EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000009801 (Gene tree)
Gene ID: 105928310
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10923 bases
Position: chrKN811322.1:408129-419051
Accession: 105928310
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000008611	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	1.2e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000001855	-	5437	XM_012865521	ENSFHEP00000008611	416 (aa)	XP_012720975	UPI0006451A10

Gene Model

Click here to download ENSFHEG00000009801's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFHEG00000009801's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.341	ENSG00000137054	POLR1E	98	43.341	Homo_sapiens
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	68.585	ENSAPOG00000012452	polr1e	100	68.585	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	39.783	ENSAMEG00000010193	POLR1E	95	39.783	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	64.029	ENSACIG00000009884	polr1e	99	69.211	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.540	ENSAOCG00000005665	polr1e	100	75.540	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	76.019	ENSAPEG00000020581	polr1e	100	76.019	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.540	ENSATEG00000020609	polr1e	100	75.540	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000009801	polr1e	81	38.182	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.462	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	43.860	ENSANAG00000038046	POLR1E	95	43.860	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.060	ENSACLG00000013685	polr1e	99	75.060	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	56.627	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	56.627	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.444	ENSBTAG00000012243	POLR1E	98	44.444	Bos_taurus
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	41.162	ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	44.837	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.720	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	43.720	Canis_familiaris
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.478	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	43.478	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.060	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	45.060	Capra_hircus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.471	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	44.471	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000009801	polr1e	70	40.893	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	40.893	Cavia_aperea
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.478	ENSCPOG00000009965	POLR1E	98	43.478	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	39.709	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	39.709	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.584	ENSCATG00000031732	POLR1E	97	48.182	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000009801	polr1e	87	46.133	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	46.133	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.826	ENSCSAG00000010782	POLR1E	98	43.826	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	37.374	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	37.374	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.084	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	45.084	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	44.068	ENSCANG00000036112	POLR1E	97	50.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	41.727	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	41.727	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	41.247	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	41.247	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	66.024	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	66.024	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	83.894	ENSCVAG00000019759	polr1e	100	83.894	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	97	56.931	ENSDARG00000006434	polr1e	100	56.490	Danio_rerio
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	39.019	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	36.998	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000009801	polr1e	86	42.265	ENSETEG00000018204	POLR1E	99	42.265	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.961	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	43.961	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.961	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	43.961	Equus_caballus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	39.089	ENSEEUG00000011928	POLR1E	86	38.849	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	65.542	ENSELUG00000008150	polr1e	99	65.542	Esox_lucius
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.614	ENSFCAG00000013081	POLR1E	98	43.614	Felis_catus
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	43.687	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	43.687	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.000	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	45.000	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	52.619	ENSGMOG00000003336	POLR1E	99	52.619	Gadus_morhua
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.510	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	43.510	Gallus_gallus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	82.933	ENSGAFG00000004850	polr1e	100	82.933	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	69.451	ENSGACG00000016087	polr1e	100	69.451	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	97	40.786	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	40.528	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.269	ENSGGOG00000001882	POLR1E	98	45.736	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.300	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	75.300	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.169	ENSHGLG00000002036	POLR1E	98	45.169	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.411	ENSHGLG00100012784	POLR1E	98	45.411	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	66.827	ENSHCOG00000002774	polr1e	100	66.827	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	53.976	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	53.976	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.720	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	43.720	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	44.310	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	44.310	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	78.177	ENSKMAG00000000046	polr1e	100	78.177	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	71.084	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	72.115	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000009801	polr1e	86	49.451	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	49.451	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	52.758	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	52.758	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.819	ENSLAFG00000012831	POLR1E	98	44.819	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.584	ENSMFAG00000045465	POLR1E	97	48.182	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.584	ENSMMUG00000017892	POLR1E	97	48.182	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	40.189	ENSMNEG00000040283	POLR1E	98	40.189	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.584	ENSMLEG00000031135	POLR1E	97	48.182	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	73.012	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	73.012	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.060	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	75.060	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.548	ENSMAUG00000021044	Polr1e	95	42.548	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.231	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	44.231	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	41.546	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	41.546	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	73.206	ENSMMOG00000007391	polr1e	100	73.206	Mola_mola
ENSFHEG00000009801	polr1e	96	44.279	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	44.279	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.481	ENSMALG00000002665	polr1e	99	75.481	Monopterus_albus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.067	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	42.462	Mus_caroli
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.686	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	43.108	Mus_musculus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.885	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	44.361	Mus_pahari
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.206	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	42.607	Mus_spretus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	39.655	ENSMPUG00000006040	POLR1E	98	37.419	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.928	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	44.928	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	44.310	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	44.310	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.540	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	75.540	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.341	ENSNLEG00000003616	POLR1E	97	46.032	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000009801	polr1e	74	49.778	ENSMEUG00000015372	-	80	49.778	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000009801	polr1e	86	38.674	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	38.674	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	45.343	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	45.343	Octodon_degus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.300	ENSONIG00000008921	polr1e	99	75.300	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.478	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	43.478	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	71.942	ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.942	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000009801	polr1e	93	68.217	ENSORLG00020007271	polr1e	99	68.217	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	72.662	ENSORLG00015000137	polr1e	100	72.662	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	69.784	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	69.784	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.855	ENSOGAG00000012981	POLR1E	96	43.855	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.301	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	45.301	Ovis_aries
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.892	ENSPPAG00000034566	POLR1E	97	46.032	Pan_paniscus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.855	ENSPPRG00000005649	POLR1E	98	43.855	Panthera_pardus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.855	ENSPTIG00000009774	POLR1E	98	43.855	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.892	ENSPTRG00000020944	POLR1E	97	46.032	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.584	ENSPANG00000025563	POLR1E	97	48.182	Papio_anubis
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	58.195	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	44.282	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	44.282	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	66.076	ENSPMGG00000024169	polr1e	95	66.076	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.788	ENSPEMG00000019151	-	95	42.788	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	36.473	ENSPEMG00000022300	-	94	36.473	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	45.368	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	45.368	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	78.959	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	78.959	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	83.894	ENSPLAG00000022679	polr1e	100	83.894	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000009801	polr1e	87	84.444	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	84.444	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	82.452	ENSPREG00000009470	polr1e	100	82.452	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.826	ENSPPYG00000019061	POLR1E	98	43.826	Pongo_abelii
ENSFHEG00000009801	polr1e	50	39.320	ENSPCAG00000004891	POLR1E	67	39.320	Procavia_capensis
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.478	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	43.478	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	43.939	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	43.687	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.300	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	75.300	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	56.010	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	56.010	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	42.308	ENSRNOG00000012664	Polr1e	95	42.308	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.133	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	44.503	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.584	ENSRROG00000031986	POLR1E	97	48.182	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.552	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	43.552	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000009801	polr1e	82	43.478	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	43.478	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	58.993	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	58.993	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	74.940	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	74.940	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	74.580	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	74.580	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	74.820	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	74.820	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000009801	polr1e	56	38.793	ENSSARG00000009810	-	58	38.793	Sorex_araneus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	44.630	ENSSPUG00000009499	POLR1E	100	44.630	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	77.885	ENSSPAG00000021240	polr1e	100	77.885	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	43.341	ENSSSCG00000005347	POLR1E	98	43.341	Sus_scrofa
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	37.584	ENSTGUG00000007169	POLR1E	100	37.584	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	68.258	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	68.258	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	68.269	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	68.269	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	44.949	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	44.949	Tupaia_belangeri
ENSFHEG00000009801	polr1e	95	43.750	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	43.750	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.444	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	46.518	Ursus_americanus
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	44.444	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	44.444	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000009801	polr1e	81	40.762	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	40.762	Vicugna_pacos
ENSFHEG00000009801	polr1e	98	43.552	ENSVVUG00000019954	POLR1E	97	43.552	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000009801	polr1e	99	40.238	ENSXETG00000006533	polr1e	99	40.238	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	78.897	ENSXCOG00000013706	polr1e	100	78.846	Xiphophorus_couchianus
ENSFHEG00000009801	polr1e	100	84.615	ENSXMAG00000012484	polr1e	100	84.615	Xiphophorus_maculatus