EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000019043 (Gene tree)
Gene ID: 105920970
Gene Symbol: mtrf1
Alias: zgc:113104
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 36404 bases
Position: chrKN806177.1:159778-196181
Accession: 105920970
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000017340	RF-1	PF00472.20	5.6e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000026002	-	2030	XM_012856631	ENSFHEP00000017340	436 (aa)	XP_012712085	UPI000644BF66

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000019043	mtrf1	91	41.667	ENSFHEG00000007025	mtrf1l	95	41.667

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.090	ENSG00000120662	MTRF1	85	54.090	Homo_sapiens
ENSFHEG00000019043	mtrf1	90	76.000	ENSAPOG00000010181	mtrf1	97	76.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	53.846	ENSAMEG00000008696	MTRF1	87	53.846	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000019043	mtrf1	54	82.479	ENSACIG00000001495	mtrf1	94	82.479	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	75.737	ENSAOCG00000002832	mtrf1	98	75.737	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	74.830	ENSAPEG00000014844	mtrf1	98	74.830	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000019043	mtrf1	92	74.378	ENSATEG00000017403	mtrf1	95	74.378	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.394	ENSAPLG00000009317	MTRF1	87	52.394	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	48.730	ENSACAG00000000897	MTRF1	96	48.730	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	50.521	ENSANAG00000023063	-	85	50.521	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000019043	mtrf1	82	53.933	ENSANAG00000025310	-	98	53.933	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	73.864	ENSACLG00000023945	mtrf1	98	73.864	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	72.294	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	72.294	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	90	53.435	ENSBTAG00000012260	MTRF1	88	53.435	Bos_taurus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.786	ENSCJAG00000017739	MTRF1	94	65.244	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	54.522	ENSCAFG00000004795	MTRF1	87	54.522	Canis_familiaris
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	54.522	ENSCAFG00020018178	MTRF1	87	54.522	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000019043	mtrf1	90	53.181	ENSCHIG00000011810	MTRF1	88	53.181	Capra_hircus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	93	53.218	ENSTSYG00000006976	MTRF1	89	53.218	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.525	ENSCAPG00000013163	MTRF1	89	53.525	Cavia_aperea
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.264	ENSCPOG00000005264	MTRF1	86	53.264	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	54.569	ENSCCAG00000035116	MTRF1	86	54.569	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.737	ENSCATG00000009909	MTRF1	85	54.737	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.264	ENSCLAG00000000582	MTRF1	86	53.264	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.474	ENSCSAG00000017835	MTRF1	85	54.474	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	80	53.143	ENSCHOG00000011915	-	86	53.143	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.926	ENSCPBG00000007969	MTRF1	84	52.926	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	53.562	ENSCANG00000040353	MTRF1	85	53.562	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	55.673	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	86	55.673	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	55.673	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	86	55.673	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	66.059	ENSCSEG00000005667	mtrf1	96	66.059	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	77.598	ENSCVAG00000021729	mtrf1	98	77.598	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	64.629	ENSDARG00000033579	mtrf1	97	64.629	Danio_rerio
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	52.468	ENSDNOG00000034196	MTRF1	97	59.801	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	55.091	ENSDORG00000016429	Mtrf1	86	55.091	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	51.463	ENSETEG00000014811	MTRF1	90	51.463	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000019043	mtrf1	52	56.195	ENSEBUG00000000778	mtrf1	93	56.195	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.786	ENSEASG00005015715	MTRF1	86	53.786	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	90	53.197	ENSECAG00000014389	MTRF1	85	53.197	Equus_caballus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	43.896	ENSEEUG00000004450	-	86	43.490	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	62.645	ENSELUG00000006544	mtrf1	97	62.645	Esox_lucius
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	54.615	ENSFCAG00000031635	MTRF1	87	54.615	Felis_catus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.660	ENSFALG00000008036	MTRF1	93	52.660	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.525	ENSFDAG00000017881	MTRF1	86	53.525	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	64.191	ENSGMOG00000008608	mtrf1	98	64.191	Gadus_morhua
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.660	ENSGALG00000016951	MTRF1	83	52.660	Gallus_gallus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	100	80.505	ENSGAFG00000007093	mtrf1	99	80.505	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	76.127	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	76.127	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	72	56.369	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	56.369	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.354	ENSGGOG00000002529	MTRF1	85	54.354	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	52.480	ENSHGLG00000003210	MTRF1	86	52.480	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	52.480	ENSHGLG00100011843	MTRF1	86	52.480	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000019043	mtrf1	96	65.707	ENSHCOG00000009449	mtrf1	94	65.707	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.354	ENSSTOG00000021682	MTRF1	85	54.354	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.665	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	86	53.665	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	100	72.172	ENSKMAG00000003231	mtrf1	98	72.172	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	83.117	ENSLBEG00000027169	-	93	83.117	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	83.117	ENSLBEG00000023151	mtrf1	93	83.117	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	58.311	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	58.311	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	60.322	ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	60.322	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.525	ENSLAFG00000022177	-	86	53.525	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	42.448	ENSLAFG00000030499	-	85	42.448	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.737	ENSMFAG00000037972	MTRF1	85	54.737	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.737	ENSMNEG00000035487	MTRF1	85	54.737	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.737	ENSMLEG00000033582	MTRF1	85	54.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	100	72.831	ENSMAMG00000022048	mtrf1	98	72.831	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	73.864	ENSMZEG00005017922	mtrf1	98	73.864	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.926	ENSMGAG00000014971	MTRF1	90	52.926	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	56.201	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	85	56.201	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	97	51.185	ENSMICG00000033131	MTRF1	93	51.185	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	55.673	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	85	55.673	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	67.686	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	67.686	Mola_mola
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	54.155	ENSMODG00000014772	MTRF1	84	54.155	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	73.624	ENSMALG00000013274	mtrf1	99	73.624	Monopterus_albus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	84	56.522	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	82	56.522	Mus_caroli
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	55.937	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	85	55.937	Mus_musculus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	55.409	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	85	55.409	Mus_pahari
ENSFHEG00000019043	mtrf1	85	56.604	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	83	56.604	Mus_spretus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	53.171	ENSMPUG00000001874	MTRF1	91	53.171	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	55.352	ENSMLUG00000017237	MTRF1	86	55.352	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	85	55.795	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	83	55.795	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000019043	mtrf1	54	83.122	ENSNBRG00000004634	mtrf1	100	83.122	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.090	ENSNLEG00000001236	MTRF1	85	54.090	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	50.781	ENSMEUG00000001846	MTRF1	86	50.781	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	62	33.579	ENSOPRG00000006450	-	82	33.579	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.525	ENSODEG00000005782	MTRF1	86	53.525	Octodon_degus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	80.362	ENSONIG00000012476	mtrf1	99	80.362	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	68	58.725	ENSOANG00000003383	-	94	58.725	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	54.308	ENSOCUG00000025207	MTRF1	86	54.308	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	70.507	ENSORLG00000003225	mtrf1	97	70.507	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000019043	mtrf1	100	70.045	ENSORLG00020021048	mtrf1	98	70.045	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	70.507	ENSORLG00015020957	mtrf1	97	70.507	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	69.037	ENSOMEG00000002022	mtrf1	97	69.037	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000019043	mtrf1	75	49.693	ENSOGAG00000026411	-	100	49.693	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	80	56.571	ENSOGAG00000009719	-	78	56.571	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	91	53.030	ENSOARG00000006994	MTRF1	89	53.030	Ovis_aries
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.090	ENSPPAG00000000050	MTRF1	85	54.090	Pan_paniscus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	53.415	ENSPPRG00000009511	MTRF1	90	53.415	Panthera_pardus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	54.615	ENSPTIG00000006673	MTRF1	87	54.615	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.090	ENSPTRG00000005815	MTRF1	85	54.090	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	54.737	ENSPANG00000010809	MTRF1	85	54.737	Papio_anubis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	85	59.189	ENSPKIG00000015711	mtrf1	86	59.189	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	52.926	ENSPSIG00000004773	MTRF1	84	52.926	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	54	77.447	ENSPMGG00000006724	mtrf1	95	77.447	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	97	52.471	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	94	52.471	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	77	51.020	ENSPMAG00000009849	mtrf1	98	51.312	Petromyzon_marinus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	53.003	ENSPCIG00000012940	MTRF1	86	53.003	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.953	ENSPFOG00000000254	mtrf1	98	79.953	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.953	ENSPLAG00000014280	mtrf1	98	79.953	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.487	ENSPMEG00000023245	mtrf1	98	79.487	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000019043	mtrf1	53	77.155	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	77.155	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	53.562	ENSPPYG00000005313	MTRF1	85	53.562	Pongo_abelii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	54.047	ENSPCOG00000018133	MTRF1	86	54.047	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	53.846	ENSPVAG00000008573	MTRF1	85	53.846	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	54	83.544	ENSPNYG00000004357	mtrf1	96	83.544	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000019043	mtrf1	85	64.516	ENSPNAG00000010682	mtrf1	85	64.516	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	55.496	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	68.142	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	53.562	ENSRBIG00000007069	MTRF1	85	53.562	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000019043	mtrf1	87	53.562	ENSRROG00000035345	MTRF1	85	53.562	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	55.228	ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	55.228	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	79	56.069	ENSSHAG00000018109	MTRF1	85	56.069	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	59.690	ENSSFOG00015006191	mtrf1	88	59.690	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	69.676	ENSSMAG00000015740	mtrf1	97	69.676	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	73.455	ENSSDUG00000022608	mtrf1	85	73.455	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	74.142	ENSSLDG00000013584	mtrf1	85	74.142	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	49.635	ENSSARG00000002306	MTRF1	90	49.635	Sorex_araneus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	54	63.404	ENSSPUG00000007354	MTRF1	97	63.404	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	71.364	ENSSPAG00000000881	mtrf1	98	71.364	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	90	54.220	ENSSSCG00000009436	MTRF1	88	54.220	Sus_scrofa
ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	51.862	ENSTGUG00000012422	MTRF1	91	51.862	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000019043	mtrf1	99	69.195	ENSTRUG00000000396	mtrf1	97	69.195	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000019043	mtrf1	85	71.622	ENSTNIG00000017149	-	99	70.757	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	55	54.812	ENSTBEG00000004696	-	100	54.812	Tupaia_belangeri
ENSFHEG00000019043	mtrf1	88	54.308	ENSTTRG00000010370	MTRF1	86	54.308	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	54.103	ENSUMAG00000014772	MTRF1	87	54.103	Ursus_maritimus
ENSFHEG00000019043	mtrf1	94	51.582	ENSVPAG00000002565	MTRF1	90	51.582	Vicugna_pacos
ENSFHEG00000019043	mtrf1	89	54.264	ENSVVUG00000028755	MTRF1	87	54.264	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000019043	mtrf1	83	55.249	ENSXETG00000018904	mtrf1	94	55.249	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000019043	mtrf1	98	79.021	ENSXMAG00000009853	mtrf1	97	79.021	Xiphophorus_maculatus