EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000020286 (Gene tree)
Gene ID: 105939407
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9931 bases
Position: chrKN805626.1:639458-649388
Accession: 105939407
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000018437	RRM_1	PF00076.22	2.1e-15	1	2
ENSFHEP00000018437	RRM_1	PF00076.22	2.1e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000027408	-	2943	XM_021307877	ENSFHEP00000018437	441 (aa)	XP_021163552	UPI000644E9EB

Gene Model

Click here to download ENSFHEG00000020286's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSFHEG00000020286's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	64.116	ENSG00000102241	HTATSF1	100	58.300	Homo_sapiens
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	80.837	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	80.837	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	80.174	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	81.758	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	78.525	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	79.393	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.258	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	80.131	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000020286	htatsf1	95	82.619	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	82.619	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	91	63.208	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.443	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	60.102	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	60.500	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.913	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	80.879	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	68.980	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	69.697	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	62.341	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	62.341	Bos_taurus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	79	38.028	WBGene00022025	Y65B4A.1	76	38.028	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000020286	htatsf1	81	64.946	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	64.467	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	64.721	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	63.889	Canis_familiaris
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	64.885	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	50	64.885	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.660	ENSCCAG00000025329	-	56	63.910	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.660	ENSCCAG00000022701	-	50	64.557	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	94	61.502	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	52	61.611	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	62.391	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	99	63.043	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000020286	htatsf1	88	44.872	ENSCING00000005914	-	88	45.170	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	84	43.396	ENSCSAVG00000000371	-	76	42.318	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.686	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	89.686	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	68.113	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	68.764	Danio_rerio
ENSFHEG00000020286	htatsf1	82	45.257	FBgn0037081	barc	65	44.986	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	52.584	ENSEBUG00000001534	htatsf1	88	52.584	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	62.661	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	64.592	Esox_lucius
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	63.359	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	63.359	Felis_catus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	60.345	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	60.345	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	95	60.656	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	60.656	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	81	77.933	ENSGMOG00000016444	htatsf1	98	77.933	Gadus_morhua
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	60.652	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.304	Gallus_gallus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.013	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	89.013	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	78.571	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	78.571	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.913	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	80.879	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	71.136	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	72.912	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	64.286	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	65.612	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.830	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	64.975	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	85.588	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.588	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	77.193	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.851	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	62.168	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.168	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	46.186	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.588	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	64.304	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.025	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	62.797	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	63.728	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	79.279	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	79.730	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	80.131	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	81.099	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000020286	htatsf1	93	62.238	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	97	61.949	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	64.644	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	65.903	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	61.741	ENSMICG00000009348	HTATSF1	53	60.563	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	65.067	ENSMOCG00000023007	-	50	65.903	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.418	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	79.418	Mola_mola
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	61.926	ENSMODG00000014087	-	98	61.926	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000020286	htatsf1	58	60.150	ENSMODG00000000199	-	92	58.367	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.379	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	79.379	Monopterus_albus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.467	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.377	Mus_caroli
ENSFHEG00000020286	htatsf1	97	57.208	ENSMLUG00000009234	-	52	61.069	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	63.904	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	64.541	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	80.131	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	81.099	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000020286	htatsf1	93	62.559	ENSMEUG00000004133	-	97	62.322	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	81.223	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	82.418	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	91	60.000	ENSOANG00000011674	-	99	60.000	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	77.851	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	78.070	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	77.293	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	77.511	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	77.533	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.753	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	78.681	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	78.681	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	63.613	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	63.613	Panthera_pardus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	67.538	ENSPKIG00000024852	htatsf1	100	67.174	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000020286	htatsf1	74	67.536	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	98	67.806	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	74.336	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	74.336	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	57.018	ENSPCIG00000018896	-	99	57.018	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	90	63.814	ENSPCIG00000030173	-	90	63.814	Phascolarctos_cinereus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.686	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	89.686	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.462	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	89.462	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.686	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	89.686	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.910	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	89.910	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000020286	htatsf1	94	62.207	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	52	62.207	Pongo_abelii
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	57.908	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	52	57.908	Procavia_capensis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	91	62.044	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	52	62.044	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000020286	htatsf1	85	64.230	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	52	64.230	Pteropus_vampyrus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	80.131	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	81.099	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	70.905	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	70.905	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000020286	htatsf1	95	62.181	ENSSBOG00000027186	-	55	62.181	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	81	63.889	ENSSBOG00000017914	-	50	63.918	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	88	65.641	ENSSHAG00000006440	-	97	65.641	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	61.369	ENSSHAG00000018908	-	97	60.927	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	61.229	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.447	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	77.655	ENSSMAG00000002970	htatsf1	98	78.319	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	76.053	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	76.889	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.956	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	81.153	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	93	58.432	ENSSARG00000005193	HTATSF1	56	58.432	Sorex_araneus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	59.870	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	99	60.087	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	79.869	ENSSPAG00000000732	htatsf1	100	80.744	Stegastes_partitus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	64.096	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	57	62.621	Sus_scrofa
ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	60.699	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	60.699	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	76.697	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	76.923	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	76.975	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	76.975	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	80	63.889	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	63.889	Tursiops_truncatus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	63.104	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	63.104	Ursus_americanus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	98	59.778	ENSXETG00000019749	htatsf1	83	59.778	Xenopus_tropicalis
ENSFHEG00000020286	htatsf1	96	88.028	ENSXCOG00000006912	htatsf1	96	88.028	Xiphophorus_couchianus
ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	88.565	ENSXMAG00000000490	htatsf1	100	88.565	Xiphophorus_maculatus