EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000016959 (Gene tree)
Gene ID: 105929168
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13628 bases
Position: chrKN805579.1:647867-661494
Accession: 105929168
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000015349	SRP54	PF00448.22	1.8e-47	1	1
ENSFHEP00000015349	SRP54_N	PF02881.19	4.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000023444	-	6729	XM_012866826	ENSFHEP00000015349	651 (aa)	XP_012722280	UPI000644FC9E

Gene Model

Click here to download ENSFHEG00000016959's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFHEG00000016959's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.069	ENSG00000182934	SRPRA	100	66.314	Homo_sapiens
ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.247	ENSAPOG00000017588	srpra	100	88.940	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.218	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	67.316	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.793	ENSACIG00000021588	srpra	100	85.714	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.555	ENSAOCG00000018884	srpra	100	89.247	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.555	ENSAPEG00000022286	srpra	92	89.247	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000016959	srpra	100	85.605	ENSATEG00000023578	srpra	92	94.921	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000016959	srpra	94	71.154	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	71.290	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000016959	srpra	100	71.775	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	71.212	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.123	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	66.267	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000016959	srpra	100	87.250	ENSACLG00000000518	srpra	100	86.943	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000016959	srpra	100	72.350	ENSAMXG00000009975	srpra	97	93.016	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.527	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.879	Bos_taurus
ENSFHEG00000016959	srpra	99	48.943	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.338	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.123	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	66.267	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.261	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	65.663	Canis_familiaris
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.933	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	67.375	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000016959	srpra	100	68.636	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.576	Capra_hircus
ENSFHEG00000016959	srpra	77	84.164	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	87.302	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000016959	srpra	95	64.640	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.567	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.123	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	66.465	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.273	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	66.567	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.474	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	67.020	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.275	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	66.417	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000016959	srpra	53	87.245	ENSCHOG00000010015	-	72	87.245	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000016959	srpra	100	70.303	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	71.515	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000016959	srpra	99	58.499	ENSCING00000008954	-	100	58.779	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000016959	srpra	99	60.092	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.480	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.474	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	66.766	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.873	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	67.572	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.873	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000016959	srpra	100	85.299	ENSCSEG00000002374	srpra	100	84.992	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	90.658	ENSCVAG00000019881	srpra	100	90.658	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	77.863	ENSDARG00000061124	srpra	100	77.863	Danio_rerio
ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.916	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.168	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.223	ENSDORG00000016719	Srpr	100	66.717	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000016959	srpra	99	51.138	FBgn0010391	Gtp-bp	100	51.515	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.868	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	65.658	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000016959	srpra	50	83.025	ENSEBUG00000002602	srpra	73	83.492	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.830	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.768	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.830	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.768	Equus_caballus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	63.222	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.594	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	83.817	ENSELUG00000017643	srpra	100	83.461	Esox_lucius
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.117	ENSFCAG00000011274	-	100	66.066	Felis_catus
ENSFHEG00000016959	srpra	80	61.152	ENSFCAG00000030894	-	99	59.851	Felis_catus
ENSFHEG00000016959	srpra	99	69.113	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	68.349	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.020	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	80.704	ENSGMOG00000013244	srpra	100	80.492	Gadus_morhua
ENSFHEG00000016959	srpra	100	72.012	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	71.710	Gallus_gallus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	92.780	ENSGAFG00000000453	srpra	100	92.934	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	83.639	ENSGACG00000006550	srpra	100	83.410	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	70.181	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	71.386	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.069	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	66.314	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000016959	srpra	100	87.097	ENSHBUG00000000119	srpra	100	86.790	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.223	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.223	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.686	ENSHCOG00000010749	srpra	100	84.686	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000016959	srpra	94	74.595	ENSIPUG00000000867	srpra	99	75.081	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.275	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	66.869	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.322	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.020	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.724	ENSKMAG00000002280	srpra	100	90.184	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	87.730	ENSLBEG00000009608	srpra	100	87.270	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000016959	srpra	100	70.721	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	72.114	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000016959	srpra	100	75.799	ENSLOCG00000002733	srpra	100	75.647	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.071	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	66.464	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.428	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	66.567	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.428	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	66.567	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.428	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	67.021	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.273	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	66.567	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	85.100	ENSMAMG00000000473	srpra	100	85.407	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	87.250	ENSMZEG00005013432	srpra	100	86.943	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000016959	srpra	94	71.567	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	71.244	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.873	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	67.572	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.477	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	66.920	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.625	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	67.270	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000016959	srpra	100	78.321	ENSMMOG00000005019	srpra	100	78.015	Mola_mola
ENSFHEG00000016959	srpra	100	68.341	ENSMODG00000004576	-	100	67.123	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000016959	srpra	100	86.943	ENSMALG00000011343	srpra	100	86.790	Monopterus_albus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.523	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSFHEG00000016959	srpra	100	68.024	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.722	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSFHEG00000016959	srpra	100	64.986	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	64.409	Mus_spretus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.169	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.265	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.273	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	67.527	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.069	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	66.917	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000016959	srpra	100	86.636	ENSNBRG00000017311	srpra	100	86.175	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000016959	srpra	99	63.927	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.190	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000016959	srpra	94	66.613	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	65.329	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000016959	srpra	100	64.307	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.952	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.776	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	66.464	Octodon_degus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	86.790	ENSONIG00000005324	srpra	100	86.022	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.629	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	66.766	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.485	ENSORLG00000014676	srpra	93	96.508	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.332	ENSORLG00020009240	srpra	100	84.332	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.178	ENSORLG00015015405	srpra	100	84.178	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.946	ENSOMEG00000005872	srpra	100	84.946	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.568	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	66.667	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000016959	srpra	100	65.303	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	65.303	Ovis_aries
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.069	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	66.314	Pan_paniscus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.117	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	66.066	Panthera_pardus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.967	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	65.916	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.069	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	66.314	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.428	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	66.567	Papio_anubis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	75.569	ENSPKIG00000016106	srpra	100	75.569	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000016959	srpra	94	71.176	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	70.900	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	83.767	ENSPMGG00000001393	srpra	100	82.236	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.776	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	67.421	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000016959	srpra	99	62.064	ENSPMAG00000009559	srpra	99	61.621	Petromyzon_marinus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.171	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.119	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	93.395	ENSPFOG00000003114	srpra	100	93.241	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000016959	srpra	100	93.395	ENSPLAG00000007323	srpra	100	93.241	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000016959	srpra	100	93.395	ENSPMEG00000015658	srpra	100	93.241	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000016959	srpra	100	93.702	ENSPREG00000004937	srpra	100	93.702	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000016959	srpra	89	86.842	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	86.842	Pongo_abelii
ENSFHEG00000016959	srpra	61	90.698	ENSPCAG00000003801	-	63	90.698	Procavia_capensis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.325	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.261	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.629	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	66.869	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	87.250	ENSPNYG00000012371	srpra	100	86.943	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000016959	srpra	100	79.020	ENSPNAG00000013476	srpra	100	77.982	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.722	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	67.421	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.316	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	66.567	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.737	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	66.566	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000016959	srpra	54	39.946	YDR292C	-	52	41.641	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFHEG00000016959	srpra	100	66.971	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.117	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000016959	srpra	94	67.367	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.236	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000016959	srpra	100	71.779	ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.699	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	76.489	ENSSMAG00000002783	srpra	100	76.336	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	88.497	ENSSDUG00000013920	srpra	92	88.344	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000016959	srpra	100	88.190	ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.037	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000016959	srpra	82	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	69.138	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	68.986	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	89.433	ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.127	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	68.437	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.771	Sus_scrofa
ENSFHEG00000016959	srpra	94	69.094	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	68.285	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000016959	srpra	100	84.485	ENSTRUG00000006856	srpra	100	83.717	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000016959	srpra	100	77.711	ENSTNIG00000010316	srpra	100	77.861	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.781	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	66.566	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.922	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.316	Ursus_americanus
ENSFHEG00000016959	srpra	96	61.801	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	62.462	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000016959	srpra	69	90.698	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	90.698	Vicugna_pacos
ENSFHEG00000016959	srpra	100	67.933	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	67.616	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000016959	srpra	100	60.909	ENSXETG00000003920	srpra	100	62.538	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000016959	srpra	87	97.898	ENSXCOG00000001286	srpra	100	97.898	Xiphophorus_couchianus
ENSFHEG00000016959	srpra	100	92.780	ENSXMAG00000028401	srpra	100	92.780	Xiphophorus_maculatus