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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000019234 (Gene tree)
Gene ID: 105918036
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin-1
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 29734 bases
Position: chrKN805814.1:343558-373291
Accession: 105918036
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000032609	IBN_N	PF03810.19	1.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000026137	-	7249	XM_012853018	ENSFHEP00000032609	891 (aa)	XP_012708472	UPI000644D67F

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	86.502	ENSFHEG00000016501	tnpo2	99	86.502
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	86.962	ENSFHEG00000009734	TNPO2	98	86.962

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.980	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.980	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.659	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.770	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.774	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.774	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.092	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	98.092	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.092	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	98.092	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.643	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.643	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	89.853	ENSAPLG00000009619	-	97	90.940	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	93.490	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	83.502	ENSANAG00000025351	-	99	83.502	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.154	ENSANAG00000022453	-	99	93.154	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	60.623	ENSANAG00000027118	-	99	60.576	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	95.286	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.286	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.619	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.395	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.490	Bos_taurus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.266	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	93.266	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.590	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.590	Canis_familiaris
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	91.134	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	91.134	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.378	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	93.378	Capra_hircus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	92.523	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.523	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.154	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	93.154	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.603	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.378	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	93.378	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	93.603	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	94	81.190	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.190	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	94.052	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	75.897	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.897	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	93.603	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	93.490	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.692	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.692	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.184	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	96.184	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.429	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.429	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.939	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.939	Danio_rerio
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	87.248	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	87.248	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	93	93.863	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.855	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	58.221	FBgn0035693	CG8219	99	57.995	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000019234	tnpo1	86	95.131	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000019234	tnpo1	94	86.088	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	86.088	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.603	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	93.603	Equus_caballus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	88.562	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.908	Esox_lucius
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.603	Felis_catus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.939	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.939	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.266	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	93.266	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.945	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.945	Gadus_morhua
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.817	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.154	Gallus_gallus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.870	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.870	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.072	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.072	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.164	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	94.164	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.603	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	78.475	ENSGGOG00000022535	-	98	78.475	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.082	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.082	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.154	ENSHGLG00000000970	-	99	93.154	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000019234	tnpo1	97	73.287	ENSHGLG00100000963	-	99	72.590	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.232	ENSHGLG00100017090	-	99	93.232	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.827	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	93.827	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.857	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.857	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	91	93.958	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.958	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	87.456	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.456	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.613	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.613	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	97	92.964	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.964	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	93.603	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.574	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	93.603	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	93.603	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.755	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.755	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.633	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.633	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	90.011	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	90.011	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	93.490	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.521	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.521	Mola_mola
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	94.468	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.468	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.296	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.296	Monopterus_albus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.266	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.378	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.266	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	93.603	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.140	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.140	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	93.603	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.645	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.645	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.603	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000019234	tnpo1	90	88.548	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.548	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.154	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	93.154	Octodon_degus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.321	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.321	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	92	94.641	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	94.641	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	87.515	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.515	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	87	96.632	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.632	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	96.959	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.959	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	97.297	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	97.297	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000019234	tnpo1	99	96.959	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.959	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	93.603	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	92.929	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.490	Ovis_aries
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	93.603	Pan_paniscus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.603	Panthera_pardus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.603	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000019234	tnpo1	94	82.459	ENSPTRG00000047731	-	100	82.459	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	93.603	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	93.603	Papio_anubis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	90.797	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.797	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.939	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.939	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.283	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	94.058	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	93.692	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.692	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	94.164	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	94.164	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.432	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	98.432	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.432	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.432	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.429	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.429	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.430	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.430	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.490	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	93.490	Pongo_abelii
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ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	93.603	Pteropus_vampyrus
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ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.274	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.722	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.715	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	93.715	Rattus_norvegicus
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ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	93.603	Rhinopithecus_roxellana
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ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	93.603	Vulpes_vulpes
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	91.919	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.919	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	98.204	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.204	Xiphophorus_maculatus