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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000021250 (Gene tree)
Gene ID: 105938161
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 77302 bases
Position: chrKN811535.1:837928-915229
Accession: 105938161
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000019078	BRK	PF07533.16	2.1e-17	1	1
ENSFHEP00000019097	BRK	PF07533.16	2.2e-17	1	1
ENSFHEP00000033684	BRK	PF07533.16	2.2e-17	1	1
ENSFHEP00000033679	BRK	PF07533.16	2.2e-17	1	1
ENSFHEP00000033661	BRK	PF07533.16	8.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000028259	SMARCA2-204	8039	XM_012879806	ENSFHEP00000019097	1597 (aa)	XP_012735260	UPI00064500FE
ENSFHET00000028215	SMARCA2-202	7489	-	ENSFHEP00000033684	1597 (aa)	-	UPI00064500FE
ENSFHET00000028199	SMARCA2-201	5610	-	ENSFHEP00000033679	1605 (aa)	-	-
ENSFHET00000034615	SMARCA2-205	4719	-	ENSFHEP00000033661	1572 (aa)	-	-
ENSFHET00000028228	SMARCA2-203	7979	XM_021307194	ENSFHEP00000019078	1577 (aa)	XP_021162869	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	93	71.355	ENSFHEG00000010182	smarca4a	99	71.578
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	95	70.866	ENSFHEG00000007902	-	99	70.610

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.319	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.308	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	91.812	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	89	77.572	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	86.083	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.075	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.308	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.625	ENSAOCG00000009647	-	100	92.125	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.308	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	92.000	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	92.586	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	92.332	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	87	78.658	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.978	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.279	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.585	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.128	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	80.498	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.823	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	91.271	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	84.828	ENSAMXG00000012404	smarca2	99	84.451	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.504	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	81.246	Bos_taurus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.618	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.102	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.724	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	81.084	Canis_familiaris
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	75	85.581	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.937	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.697	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	81.246	Capra_hircus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.888	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	81.262	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	78.650	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	78.650	Cavia_aperea
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.309	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.562	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.383	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	80.748	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.129	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.225	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.626	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.810	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	91	81.545	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.538	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	83	80.025	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	82.225	Choloepus_hoffmanni
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	82.140	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	84.039	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.128	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.651	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	75.160	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	75.422	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	86.081	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	85.678	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	85	90.801	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	93.025	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	83.727	ENSDARG00000008904	smarca2	100	83.230	Danio_rerio
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.319	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	80.161	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.319	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.575	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	77	62.114	FBgn0000212	brm	93	53.026	Drosophila_melanogaster
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	87	61.158	ENSEBUG00000002449	-	95	62.373	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	95	69.348	ENSEBUG00000011442	-	97	68.612	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.401	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	80.958	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	61	94.118	ENSEEUG00000015540	-	70	88.462	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	95	82.529	ENSELUG00000010318	smarca2	99	81.097	Esox_lucius
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.401	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	80.832	Felis_catus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.127	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	81.727	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.031	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	79.372	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	81.992	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.928	Gadus_morhua
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.013	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.248	Gallus_gallus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	93	88.430	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	88.709	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	88.232	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	87.791	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.127	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.000	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.367	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	98	82.330	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	91.812	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	91.880	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	82	83.511	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	80.657	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.808	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	80.943	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	89	82.636	ENSHCOG00000015348	-	97	85.856	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	83.013	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	84.838	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.064	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.561	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.141	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	80.637	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	93.504	ENSKMAG00000015844	-	100	93.567	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	82.420	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	81.672	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.719	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	80.398	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.935	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	80.718	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.000	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.538	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.279	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	80.651	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	90	86.577	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	80.650	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.657	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.657	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.000	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	92.067	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	74	68.956	ENSMGAG00000005160	-	100	60.856	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.155	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.905	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.651	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.512	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	86.122	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	86.697	Mola_mola
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.370	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.423	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	98	92.631	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.308	Monopterus_albus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	96	81.048	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	80.314	Mus_caroli
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	96	81.072	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	96	81.113	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	80.808	Mus_pahari
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	96	79.987	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	81	84.194	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	85.659	Mustela_putorius_furo
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	76.718	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.909	Myotis_lucifugus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.795	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	80.151	Nannospalax_galili
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	89	86.280	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	87.015	Neolamprologus_brichardi
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.124	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.874	Nomascus_leucogenys
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	93	75.758	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	73.491	Notamacropus_eugenii
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	81	80.219	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	76.259	Ochotona_princeps
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	78.732	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	80.063	Octodon_degus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	91.756	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	91.441	Oreochromis_niloticus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.038	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	79.975	Oryctolagus_cuniculus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.744	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	90.619	Oryzias_latipes
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.807	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	90.682	Oryzias_latipes_hsok
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.482	ENSOMEG00000009736	-	100	90.294	Oryzias_melastigma
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	78.250	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.912	Otolemur_garnettii
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.871	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	80.453	Ovis_aries
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.971	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	81.463	Pan_paniscus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.466	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	80.895	Panthera_pardus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.872	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.249	Pan_troglodytes
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	75.763	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	76.846	Papio_anubis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	83.583	ENSPKIG00000018469	-	100	83.038	Paramormyrops_kingsleyae
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.694	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	79.727	Pelodiscus_sinensis
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	83.280	ENSPMGG00000013696	-	98	83.792	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.796	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.551	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	95	71.046	ENSPMAG00000005337	-	97	70.248	Petromyzon_marinus
ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	80.115	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	80.554	Phascolarctos_cinereus
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ENSFHEG00000021250	SMARCA2	99	95.820	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	96.010	Poecilia_latipinna
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ENSFHEG00000021250	SMARCA2	88	93.737	ENSXCOG00000011073	SMARCA2	99	93.880	Xiphophorus_couchianus
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