EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000020574 (Gene tree)
Gene ID: 105920307
Gene Symbol: cnot1
Alias: cdc39-like|im:7141761|kiaa1007l|wu:fc58h04|zgc:152902
Full Name: CCR4-NOT transcription complex subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28148 bases
Position: chrKN806053.1:145223-173370
Accession: 105920307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000033347	Not1	PF04054.15	3.8e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000027569	-	7137	XM_021312499	ENSFHEP00000033347	2378 (aa)	XP_021168174	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSG00000125107	CNOT1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.860	ENSAPOG00000005042	cnot1	100	92.944	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.172	ENSAMEG00000017298	CNOT1	100	90.214	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000020574	cnot1	90	94.129	ENSACIG00000016003	cnot1	100	94.501	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	94.748	ENSAPEG00000022342	cnot1	100	94.832	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.821	ENSATEG00000012892	cnot1	100	92.863	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	89.602	ENSAPLG00000007162	CNOT1	100	89.937	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000020574	cnot1	91	89.125	ENSACAG00000001602	CNOT1	98	88.843	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	87.542	ENSANAG00000038198	CNOT1	100	87.500	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.375	ENSACLG00000014234	cnot1	100	93.417	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.443	ENSAMXG00000013170	cnot1	100	93.653	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000020574	cnot1	95	95.609	ENSBTAG00000020782	CNOT1	100	95.609	Bos_taurus
ENSFHEG00000020574	cnot1	78	41.090	WBGene00002845	let-711	92	54.008	Caenorhabditis_elegans
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.256	ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	91.818	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.109	ENSCAFG00000008426	CNOT1	100	90.067	Canis_familiaris
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	89.456	ENSCAFG00020010156	CNOT1	100	92.445	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.424	ENSCHIG00000010452	CNOT1	100	90.466	Capra_hircus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.382	ENSTSYG00000006888	CNOT1	100	90.424	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	86.518	ENSCPOG00000013026	CNOT1	100	86.518	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	88.744	ENSCCAG00000026333	CNOT1	100	88.786	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSCATG00000032625	CNOT1	100	90.382	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSCLAG00000006289	CNOT1	100	90.340	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSCSAG00000004731	CNOT1	100	90.382	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000020574	cnot1	80	97.527	ENSCHOG00000009712	CNOT1	83	97.527	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000020574	cnot1	93	95.050	ENSCPBG00000026222	CNOT1	98	95.050	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	58.354	ENSCING00000009149	-	100	58.669	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000020574	cnot1	89	62.349	ENSCSAVG00000002414	-	99	62.315	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	88.616	ENSCANG00000040534	CNOT1	100	88.657	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.046	ENSCGRG00001016365	Cnot1	100	90.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.046	ENSCGRG00000001714	Cnot1	100	90.130	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000020574	cnot1	97	99.299	ENSCVAG00000018930	cnot1	100	99.299	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.704	ENSDARG00000004174	cnot1	100	92.411	Danio_rerio
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	88.203	ENSDNOG00000013250	CNOT1	100	88.161	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000020574	cnot1	99	45.696	FBgn0085436	Not1	96	53.085	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000020574	cnot1	84	93.524	ENSETEG00000012806	CNOT1	84	93.524	Echinops_telfairi
ENSFHEG00000020574	cnot1	81	76.042	ENSEBUG00000011534	cnot1	95	76.042	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000020574	cnot1	95	95.229	ENSEASG00005005819	CNOT1	100	95.609	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	90.382	Equus_caballus
ENSFHEG00000020574	cnot1	89	88.498	ENSEEUG00000006015	CNOT1	90	88.498	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.766	ENSELUG00000014085	cnot1	100	92.721	Esox_lucius
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.117	ENSFCAG00000025155	CNOT1	100	90.075	Felis_catus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.130	ENSFALG00000007285	CNOT1	100	90.172	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.298	ENSFDAG00000013399	CNOT1	100	90.298	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000020574	cnot1	91	93.287	ENSGMOG00000012864	cnot1	100	93.287	Gadus_morhua
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	89.962	ENSGALG00000002301	CNOT1	100	90.004	Gallus_gallus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	96.049	ENSGAFG00000015005	cnot1	100	96.091	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000020574	cnot1	91	94.910	ENSGACG00000002606	cnot1	100	97.576	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.256	ENSGAGG00000022646	CNOT1	100	91.679	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.382	ENSGGOG00000009547	CNOT1	100	90.424	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.459	ENSHBUG00000001729	cnot1	100	93.501	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.214	ENSHGLG00000014322	CNOT1	100	90.256	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	94.014	ENSHCOG00000006501	cnot1	100	93.889	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	91.488	ENSIPUG00000011915	cnot1	100	91.279	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.264	ENSSTOG00000005490	CNOT1	100	90.222	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	89.752	ENSJJAG00000000633	Cnot1	100	89.752	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	95.936	ENSKMAG00000006149	cnot1	100	95.936	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000020574	cnot1	95	97.804	ENSLBEG00000004740	cnot1	100	97.804	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.634	ENSLACG00000010869	CNOT1	100	90.592	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.749	ENSLOCG00000006324	cnot1	100	92.833	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.222	ENSLAFG00000000098	CNOT1	100	90.180	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.130	ENSMFAG00000035888	CNOT1	100	90.172	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.298	ENSMMUG00000014625	CNOT1	94	98.545	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	87.814	ENSMNEG00000031820	CNOT1	100	90.121	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	88.987	ENSMLEG00000040933	CNOT1	100	88.945	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.025	ENSMAMG00000016524	cnot1	100	93.067	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.306	ENSMZEG00005016210	cnot1	100	90.306	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	89.794	ENSMGAG00000001908	CNOT1	100	89.836	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.370	ENSMICG00000007071	CNOT1	100	90.420	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.130	ENSMOCG00000017969	Cnot1	100	90.130	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	91.516	ENSMMOG00000019134	cnot1	100	91.516	Mola_mola
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.008	ENSMODG00000014199	CNOT1	100	89.966	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.697	ENSMALG00000008645	cnot1	100	93.739	Monopterus_albus
ENSFHEG00000020574	cnot1	95	95.238	MGP_CAROLIEiJ_G0031430	Cnot1	92	95.238	Mus_caroli
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.172	ENSMUSG00000036550	Cnot1	100	90.172	Mus_musculus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.172	MGP_PahariEiJ_G0023028	Cnot1	100	90.172	Mus_pahari
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.172	MGP_SPRETEiJ_G0032549	Cnot1	100	90.172	Mus_spretus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.382	ENSMPUG00000004830	CNOT1	100	90.424	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.424	ENSMLUG00000003728	CNOT1	100	90.424	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.214	ENSNGAG00000018628	Cnot1	100	90.214	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000020574	cnot1	97	88.043	ENSNBRG00000019358	cnot1	100	88.043	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.336	ENSNLEG00000003566	CNOT1	100	90.252	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000020574	cnot1	87	90.604	ENSMEUG00000006145	CNOT1	87	90.604	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000020574	cnot1	86	97.778	ENSOPRG00000005604	CNOT1	86	97.778	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.256	ENSODEG00000016337	CNOT1	100	90.256	Octodon_degus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	95.094	ENSONIG00000007358	cnot1	100	95.178	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000020574	cnot1	91	89.239	ENSOANG00000012109	CNOT1	100	90.150	Ornithorhynchus_anatinus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.382	ENSOCUG00000006911	CNOT1	100	90.424	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	95.216	ENSORLG00000013734	cnot1	100	95.216	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.401	ENSORLG00020017012	cnot1	100	93.401	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.359	ENSORLG00015007091	cnot1	100	93.359	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	92.782	ENSOMEG00000015124	cnot1	100	92.363	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSOGAG00000000543	CNOT1	100	90.382	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.424	ENSOARG00000001567	CNOT1	100	90.466	Ovis_aries
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.340	ENSPPAG00000022013	CNOT1	100	90.382	Pan_paniscus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.382	ENSPPRG00000004867	CNOT1	100	90.424	Panthera_pardus
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.382	ENSPTIG00000012589	CNOT1	100	90.424	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.075	ENSPTRG00000008183	CNOT1	100	90.034	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	87.327	ENSPANG00000020901	CNOT1	100	87.369	Papio_anubis
ENSFHEG00000020574	cnot1	99	86.558	ENSPKIG00000002914	CNOT1	99	86.309	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	93.004	ENSPKIG00000023538	CNOT1	100	92.701	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000020574	cnot1	100	90.046	ENSPSIG00000005499	CNOT1	100	90.088	Pelodiscus_sinensis
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