EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000013741 (Gene tree)
Gene ID: 105915287
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 870 bases
Position: chrKN805639.1:541620-542489
Accession: 105915287
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000012295	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	9.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000031932	-	870	XM_012849345	ENSFHEP00000012295	289 (aa)	XP_012704799	UPI000644CB4E

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.857	ENSG00000152464	RPP38	100	44.048	Homo_sapiens
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	64.130	ENSAPOG00000001240	rpp38	95	64.493	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.108	ENSAMEG00000018832	RPP38	95	42.199	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	66.426	ENSACIG00000011592	rpp38	97	67.509	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	63.287	ENSAOCG00000017293	rpp38	96	63.287	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.704	ENSAPEG00000002315	rpp38	95	64.855	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000013741	rpp38	98	63.986	ENSATEG00000000731	rpp38	97	63.669	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000013741	rpp38	90	43.233	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	44.195	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.217	ENSACLG00000016958	rpp38	96	64.260	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.217	ENSACLG00000016962	rpp38	96	64.260	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000013741	rpp38	90	41.445	ENSAMXG00000025023	rpp38	93	41.727	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	40.678	ENSBTAG00000007702	RPP38	95	40.780	Bos_taurus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.257	ENSCAFG00000024373	RPP38	95	40.780	Canis_familiaris
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.257	ENSCAFG00020008008	RPP38	95	40.780	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000013741	rpp38	93	43.431	ENSCHIG00000012484	RPP38	87	42.146	Capra_hircus
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	45.000	ENSCPOG00000003981	RPP38	95	44.710	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	45.485	ENSCLAG00000010194	RPP38	95	43.103	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	42.403	ENSCSAG00000019055	RPP38	95	42.308	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.761	ENSCHOG00000004335	RPP38	95	41.319	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	41.549	ENSCGRG00001001395	Rpp38	95	39.785	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	41.549	ENSCGRG00000017441	Rpp38	95	39.785	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	58.123	ENSCSEG00000001721	rpp38	96	58.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	79.348	ENSCVAG00000001676	rpp38	95	79.348	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	91	48.889	ENSDARG00000040350	rpp38	94	48.227	Danio_rerio
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	41.892	ENSDNOG00000040314	RPP38	95	39.858	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	43.382	ENSDORG00000009783	Rpp38	87	41.065	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	43.729	ENSETEG00000002839	RPP38	95	42.446	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	44.027	ENSEASG00005019783	RPP38	94	40.909	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000013741	rpp38	92	41.304	ENSEEUG00000014677	RPP38	88	39.474	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	55.254	ENSELUG00000010160	rpp38	96	53.265	Esox_lucius
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.667	ENSFCAG00000022449	RPP38	95	42.349	Felis_catus
ENSFHEG00000013741	rpp38	90	42.481	ENSFALG00000014804	RPP38	88	43.396	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	42.424	ENSFDAG00000018669	RPP38	95	40.767	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000013741	rpp38	91	43.321	ENSGALG00000008794	RPP38	86	41.852	Gallus_gallus
ENSFHEG00000013741	rpp38	56	71.605	ENSGACG00000009258	rpp38	99	71.605	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	64.855	ENSHBUG00000010937	rpp38	96	63.899	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	43.464	ENSHGLG00000012144	RPP38	95	42.517	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	40.942	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	42.754	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	42.034	ENSSTOG00000025699	RPP38	92	41.786	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	43.243	ENSJJAG00000007523	Rpp38	95	42.807	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000013741	rpp38	91	63.060	ENSKMAG00000003986	rpp38	90	62.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000013741	rpp38	98	64.211	ENSLBEG00000006853	rpp38	96	64.493	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	46.823	ENSLACG00000006502	RPP38	95	45.361	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.333	ENSLOCG00000018347	rpp38	93	45.548	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.484	ENSLAFG00000000509	RPP38	95	42.014	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	42.049	ENSMMUG00000007679	RPP38	95	41.958	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	62.633	ENSMAMG00000012774	rpp38	95	63.043	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.942	ENSMZEG00005003189	rpp38	96	64.982	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.217	ENSMZEG00005003200	rpp38	96	64.260	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000013741	rpp38	91	45.318	ENSMGAG00000008217	RPP38	86	44.944	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	42.105	ENSMAUG00000003644	Rpp38	95	39.785	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	40.000	ENSMOCG00000007020	Rpp38	95	39.286	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000013741	rpp38	98	57.895	ENSMMOG00000003446	rpp38	96	59.928	Mola_mola
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	42.294	ENSMODG00000024091	RPP38	95	40.143	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000013741	rpp38	98	59.184	ENSMALG00000002356	rpp38	96	59.028	Monopterus_albus
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	42.657	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	95	41.993	Mus_caroli
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	42.657	ENSMUSG00000049950	Rpp38	95	42.553	Mus_musculus
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	43.007	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	95	42.908	Mus_pahari
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	42.308	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	95	41.281	Mus_spretus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	43.390	ENSMPUG00000018523	RPP38	95	41.637	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	42.806	ENSMLUG00000002153	RPP38	95	43.110	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	42.623	ENSNGAG00000011066	Rpp38	95	42.123	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.704	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	64.982	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	66.787	ENSONIG00000020467	rpp38	95	64.982	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	38.652	ENSOCUG00000022768	-	95	39.298	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	39.437	ENSOCUG00000024367	-	95	38.721	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	64.855	ENSORLG00000009219	rpp38	95	63.768	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	63.177	ENSORLG00020011503	rpp38	92	63.538	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	64.260	ENSORLG00015017702	rpp38	92	63.538	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000013741	rpp38	91	64.504	ENSOMEG00000005414	rpp38	95	63.177	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	43.772	ENSOGAG00000008059	RPP38	88	42.322	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000013741	rpp38	93	43.796	ENSOARG00000004534	RPP38	87	42.529	Ovis_aries
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	43.522	ENSPPAG00000041577	RPP38	86	41.489	Pan_paniscus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.384	ENSPPRG00000015329	RPP38	95	41.812	Panthera_pardus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.333	ENSPTIG00000007188	RPP38	95	41.993	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	43.522	ENSPTRG00000002318	RPP38	86	41.489	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	43.706	ENSPKIG00000025652	rpp38	93	43.945	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000013741	rpp38	92	43.796	ENSPSIG00000001527	RPP38	90	42.697	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	41.696	ENSPEMG00000008375	Rpp38	95	40.357	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	44.444	ENSPCIG00000009096	RPP38	90	44.406	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000013741	rpp38	76	72.398	ENSPFOG00000016823	rpp38	95	72.038	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	76.923	ENSPLAG00000007626	rpp38	96	76.812	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	68.116	ENSPMEG00000020392	rpp38	96	68.116	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	75.175	ENSPREG00000017744	rpp38	96	75.000	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	42.857	ENSPPYG00000002113	RPP38	95	40.636	Pongo_abelii
ENSFHEG00000013741	rpp38	94	43.007	ENSPVAG00000007155	RPP38	95	42.606	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	65.580	ENSPNYG00000004293	rpp38	96	64.621	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000013741	rpp38	90	44.061	ENSPNAG00000010633	rpp38	94	43.841	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000013741	rpp38	97	45.583	ENSRNOG00000038025	Rpp38	95	44.803	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	41.667	ENSSHAG00000015529	RPP38	95	39.929	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	63.043	ENSSMAG00000018276	rpp38	91	61.710	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	64.130	ENSSDUG00000001651	rpp38	96	64.260	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	65.580	ENSSLDG00000014355	rpp38	96	65.343	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	38.488	ENSSARG00000012099	RPP38	94	38.351	Sorex_araneus
ENSFHEG00000013741	rpp38	92	46.324	ENSSPUG00000018363	-	89	43.071	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	92	44.118	ENSSPUG00000008560	-	90	43.820	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	92	45.956	ENSSPUG00000005237	-	89	43.446	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	96	61.594	ENSSPAG00000020387	rpp38	95	61.594	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000013741	rpp38	91	43.796	ENSSSCG00000027110	RPP38	87	41.667	Sus_scrofa
ENSFHEG00000013741	rpp38	90	43.866	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	43.657	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000013741	rpp38	98	57.193	ENSTNIG00000001334	rpp38	97	57.401	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000013741	rpp38	99	43.046	ENSTTRG00000004420	RPP38	95	42.361	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.781	ENSUAMG00000002618	RPP38	95	44.326	Ursus_americanus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	44.147	ENSUMAG00000012382	RPP38	95	42.606	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000013741	rpp38	100	43.581	ENSVVUG00000005272	RPP38	95	41.667	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000013741	rpp38	95	41.135	ENSXETG00000003419	rpp38	95	39.024	Xenopus_tropicalis