EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000020824 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 78661 bases
Position: chrKN811400.1:779824-858484
Accession: 105933063
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000018812	Wyosine_form	PF08608.12	2e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000027907	-	2235	XM_021321456	ENSFHEP00000018812	744 (aa)	XP_021177131	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.982	ENSG00000198874	TYW1	83	69.467	Homo_sapiens
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	62.359	ENSG00000277149	TYW1B	88	62.701	Homo_sapiens
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.306	ENSAPOG00000014391	tyw1	81	83.306	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	81.331	ENSACIG00000007325	tyw1	85	81.331	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.713	ENSAOCG00000016792	tyw1	81	83.713	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.713	ENSAPEG00000015939	tyw1	89	78.013	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000020824	tyw1	79	73.977	ENSATEG00000006856	tyw1	84	73.977	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.116	ENSANAG00000037051	-	83	68.174	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.945	ENSACLG00000018688	tyw1	81	80.945	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000020824	tyw1	85	71.689	ENSAMXG00000004157	tyw1	88	76.873	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.770	ENSBTAG00000008446	TYW1	83	67.460	Bos_taurus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.871	ENSCJAG00000004295	-	83	68.871	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.915	ENSCAFG00000010867	-	82	68.893	Canis_familiaris
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	60.743	ENSCAFG00020005367	-	88	60.835	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.932	ENSCHIG00000019510	-	83	68.932	Capra_hircus
ENSFHEG00000020824	tyw1	71	68.978	ENSTSYG00000008236	-	87	64.652	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	61.551	ENSCAPG00000013569	-	95	61.551	Cavia_aperea
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.134	ENSCPOG00000011182	-	83	66.134	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.243	ENSCCAG00000026643	-	83	69.144	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.447	ENSCATG00000043677	-	88	64.563	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.397	ENSCLAG00000006321	-	82	66.451	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000020824	tyw1	72	67.754	ENSCSAG00000018274	-	81	68.478	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.481	ENSCPBG00000014896	-	80	69.854	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000020824	tyw1	79	57.763	ENSCING00000004125	-	97	57.429	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000020824	tyw1	79	53.167	ENSCSAVG00000005712	-	97	49.438	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.447	ENSCANG00000033209	-	83	69.094	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	57	73.210	ENSCGRG00001003679	Tyw1	73	73.210	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	77.634	ENSCSEG00000005810	tyw1	80	77.974	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000020824	tyw1	76	80.847	ENSCVAG00000001054	tyw1	83	80.847	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	89	69.016	ENSDARG00000062987	tyw1	89	70.425	Danio_rerio
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.971	ENSDNOG00000024165	-	83	68.821	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000020824	tyw1	82	60.806	ENSDORG00000014772	Tyw1	89	59.905	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000020824	tyw1	56	72.685	ENSEBUG00000004494	tyw1	88	72.685	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.741	ENSEASG00005008818	-	83	70.388	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	62.704	ENSECAG00000023164	-	82	62.378	Equus_caballus
ENSFHEG00000020824	tyw1	82	73.829	ENSELUG00000008449	tyw1	84	74.959	Esox_lucius
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.106	ENSFCAG00000014262	-	82	68.506	Felis_catus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	64.878	ENSFALG00000013810	-	83	65.747	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	65.802	ENSFDAG00000013270	-	83	66.288	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.480	ENSGALG00000001110	-	82	68.019	Gallus_gallus
ENSFHEG00000020824	tyw1	89	71.988	ENSGACG00000012692	tyw1	94	71.988	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.669	ENSGAGG00000022393	-	82	69.368	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000020824	tyw1	71	59.707	ENSGGOG00000001473	TYW1	86	57.692	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.619	ENSHBUG00000002640	tyw1	81	80.619	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	64.332	ENSHGLG00000012093	-	94	64.332	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.290	ENSHGLG00100011743	TYW1	83	66.774	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.026	ENSHCOG00000019949	tyw1	82	68.026	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000020824	tyw1	87	71.084	ENSIPUG00000016330	tyw1	86	71.536	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.314	ENSSTOG00000004067	-	76	67.799	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	65.806	ENSJJAG00000022959	Tyw1	84	66.667	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.062	ENSKMAG00000018599	tyw1	81	83.062	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.932	ENSLACG00000018917	tyw1	81	69.305	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	72.771	ENSLOCG00000004035	tyw1	81	72.375	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.608	ENSMFAG00000035457	-	83	69.256	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.608	ENSMMUG00000030374	-	88	65.858	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.608	ENSMNEG00000041992	-	83	69.256	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.608	ENSMLEG00000039741	-	83	69.256	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	82.114	ENSMAMG00000016089	tyw1	86	77.868	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.000	ENSMZEG00005024386	tyw1	89	80.000	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.857	ENSMGAG00000002176	-	83	68.019	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.695	ENSMAUG00000002959	Tyw1	84	67.695	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.116	ENSMICG00000014374	-	88	64.782	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.775	ENSMOCG00000017720	Tyw1	84	66.083	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	75.081	ENSMMOG00000005064	tyw1	83	76.547	Mola_mola
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.044	ENSMODG00000025697	-	83	68.174	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	82.382	ENSMALG00000010238	tyw1	81	82.382	Monopterus_albus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.558	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	84	66.558	Mus_caroli
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.045	ENSMUSG00000056310	Tyw1	84	67.045	Mus_musculus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.992	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	84	67.317	Mus_pahari
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.396	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	84	66.721	Mus_spretus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.967	ENSMPUG00000016191	-	87	67.370	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	65.811	ENSMLUG00000013582	-	83	65.811	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.775	ENSNGAG00000002742	Tyw1	85	66.775	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	76.748	ENSNBRG00000016996	tyw1	87	76.748	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.328	ENSNLEG00000013210	-	87	64.943	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000020824	tyw1	71	71.905	ENSOPRG00000008734	-	69	71.905	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	62.298	ENSODEG00000014729	-	88	61.874	Octodon_degus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	79.805	ENSONIG00000005872	tyw1	81	79.805	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.742	ENSOCUG00000003173	-	83	67.799	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.630	ENSORLG00000001393	tyw1	81	78.990	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.303	ENSORLG00020019361	tyw1	82	78.664	Oryzias_latipes_hni
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.049	ENSORLG00015008095	tyw1	81	78.409	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.760	ENSOGAG00000016555	-	83	68.982	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.280	ENSOARG00000010673	-	83	69.021	Ovis_aries
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.106	ENSPPRG00000004945	-	88	65.366	Panthera_pardus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.106	ENSPTIG00000019545	-	83	68.506	Panthera_tigris_altaica
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	62.821	ENSPTRG00000023076	TYW1B	87	60.905	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.447	ENSPANG00000019053	-	87	65.696	Papio_anubis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	70.847	ENSPKIG00000006545	tyw1	80	71.336	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000020824	tyw1	86	74.885	ENSPMGG00000004240	tyw1	93	75.038	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.071	ENSPEMG00000008274	Tyw1	84	67.250	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.604	ENSPFOG00000015855	tyw1	83	83.604	Poecilia_formosa
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	82.573	ENSPLAG00000000838	tyw1	81	83.876	Poecilia_latipinna
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	82.410	ENSPMEG00000019437	tyw1	81	83.713	Poecilia_mexicana
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	77.362	ENSPREG00000018773	tyw1	81	77.850	Poecilia_reticulata
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.821	ENSPPYG00000017514	TYW1	83	69.144	Pongo_abelii
ENSFHEG00000020824	tyw1	72	59.640	ENSPCOG00000015294	-	86	57.324	Propithecus_coquereli
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	80.945	ENSPNYG00000022381	tyw1	81	80.945	Pundamilia_nyererei
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	75.041	ENSPNAG00000009001	tyw1	83	76.672	Pygocentrus_nattereri
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.045	ENSRNOG00000024352	Tyw1	84	66.989	Rattus_norvegicus
ENSFHEG00000020824	tyw1	83	66.929	ENSRBIG00000039619	-	87	67.559	Rhinopithecus_bieti
ENSFHEG00000020824	tyw1	83	66.929	ENSRROG00000039780	-	88	68.489	Rhinopithecus_roxellana
ENSFHEG00000020824	tyw1	80	40.289	YPL207W	-	66	39.807	Saccharomyces_cerevisiae
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	67.794	ENSSBOG00000025873	-	83	67.851	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	66.883	ENSSHAG00000010346	-	84	67.468	Sarcophilus_harrisii
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	72.964	ENSSFOG00015001054	tyw1	88	69.805	Scleropages_formosus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	81.107	ENSSMAG00000020514	tyw1	81	81.107	Scophthalmus_maximus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	82.172	ENSSDUG00000001552	tyw1	86	82.382	Seriola_dumerili
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	81.804	ENSSLDG00000003554	tyw1	81	81.804	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	65.472	ENSSPUG00000002715	-	82	66.288	Sphenodon_punctatus
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.285	ENSSSCG00000007733	-	83	68.871	Sus_scrofa
ENSFHEG00000020824	tyw1	72	67.153	ENSTGUG00000003428	-	81	68.124	Taeniopygia_guttata
ENSFHEG00000020824	tyw1	86	76.900	ENSTRUG00000016107	tyw1	85	76.900	Takifugu_rubripes
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	78.080	ENSTNIG00000018999	tyw1	93	78.080	Tetraodon_nigroviridis
ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.218	ENSUMAG00000015343	-	88	65.167	Ursus_maritimus
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ENSFHEG00000020824	tyw1	81	69.756	ENSXETG00000010094	tyw1	83	69.544	Xenopus_tropicalis
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