EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000008853 (Gene tree)
Gene ID: 105931672
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 28754 bases
Position: chrKN811374.1:939508-968261
Accession: 105931672
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000026130	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.4e-28	1	1
ENSFHEP00000026097	rRNA_proc-arch	PF13234.6	7.1e-25	1	1
ENSFHEP00000026097	DEAD	PF00270.29	2.7e-16	1	1
ENSFHEP00000026130	DEAD	PF00270.29	2.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000003522	-	4717	XM_012870446	ENSFHEP00000026130	1246 (aa)	XP_012725900	UPI000644BE26
ENSFHET00000003566	-	3576	-	ENSFHEP00000026097	1191 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSFHEG00000008853's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFHEG00000008853's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000008853	skiv2l	80	36.457	ENSFHEG00000023014	mtrex	91	36.148

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.107	ENSG00000204351	SKIV2L	100	60.112	Homo_sapiens
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.406	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	89.406	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.058	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	60.032	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	88.016	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.016	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.807	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	89.807	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.647	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	89.647	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.727	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	89.727	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	95	68.859	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	63.672	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.508	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.313	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.165	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.406	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	82.894	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	83.133	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.995	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	60.887	Bos_taurus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	96	40.846	WBGene00008502	skih-2	99	40.846	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.236	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.045	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.267	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	61.155	Canis_familiaris
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.267	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	61.155	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.316	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	60.383	Capra_hircus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.075	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	60.979	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.389	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	61.355	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.508	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.313	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.187	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.076	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.236	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	59.952	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.347	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	61.155	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	82	69.194	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	59.936	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000008853	skiv2l	93	51.109	ENSCING00000005576	-	99	51.109	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.267	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.349	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.767	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	61.490	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	86.163	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	86.404	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.981	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	94.008	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	84.013	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	84.013	Danio_rerio
ENSFHEG00000008853	skiv2l	92	65.301	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	93	65.163	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	93	44.737	FBgn0039117	tst	97	44.822	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000008853	skiv2l	71	72.152	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	72.152	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000008853	skiv2l	91	55.842	ENSEBUG00000013680	-	98	55.464	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000008853	skiv2l	88	66.909	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	62.906	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	88	67.372	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	61.404	Equus_caballus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	54	73.913	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	73.913	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	85.280	ENSELUG00000000181	skiv2l	98	88.426	Esox_lucius
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.267	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	60.272	Felis_catus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	94	65.567	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.126	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	81.577	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	81.577	Gadus_morhua
ENSFHEG00000008853	skiv2l	80	57.247	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.907	Gallus_gallus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.740	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	93.740	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.329	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.329	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.187	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	60.032	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.165	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	89.406	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000008853	skiv2l	94	66.563	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.773	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000008853	skiv2l	94	64.907	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	58.353	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000008853	skiv2l	98	83.475	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	83.475	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	82.160	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	82.520	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.076	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	60.463	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	50	83.582	ENSLACG00000002986	-	60	63.265	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.142	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.283	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.347	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	61.234	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.347	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	61.234	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.347	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.234	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.107	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	60.997	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.684	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	88.684	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.165	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	89.406	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000008853	skiv2l	61	71.429	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	83	71.429	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.044	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.014	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.600	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.563	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.209	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.952	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	86.739	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	86.739	Mola_mola
ENSFHEG00000008853	skiv2l	96	67.805	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.965	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	84.054	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.054	Monopterus_albus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.576	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	61.301	Mus_caroli
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.334	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	61.142	Mus_musculus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.736	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	61.538	Mus_pahari
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.174	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	60.983	Mus_spretus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	94	66.598	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	61.234	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.766	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	60.582	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	85.737	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	85.979	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.579	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.430	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000008853	skiv2l	73	68.476	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.946	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.728	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.396	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	61.124	Octodon_degus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.888	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.888	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.298	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.283	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.381	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	88.381	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.221	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	88.221	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.301	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	88.301	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.132	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	88.132	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.711	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	61.514	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	57.849	ENSOARG00000002411	-	100	56.875	Ovis_aries
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.606	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	60.537	Pan_paniscus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.508	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.392	Panthera_pardus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.107	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.997	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.187	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	60.032	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.255	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	60.269	Papio_anubis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	78.839	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.839	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	85.346	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	85.668	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.254	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	61.063	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000008853	skiv2l	96	67.391	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	61.758	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.018	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	93.018	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.018	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	93.018	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.178	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	93.178	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	87.927	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	88.010	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.946	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	59.792	Pongo_abelii
ENSFHEG00000008853	skiv2l	77	72.500	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	75	72.500	Procavia_capensis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.360	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.247	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.717	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	61.520	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	85.834	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	85.834	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	83.929	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	83.654	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.767	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	61.490	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.319	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.331	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.427	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	61.313	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000008853	skiv2l	98	39.017	YLR398C	-	96	39.324	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.828	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.630	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	96	67.495	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	65.549	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000008853	skiv2l	97	85.772	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	82.283	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.523	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.583	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	89.888	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	89.888	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	83.650	ENSSLDG00000024382	skiv2l	100	83.567	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	97	63.771	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	60.543	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	95	89.492	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.492	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.313	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.392	Sus_scrofa
ENSFHEG00000008853	skiv2l	73	86.631	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	70.225	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	84.147	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.307	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	93	62.822	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.822	Tupaia_belangeri
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	57.257	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.278	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.218	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	60.192	Ursus_americanus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	92	62.372	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	62.457	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.187	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.190	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	60.142	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	60.506	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	92.184	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	92.184	Xiphophorus_couchianus
ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.018	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	93.018	Xiphophorus_maculatus