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Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000009769 (Gene tree)
Gene ID: 105916097
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 57055 bases
Position: chrKN805689.1:87484-144538
Accession: 105916097
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000026759	eRF1_2	PF03464.15	9e-33	1	1
ENSFHEP00000008571	eRF1_2	PF03464.15	1e-32	1	1
ENSFHEP00000026743	eRF1_2	PF03464.15	1e-32	1	1
ENSFHEP00000008576	eRF1_2	PF03464.15	1e-32	1	1
ENSFHEP00000026759	eRF1_3	PF03465.15	8.9e-25	1	1
ENSFHEP00000008571	eRF1_3	PF03465.15	9.5e-25	1	1
ENSFHEP00000026743	eRF1_3	PF03465.15	9.5e-25	1	1
ENSFHEP00000008576	eRF1_3	PF03465.15	9.8e-25	1	1
ENSFHEP00000008571	eRF1_1	PF03463.15	9.9e-53	1	1
ENSFHEP00000026743	eRF1_1	PF03463.15	9.9e-53	1	1
ENSFHEP00000008576	eRF1_1	PF03463.15	1.3e-47	1	1
ENSFHEP00000026759	eRF1_1	PF03463.15	6.1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000001911	-	5243	-	ENSFHEP00000008576	385 (aa)	-	-
ENSFHET00000001897	-	4750	-	ENSFHEP00000026759	367 (aa)	-	-
ENSFHET00000001924	-	4352	-	ENSFHEP00000026743	385 (aa)	-	UPI000644A581
ENSFHET00000001919	-	5182	XM_012850412	ENSFHEP00000008571	385 (aa)	XP_012705866	UPI000644A581

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSG00000152684	PELO	100	79.481	Homo_sapiens
ENSFHEG00000009769	pelo	64	91.903	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.281	ENSAPOG00000023072	pelo	100	91.169	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000009769	pelo	64	91.903	ENSAPOG00000023700	-	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSAMEG00000007734	PELO	100	79.740	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000009769	pelo	97	87.131	ENSACIG00000014386	pelo	97	92.604	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.553	ENSAOCG00000023717	pelo	100	91.429	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.553	ENSAPEG00000011235	pelo	100	91.429	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000009769	pelo	100	92.468	ENSATEG00000019550	pelo	100	92.468	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000009769	pelo	81	71.812	ENSAPLG00000013265	PELO	100	71.812	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000009769	pelo	97	79.467	ENSACAG00000004352	PELO	100	78.961	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSANAG00000014096	PELO	100	79.740	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.130	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.130	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000009769	pelo	97	91.421	ENSAMXG00000020299	pelo	99	89.870	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.481	Bos_taurus
ENSFHEG00000009769	pelo	97	61.625	WBGene00011280	pelo-1	98	60.800	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSCJAG00000035190	PELO	100	79.481	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.000	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.221	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.221	Capra_hircus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.260	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.260	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSCCAG00000035600	PELO	100	79.481	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSCATG00000011829	PELO	100	79.740	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSCLAG00000005043	PELO	100	79.740	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSCSAG00000016692	PELO	100	79.740	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.260	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.533	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000009769	pelo	96	65.909	ENSCING00000001979	-	100	65.195	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000009769	pelo	100	66.213	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.974	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSCANG00000023382	PELO	100	79.740	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000009769	pelo	97	79.893	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.697	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	80.779	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.909	ENSCSEG00000008807	pelo	100	90.909	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000009769	pelo	100	97.403	ENSCVAG00000016082	pelo	100	97.403	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	87.792	ENSDARG00000055477	pelo	100	87.792	Danio_rerio
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.292	ENSDNOG00000036721	PELO	100	76.684	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	81.558	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.558	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000009769	pelo	96	68.466	FBgn0011207	pelo	96	67.018	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000009769	pelo	74	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSEASG00005013348	PELO	100	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.130	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.130	Esox_lucius
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.000	Felis_catus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.779	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.779	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000009769	pelo	74	81.338	ENSFDAG00000002076	PELO	88	81.338	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000009769	pelo	98	88.064	ENSGMOG00000005849	pelo	100	87.792	Gadus_morhua
ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.104	ENSGAFG00000019350	pelo	100	96.104	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.429	ENSGACG00000007245	pelo	100	91.429	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.533	ENSGAGG00000004018	PELO	100	80.000	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSGGOG00000012635	PELO	100	79.740	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.130	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.130	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.519	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.519	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000009769	pelo	100	78.442	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.442	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000009769	pelo	100	89.646	ENSHCOG00000016782	pelo	100	89.610	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000009769	pelo	100	88.828	ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.571	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	78.474	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.442	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	94.026	ENSKMAG00000021305	pelo	100	94.026	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.909	ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.260	Loxodonta_africana
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ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSMMUG00000039101	PELO	100	79.740	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSMNEG00000035538	PELO	100	79.740	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSMLEG00000039113	PELO	100	79.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000009769	pelo	97	94.102	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.247	Mastacembelus_armatus
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ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.779	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	80.779	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSMICG00000044040	PELO	100	80.000	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.260	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.909	ENSMMOG00000001324	pelo	100	90.909	Mola_mola
ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.008	ENSMALG00000008194	pelo	100	90.909	Monopterus_albus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.519	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	80.519	Mus_caroli
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.519	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	80.519	Mus_musculus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.779	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.779	Mus_pahari
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.519	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.519	Mus_spretus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.221	ENSMLUG00000024132	PELO	100	79.221	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.779	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	80.779	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.390	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.390	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSNLEG00000035970	PELO	100	79.740	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000009769	pelo	100	78.701	ENSMEUG00000005468	PELO	100	78.701	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000009769	pelo	98	79.420	ENSOPRG00000018793	PELO	100	79.420	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000009769	pelo	100	81.039	ENSODEG00000017579	PELO	100	81.039	Octodon_degus
ENSFHEG00000009769	pelo	96	91.375	ENSONIG00000011511	pelo	100	90.909	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.390	ENSORLG00000005827	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.649	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.649	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.390	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.390	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000009769	pelo	100	92.208	ENSOMEG00000021567	pelo	100	92.208	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.260	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.260	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.481	Ovis_aries
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSPPAG00000038951	PELO	100	79.740	Pan_paniscus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.000	Panthera_pardus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	80.000	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.000	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSPTRG00000034409	PELO	100	79.481	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.740	ENSPANG00000010902	PELO	100	79.740	Papio_anubis
ENSFHEG00000009769	pelo	100	87.792	ENSPKIG00000015190	pelo	100	87.792	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.267	ENSPSIG00000004971	PELO	100	79.740	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000009769	pelo	67	90.310	ENSPMGG00000014561	pelo	95	90.310	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	81.039	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	81.039	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000009769	pelo	100	79.481	ENSPCIG00000004880	PELO	100	79.481	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.883	ENSPFOG00000007277	pelo	100	96.883	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.623	ENSPLAG00000020787	pelo	100	96.623	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000009769	pelo	100	96.883	ENSPMEG00000016964	pelo	100	96.883	Poecilia_mexicana
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ENSFHEG00000009769	pelo	97	79.625	ENSPPYG00000015451	PELO	96	79.740	Pongo_abelii
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