-	89	66.818	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000007238	syf2	98	66.968	ENSMPUG00000015801	-	89	66.968	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.518	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	66.518	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.518	ENSNGAG00000007912	Syf2	91	66.518	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000007238	syf2	100	68.304	ENSNBRG00000010720	syf2	94	68.304	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	67.273	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.071	ENSOPRG00000012870	SYF2	99	60.816	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000007238	syf2	99	65.625	ENSODEG00000017664	-	94	65.625	Octodon_degus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	61.435	ENSODEG00000014338	-	93	61.435	Octodon_degus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.130	ENSONIG00000008213	syf2	95	76.991	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000007238	syf2	90	66.502	ENSOANG00000009552	SYF2	100	66.502	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.742	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	61.290	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	ENSORLG00000028820	syf2	97	76.991	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	ENSORLG00020018333	syf2	95	76.991	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.549	ENSORLG00015014665	syf2	95	76.549	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000007238	syf2	100	78.319	ENSOMEG00000013911	syf2	95	78.319	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	60.484	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000007238	syf2	68	51.974	ENSOARG00000006269	-	81	50.318	Ovis_aries
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.222	ENSOARG00000006348	-	91	66.222	Ovis_aries
ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	67.273	Pan_paniscus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	68.182	ENSPPRG00000001638	-	100	60.800	Panthera_pardus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSPPRG00000001651	-	91	66.964	Panthera_pardus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	68.203	ENSPTIG00000005711	-	80	68.037	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSPTIG00000007036	-	91	66.964	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000007238	syf2	100	63.677	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	67.273	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSPANG00000008139	SYF2	90	66.364	Papio_anubis
ENSFHEG00000007238	syf2	98	70.721	ENSPKIG00000008130	syf2	94	70.721	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	ENSPSIG00000011816	SYF2	87	67.411	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000007238	syf2	99	75.446	ENSPMGG00000008755	syf2	87	75.446	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.411	ENSPEMG00000008283	Syf2	92	67.411	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000007238	syf2	99	67.857	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	67.857	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.531	ENSPFOG00000004116	syf2	93	80.531	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.531	ENSPLAG00000006691	syf2	97	80.531	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000007238	syf2	100	78.222	ENSPMEG00000011684	syf2	96	78.222	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000007238	syf2	100	80.531	ENSPREG00000003009	syf2	99	77.593	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.273	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	67.273	Pongo_abelii
ENSFHEG00000007238	syf2	96	57.746	ENSPCOG00000027011	SYF2	99	54.545	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000007238	syf2	99	57.589	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	57.589	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.578	ENSPNYG00000004979	syf2	95	77.434	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000007238	syf2	100	71.681	ENSPNAG00000015570	syf2	95	71.681	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.304	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	68.304	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	64.091	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	64.091	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000007238	syf2	97	66.364	ENSRROG00000001347	SYF2	90	66.364	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.281	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	67.273	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.964	ENSSHAG00000015630	-	90	66.964	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000007238	syf2	91	66.667	ENSSHAG00000007152	-	100	66.667	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000007238	syf2	98	71.171	ENSSFOG00015023647	syf2	93	71.171	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	75.221	ENSSMAG00000009867	syf2	95	75.221	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	77.626	ENSSDUG00000013072	syf2	95	77.434	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000007238	syf2	97	77.626	ENSSLDG00000012677	syf2	95	77.434	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000007238	syf2	99	76.786	ENSSARG00000012889	SYF2	91	76.786	Sorex_araneus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.750	ENSSPUG00000005251	SYF2	88	68.750	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	ENSSPAG00000009626	syf2	95	76.991	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000007238	syf2	98	67.117	ENSSSCG00000037481	SYF2	90	67.117	Sus_scrofa
ENSFHEG00000007238	syf2	62	53.378	ENSTGUG00000001126	SYF2	79	56.688	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000007238	syf2	100	74.336	ENSTRUG00000001499	syf2	90	74.336	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000007238	syf2	99	73.214	ENSTNIG00000016912	syf2	100	73.214	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000007238	syf2	99	48.430	ENSTBEG00000017370	SYF2	90	48.430	Tupaia_belangeri
ENSFHEG00000007238	syf2	96	67.281	ENSTTRG00000003550	SYF2	91	66.518	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000007238	syf2	97	67.273	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	67.273	Ursus_americanus
ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.820	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	66.818	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.368	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	66.368	Vicugna_pacos
ENSFHEG00000007238	syf2	96	66.820	ENSVVUG00000027175	-	89	66.818	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000007238	syf2	91	66.019	ENSVVUG00000027181	-	88	66.818	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000007238	syf2	99	66.071	ENSXETG00000022797	syf2	90	66.071	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000007238	syf2	99	77.119	ENSXMAG00000022698	syf2	95	79.204	Xiphophorus_maculatus