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Description

Ensembl ID: ENSFHEG00000023271 (Gene tree)
Gene ID: 105928863
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Fundulus_heteroclitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38910 bases
Position: chrKN811330.1:2124097-2163006
Accession: 105928863
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSFHEP00000021270	Xpo1	PF08389.12	2.1e-23	1	1
ENSFHEP00000000184	Xpo1	PF08389.12	2.1e-23	1	1
ENSFHEP00000021268	Xpo1	PF08389.12	2.3e-23	1	1
ENSFHEP00000021282	Xpo1	PF08389.12	2.3e-23	1	1
ENSFHEP00000021268	IBN_N	PF03810.19	1.5e-10	1	1
ENSFHEP00000021282	IBN_N	PF03810.19	1.5e-10	1	1
ENSFHEP00000021270	IBN_N	PF03810.19	2.2e-10	1	1
ENSFHEP00000000184	IBN_N	PF03810.19	6.8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSFHET00000015928	-	4993	-	ENSFHEP00000021282	961 (aa)	-	-
ENSFHET00000015935	-	2598	-	ENSFHEP00000000184	865 (aa)	-	-
ENSFHET00000015933	-	5158	XM_012866387	ENSFHEP00000021268	961 (aa)	XP_012721841	UPI000644EABE
ENSFHET00000015930	-	4852	-	ENSFHEP00000021270	914 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	67.459	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.456

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSG00000117408	IPO13	99	81.315	Homo_sapiens
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	69.835	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	69.731	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.815	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	97.815	Acanthochromis_polyacanthus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.962	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	81.420	Ailuropoda_melanoleuca
ENSFHEG00000023271	ipo13	97	70.074	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	70.116	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000023271	ipo13	96	92.717	ENSACIG00000008146	ipo13	100	92.500	Amphilophus_citrinellus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.698	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	68.595	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.503	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	97.503	Amphiprion_ocellaris
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.399	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	97.399	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.802	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.698	Amphiprion_percula
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.503	ENSATEG00000018367	ipo13	100	97.503	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000023271	ipo13	97	68.995	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	68.849	Anabas_testudineus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.962	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	81.962	Anas_platyrhynchos
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	82.595	ENSACAG00000014300	IPO13	99	82.595	Anolis_carolinensis
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSANAG00000034183	IPO13	99	81.551	Aotus_nancymaae
ENSFHEG00000023271	ipo13	96	97.505	ENSACLG00000011458	ipo13	100	97.505	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	69.485	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	69.318	Astatotilapia_calliptera
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	64.421	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	64.421	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	91.164	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	91.164	Astyanax_mexicanus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.329	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	80.793	Bos_taurus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.962	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	81.656	Callithrix_jacchus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	81.211	Canis_familiaris
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	81.211	Canis_lupus_dingo
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.435	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	80.898	Capra_hircus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	81.420	Carlito_syrichta
ENSFHEG00000023271	ipo13	87	81.720	ENSCAPG00000001972	IPO13	96	82.341	Cavia_aperea
ENSFHEG00000023271	ipo13	98	81.450	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	81.144	Cavia_porcellus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.962	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	81.656	Cebus_capucinus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSCATG00000041276	IPO13	99	81.315	Cercocebus_atys
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.540	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	81.002	Chinchilla_lanigera
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	81.315	Chlorocebus_sabaeus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	77.644	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	82.334	Chrysemys_picta_bellii
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	38.229	ENSCING00000001863	-	100	38.150	Ciona_intestinalis
ENSFHEG00000023271	ipo13	96	40.816	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.688	Ciona_savignyi
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSCANG00000009091	IPO13	99	81.315	Colobus_angolensis_palliatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	80.696	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	80.398	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	80.696	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	80.398	Cricetulus_griseus_crigri
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	63.098	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	63.098	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	93.444	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	93.444	Cynoglossus_semilaevis
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	98.231	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	98.231	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	97	66.383	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	100	66.383	Cyprinodon_variegatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	91.043	ENSDARG00000060618	ipo13	99	91.043	Danio_rerio
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	65.964	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	65.964	Danio_rerio
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.540	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	81.172	Dasypus_novemcinctus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	81.447	Dipodomys_ordii
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.685	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	68.035	Eptatretus_burgeri
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	ENSEASG00005001738	IPO13	99	81.211	Equus_asinus_asinus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	ENSECAG00000015508	IPO13	99	81.211	Equus_caballus
ENSFHEG00000023271	ipo13	69	85.979	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	85.979	Erinaceus_europaeus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	93.548	ENSELUG00000001498	ipo13	100	93.548	Esox_lucius
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	66.701	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	66.735	Esox_lucius
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	81.315	Felis_catus
ENSFHEG00000023271	ipo13	95	82.225	ENSFALG00000005368	IPO13	100	82.225	Ficedula_albicollis
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.435	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	80.898	Fukomys_damarensis
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	59.526	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	60.104	Gadus_morhua
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	95.842	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	95.842	Gadus_morhua
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	81.686	ENSGALG00000010087	IPO13	100	81.686	Gallus_gallus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	67.149	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	67.149	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	98.439	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	98.439	Gambusia_affinis
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.944	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	68.944	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	94.595	ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.595	Gasterosteus_aculeatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	98	82.553	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	82.553	Gopherus_agassizii
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	81.315	Gorilla_gorilla
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.557	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	68.388	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.294	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	97.294	Haplochromis_burtoni
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.224	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	80.922	Heterocephalus_glaber_female
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.224	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	80.922	Heterocephalus_glaber_male
ENSFHEG00000023271	ipo13	97	64.217	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	64.217	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	92.612	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	94.937	Hippocampus_comes
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	59.812	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	100	59.812	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	90.010	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	90.010	Ictalurus_punctatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.211	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.540	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	81.237	Jaculus_jaculus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	97.272	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	97.272	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	69.215	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	69.278	Kryptolebias_marmoratus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	95.005	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.278	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	68.134	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	67.635	Labrus_bergylta
ENSFHEG00000023271	ipo13	98	77.436	ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.436	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000023271	ipo13	88	31.868	ENSLACG00000002351	TNPO3	82	32.031	Latimeria_chalumnae
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	84.519	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	84.519	Lepisosteus_oculatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	80.021	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	79.728	Loxodonta_africana
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	81.315	Macaca_fascicularis
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	81.315	Macaca_mulatta
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	81.315	Macaca_nemestrina
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.857	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	81.315	Mandrillus_leucophaeus
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	96.878	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	96.878	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	69.318	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	69.770	Mastacembelus_armatus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	69.381	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	69.215	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000023271	ipo13	100	97.294	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	97.294	Maylandia_zebra
ENSFHEG00000023271	ipo13	98	80.831	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	80.831	Meleagris_gallopavo
ENSFHEG00000023271	ipo13	85	82.065	ENSMAUG00000013018	Ipo13	99	82.368	Mesocricetus_auratus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	77.637	ENSMICG00000011003	IPO13	99	77.140	Microcebus_murinus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.118	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	80.818	Microtus_ochrogaster
ENSFHEG00000023271	ipo13	98	94.456	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	94.456	Mola_mola
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	66.389	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	66.527	Mola_mola
ENSFHEG00000023271	ipo13	95	81.025	ENSMODG00000003017	IPO13	100	81.025	Monodelphis_domestica
ENSFHEG00000023271	ipo13	84	70.149	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	69.018	Monopterus_albus
ENSFHEG00000023271	ipo13	96	94.788	ENSMALG00000010805	ipo13	100	94.788	Monopterus_albus
ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.435	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	99	81.132	Mus_caroli
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