EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000012745 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pop4
Alias: zgc:110597
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7520 bases
Position: chrKN806234.1:1637-9156
Accession: 105921181
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000011309	UPF0086	PF01868.16	2e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000018277	-	657	XM_012856878	ENSFHEP00000011309	218 (aa)	XP_012712332	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000012745	pop4	94	55.556	ENSG00000105171	POP4	85	75.610	Homo_sapiens
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSAMEG00000018329	-	90	57.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000012745	pop4	90	50.249	ENSAMEG00000003172	-	89	50.249	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000012745	pop4	96	65.888	ENSACIG00000008358	pop4	96	65.888	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000012745	pop4	89	72.589	ENSAOCG00000010116	pop4	95	72.589	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000012745	pop4	89	72.589	ENSAPEG00000002829	pop4	82	72.589	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000012745	pop4	96	67.757	ENSATEG00000013028	pop4	96	67.757	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000012745	pop4	91	52.970	ENSAPLG00000014051	POP4	96	53.960	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000012745	pop4	90	58.000	ENSANAG00000020295	POP4	90	58.500	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000012745	pop4	96	67.757	ENSACLG00000000526	pop4	96	67.757	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000012745	pop4	97	59.535	ENSAMXG00000002899	pop4	92	59.535	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSBTAG00000002223	POP4	90	58.500	Bos_taurus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSCJAG00000046750	POP4	95	64.740	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000012745	pop4	66	65.306	ENSCAFG00000007630	POP4	95	60.795	Canis_familiaris
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.000	ENSCHIG00000016743	POP4	90	58.000	Capra_hircus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	55.779	ENSTSYG00000003488	POP4	89	56.281	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000012745	pop4	93	43.842	ENSCAPG00000011105	POP4	92	44.335	Cavia_aperea
ENSFHEG00000012745	pop4	93	54.369	ENSCPOG00000002992	POP4	92	54.854	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.039	ENSCCAG00000020285	-	93	56.039	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000012745	pop4	64	54.930	ENSCCAG00000034244	-	71	54.777	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.731	ENSCATG00000036022	POP4	85	76.829	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.000	ENSCLAG00000013162	POP4	90	58.000	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.039	ENSCSAG00000004868	POP4	90	58.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	43.939	ENSCHOG00000002071	POP4	90	44.444	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000012745	pop4	96	53.023	ENSCPBG00000016132	POP4	96	53.488	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000012745	pop4	55	33.333	ENSCING00000023871	-	80	30.488	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSCANG00000005924	POP4	98	57.500	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	55.779	ENSCGRG00001017185	Pop4	89	56.784	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000012745	pop4	90	55.779	ENSCGRG00000008155	Pop4	89	56.784	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000012745	pop4	96	58.411	ENSCSEG00000002946	pop4	96	59.813	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000012745	pop4	89	64.433	ENSCVAG00000018602	POP4	85	64.433	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000012745	pop4	98	58.257	ENSDARG00000101472	pop4	98	58.716	Danio_rerio
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSDNOG00000047663	POP4	79	57.000	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000012745	pop4	70	47.742	ENSDORG00000008577	Pop4	88	48.387	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000012745	pop4	93	43.689	ENSETEG00000003607	POP4	90	45.455	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000012745	pop4	67	48.980	ENSEBUG00000008575	pop4	67	48.980	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000012745	pop4	67	52.667	ENSEBUG00000010447	pop4	58	52.667	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000012745	pop4	67	48.980	ENSEBUG00000004305	pop4	63	48.980	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000012745	pop4	90	73.077	ENSECAG00000020206	POP4	74	73.077	Equus_caballus
ENSFHEG00000012745	pop4	91	43.500	ENSEEUG00000013109	POP4	99	44.000	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000012745	pop4	97	60.465	ENSELUG00000019812	pop4	96	61.395	Esox_lucius
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSFCAG00000001619	POP4	90	58.000	Felis_catus
ENSFHEG00000012745	pop4	99	52.252	ENSFALG00000000206	POP4	98	53.153	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.000	ENSFDAG00000017859	POP4	90	57.500	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000012745	pop4	92	58.491	ENSGMOG00000000335	pop4	100	58.491	Gadus_morhua
ENSFHEG00000012745	pop4	98	50.000	ENSGALG00000041972	POP4	91	50.917	Gallus_gallus
ENSFHEG00000012745	pop4	68	69.935	ENSGAFG00000003571	pop4	84	69.935	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000012745	pop4	96	64.516	ENSGACG00000014510	pop4	100	70.430	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	53.738	ENSGAGG00000024544	POP4	77	54.206	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000012745	pop4	94	55.556	ENSGGOG00000038346	POP4	93	56.039	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000012745	pop4	96	67.757	ENSHBUG00000021821	pop4	96	67.757	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.000	ENSHGLG00000015798	POP4	90	57.500	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.000	ENSHGLG00100009737	POP4	90	57.500	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000012745	pop4	96	61.860	ENSHCOG00000020937	pop4	96	61.860	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000012745	pop4	98	54.338	ENSIPUG00000013652	pop4	98	54.338	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000012745	pop4	93	55.340	ENSSTOG00000011016	POP4	92	55.825	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000012745	pop4	93	53.883	ENSJJAG00000013376	Pop4	92	54.854	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	68.692	ENSKMAG00000012250	pop4	96	68.692	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000012745	pop4	95	64.929	ENSLBEG00000014139	pop4	94	64.929	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000012745	pop4	95	64.455	ENSLBEG00000018846	-	94	64.455	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000012745	pop4	90	52.764	ENSLACG00000008581	POP4	89	53.266	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000012745	pop4	98	55.963	ENSLOCG00000005597	pop4	98	56.422	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.214	ENSLAFG00000000084	POP4	90	57.711	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.039	ENSMFAG00000029606	POP4	90	58.000	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSMMUG00000017424	POP4	90	58.000	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000012745	pop4	94	55.072	ENSMNEG00000031374	POP4	90	58.000	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.039	ENSMLEG00000043454	POP4	90	58.209	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000012745	pop4	85	75.401	ENSMAMG00000011716	pop4	96	69.626	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	67.757	ENSMZEG00005002360	pop4	96	67.757	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000012745	pop4	98	50.459	ENSMGAG00000005337	POP4	96	51.376	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.784	ENSMAUG00000020110	Pop4	89	56.784	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSMICG00000035730	POP4	88	57.214	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	63.426	ENSMMOG00000015321	pop4	96	63.889	Mola_mola
ENSFHEG00000012745	pop4	93	54.369	ENSMODG00000029406	POP4	88	55.340	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000012745	pop4	96	70.093	ENSMALG00000012571	pop4	96	70.093	Monopterus_albus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.000	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	90	57.000	Mus_caroli
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.000	ENSMUSG00000030423	Pop4	90	56.000	Mus_musculus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	55.500	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	89	56.716	Mus_spretus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.286	ENSMPUG00000008041	-	90	58.291	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000012745	pop4	90	50.739	ENSMPUG00000008063	-	89	51.724	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000012745	pop4	93	42.029	ENSMLUG00000010774	POP4	92	42.512	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000012745	pop4	56	61.600	ENSMEUG00000003636	-	100	61.600	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSOPRG00000004736	POP4	99	58.000	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSODEG00000013025	POP4	93	57.500	Octodon_degus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	66.977	ENSONIG00000003458	pop4	95	66.977	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	58.000	ENSOCUG00000015974	POP4	90	58.500	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	64.019	ENSORLG00000020317	pop4	96	64.019	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000012745	pop4	96	63.426	ENSORLG00015011624	pop4	96	63.426	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000012745	pop4	99	63.229	ENSOMEG00000002538	pop4	99	63.229	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSOGAG00000011168	POP4	90	57.214	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.000	ENSOARG00000004041	POP4	89	58.000	Ovis_aries
ENSFHEG00000012745	pop4	94	55.556	ENSPPAG00000040372	POP4	90	57.500	Pan_paniscus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSPPRG00000010502	POP4	90	58.000	Panthera_pardus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	57.500	ENSPTIG00000016598	POP4	90	58.000	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000012745	pop4	94	55.556	ENSPTRG00000010779	POP4	90	57.500	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.039	ENSPANG00000008546	POP4	90	58.000	Papio_anubis
ENSFHEG00000012745	pop4	96	56.398	ENSPKIG00000004468	pop4	92	56.398	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000012745	pop4	96	53.953	ENSPSIG00000015690	POP4	98	56.500	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000012745	pop4	89	56.000	ENSPMGG00000008608	pop4	94	57.868	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.281	ENSPEMG00000014034	-	91	56.281	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000012745	pop4	90	51.269	ENSPEMG00000019982	-	89	51.269	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000012745	pop4	66	61.644	ENSPMAG00000006265	pop4	73	61.644	Petromyzon_marinus
ENSFHEG00000012745	pop4	93	54.369	ENSPCIG00000024738	POP4	88	54.369	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000012745	pop4	89	74.619	ENSPFOG00000000925	pop4	88	74.619	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000012745	pop4	89	74.619	ENSPLAG00000003161	pop4	88	74.619	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000012745	pop4	89	74.619	ENSPMEG00000002475	pop4	88	74.619	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000012745	pop4	89	74.242	ENSPREG00000022403	pop4	84	74.242	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000012745	pop4	94	56.039	ENSPPYG00000009805	POP4	90	58.000	Pongo_abelii
ENSFHEG00000012745	pop4	90	53.465	ENSPCAG00000007737	POP4	90	53.960	Procavia_capensis
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.500	ENSPCOG00000018055	POP4	90	57.000	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000012745	pop4	90	56.436	ENSPVAG00000006069	POP4	90	56.436	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000012745	pop4	96	66.822	ENSPNYG00000020038	pop4	96	66.822	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000012745	pop4	91	59.512	ENSPNAG00000005591	pop4	91	59.512	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000012745	pop4	90	55.779	ENSRNOG00000027646	Pop4	89	56.784	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000012745	pop4	74	49.390	ENSRBIG00000044769	POP4	84	55.639	Rhinopithecus_bieti
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