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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000007360 (Gene tree)
Gene ID: 105931090
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18910 bases
Position: chrKN811366.1:525607-544516
Accession: 105931090
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000006215	ResIII	PF04851.15	2.2e-07	1	1
ENSFHEP00000006184	ResIII	PF04851.15	5.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000005877	-	6549	XM_012869608	ENSFHEP00000006215	1400 (aa)	XP_012725062	UPI000B38C5BC
ENSFHET00000005932	-	4083	-	ENSFHEP00000006184	1360 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000007360	sbno1	77	57.955	ENSFHEG00000022262	si:ch73-63e15.2	65	64.626

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.826	ENSG00000139697	SBNO1	99	76.025	Homo_sapiens
ENSFHEG00000007360	sbno1	82	93.913	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	93.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.840	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.651	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	86.563	ENSACIG00000008088	sbno1	99	86.704	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	90.263	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	90.476	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	90.192	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	90.405	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	91.400	ENSATEG00000006667	sbno1	100	91.187	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.496	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	76.362	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	75.715	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	75.396	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.848	ENSANAG00000029958	-	99	83.333	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	84.632	ENSACLG00000024913	sbno1	100	84.868	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	81.250	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	81.534	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	75.983	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.935	Bos_taurus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.130	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	76.096	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.930	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	81.944	Canis_familiaris
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	80.969	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.969	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.333	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.333	Capra_hircus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.738	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	77.297	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000007360	sbno1	91	83.483	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.483	Cavia_aperea
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.483	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	71.681	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	72.788	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000007360	sbno1	91	83.662	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	83.662	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.483	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000007360	sbno1	85	80.855	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	82.084	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000007360	sbno1	96	73.146	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	73.062	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.318	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.904	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	72.222	ENSCANG00000042688	-	99	72.226	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	82.437	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	82.437	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	82.437	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	82.437	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	87.624	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	87.411	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	95.513	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	95.513	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	81.228	ENSDARG00000099080	sbno1	99	81.598	Danio_rerio
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	78.517	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	78.517	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	71.167	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	80.755	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000007360	sbno1	93	72.642	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	72.642	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000007360	sbno1	74	64.211	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.786	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000007360	sbno1	50	75.872	ENSEASG00005012595	-	92	75.872	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.966	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.638	Equus_caballus
ENSFHEG00000007360	sbno1	81	77.049	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.049	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	82.578	ENSELUG00000002886	sbno1	99	82.649	Esox_lucius
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.037	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.847	Felis_catus
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.640	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	76.433	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	80.978	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.431	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000007360	sbno1	97	82.756	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	84.725	Gadus_morhua
ENSFHEG00000007360	sbno1	88	76.480	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	76.400	Gallus_gallus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	95.513	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	95.513	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000007360	sbno1	97	85.736	ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.027	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	96	83.704	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	82.862	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.483	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	78.416	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	78.768	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	84.211	ENSHGLG00000014165	-	99	83.813	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000007360	sbno1	91	91.881	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	91.881	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	81.206	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	81.773	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.483	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.843	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.713	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	92.577	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	93.005	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	88.511	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	88.369	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	72.727	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.060	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	80.875	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.946	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.316	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.317	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	80.284	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	80.284	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	80.284	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.284	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	83.483	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	91.239	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	91.239	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.751	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	76.471	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000007360	sbno1	51	72.676	ENSMAUG00000004834	-	99	75.516	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	80.944	ENSMICG00000006573	-	99	80.466	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.154	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	83.154	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	84.073	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	84.157	Mola_mola
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.617	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	75.637	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.908	ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.694	Monopterus_albus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.865	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.789	Mus_caroli
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.615	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.789	Mus_musculus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.275	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.789	Mus_pahari
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.545	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.789	Mus_spretus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.053	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.865	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.706	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.424	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000007360	sbno1	92	84.375	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.375	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	85.652	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	85.943	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	72.957	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.404	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000007360	sbno1	62	72.785	ENSMEUG00000008768	-	93	74.684	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.317	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	75.106	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.662	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.662	Octodon_degus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.694	ENSONIG00000015348	sbno1	100	89.979	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	75.000	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.713	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	88.770	ENSORLG00000001593	sbno1	100	88.920	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.189	ENSORLG00020015216	sbno1	100	89.410	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.047	ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.268	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.047	ENSOMEG00000019313	sbno1	100	88.905	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000007360	sbno1	50	71.469	ENSOGAG00000010781	-	99	74.556	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	75.615	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.565	Ovis_aries
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.483	Pan_paniscus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.037	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.847	Panthera_pardus
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	76.056	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.867	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.483	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	83.483	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.483	Papio_anubis
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	81.657	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.612	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.130	ENSPSIG00000009572	-	99	75.727	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000007360	sbno1	92	73.124	ENSPSIG00000009256	-	99	73.201	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000007360	sbno1	95	82.975	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.975	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.399	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	75.472	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000007360	sbno1	100	95.374	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	95.587	Poecilia_formosa
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ENSFHEG00000007360	sbno1	100	94.879	ENSPREG00000017746	sbno1	100	95.092	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.546	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	76.099	Pongo_abelii
ENSFHEG00000007360	sbno1	89	69.118	ENSPCAG00000008634	SBNO1	87	69.505	Procavia_capensis
ENSFHEG00000007360	sbno1	96	82.562	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	82.562	Propithecus_coquereli
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