EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000012744 (Gene tree)
Gene ID: 105926976
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC105926976
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 24101 bases
Position: chrKN811303.1:2043254-2067354
Accession: 105926976
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000011303	MMR_HSR1	PF01926.23	6.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000018250	-	4142	XM_012863547	ENSFHEP00000011303	448 (aa)	XP_012719001	A0A146N3Z9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	58.980	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.980

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	58.537	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.848	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.848	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	89.062	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.062	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	58.036	ENSACAG00000028632	-	99	58.036	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	79.733	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.733	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	60.132	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.132	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	79	59.831	ENSCING00000020807	-	94	59.831	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	98	55.000	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.227	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	87.723	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	85.377	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	93.527	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	93.527	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	75.000	Danio_rerio
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	98	82.500	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	Danio_rerio
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	80	56.145	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.145	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	79.821	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.821	Esox_lucius
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	89	55.362	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.362	Gadus_morhua
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	95.312	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	95.312	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	58	95.736	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.736	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	85	63.446	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.443	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	84.234	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	84.234	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	81	59.780	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	59.780	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	96	60.046	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.908	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	77.728	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	77.728	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	62.472	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.697	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	62.138	ENSLACG00000004899	-	99	62.138	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	70.946	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.946	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	74.944	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.944	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	96	60.138	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.138	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	58.850	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Monopterus_albus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	98	87.699	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.699	Monopterus_albus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	96	59.815	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	99	59.677	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.839	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.839	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	59.556	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	58.129	ENSPKIG00000023918	-	98	58.129	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	75.724	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.724	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	58.850	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	83.929	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	83.929	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	94.013	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	94.013	Poecilia_formosa
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ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	94	58.933	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.933	Poecilia_reticulata
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