Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000552491 | LIMA1-212 | 2652 | - | ENSP00000448463 | 456 (aa) | - | F8VS07 |
ENST00000552823 | LIMA1-215 | 3254 | - | ENSP00000450266 | 599 (aa) | - | Q9UHB6 |
ENST00000551486 | LIMA1-207 | 587 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000552045 | LIMA1-210 | 386 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000552008 | LIMA1-209 | 566 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000552720 | LIMA1-213 | 2457 | - | ENSP00000448411 | 388 (aa) | - | F8VRN8 |
ENST00000550611 | LIMA1-206 | 543 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000551691 | LIMA1-208 | 583 | - | ENSP00000447975 | 130 (aa) | - | F8VTU2 |
ENST00000550592 | LIMA1-205 | 567 | - | ENSP00000449890 | 111 (aa) | - | F8VVQ7 |
ENST00000341247 | LIMA1-201 | 3706 | - | ENSP00000340184 | 759 (aa) | - | Q9UHB6 |
ENST00000394943 | LIMA1-202 | 3669 | XM_011538455 | ENSP00000378400 | 760 (aa) | XP_011536757 | Q9UHB6 |
ENST00000547825 | LIMA1-203 | 3920 | XM_017019429 | ENSP00000448706 | 457 (aa) | XP_016874918 | Q9UHB6 |
ENST00000549064 | LIMA1-204 | 648 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000552909 | LIMA1-216 | 2162 | - | ENSP00000450087 | 598 (aa) | - | F8VQE1 |
ENST00000552338 | LIMA1-211 | 555 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000552783 | LIMA1-214 | 3612 | - | ENSP00000448779 | 600 (aa) | - | Q9UHB6 |
ensgID | Trait | pValue | Pubmed ID |
---|---|---|---|
ENSG00000050405 | Echocardiography | 4.01082721609348E-6 | 17903301 |
ENSG00000050405 | Echocardiography | 9.78048970368356E-8 | 17903301 |
ENSG00000050405 | Echocardiography | 1.01770834392633E-7 | 17903301 |
ENSG00000050405 | Intelligence Tests | 2.9409800E-005 | - |
ENSG00000050405 | Child Development Disorders, Pervasive | 4.9777200E-005 | - |
ENSG00000050405 | Colorectal Neoplasms | 3E-8 | 24737748 |
ENSG00000050405 | Colorectal Neoplasms | 3E-6 | 26621817 |
ENSG00000050405 | Endometrial Neoplasms | 3E-6 | 26621817 |
ENSG00000050405 | Schizophrenia | 5E-6 | 26198764 |
ensgID | SNP | Chromosome | Position | SNP-risk | Trait | PubmedID | 95% CI | Or or BEAT | EFO ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000050405 | rs12817211 | 12 | 50185615 | C | Colorectal or endometrial cancer | 26621817 | [1.07-1.18] | 1.12 | EFO_0005842|EFO_0004230 |
ENSG00000050405 | rs4459386 | 12 | 50201164 | A | Schizophrenia | 26198764 | [NR] | 1.05 | EFO_0000692 |
ENSG00000050405 | rs34245511 | 12 | 50179650 | C | Colorectal cancer | 24737748 | [NR] | 1.144 | EFO_0005842 |
ENSG00000050405 | rs4883481 | 12 | 50180528 | ? | Systolic blood pressure | 30595370 | EFO_0006335 | ||
ENSG00000050405 | rs2302900 | 12 | 50205926 | ? | White blood cell count | 30595370 | EFO_0004308 | ||
ENSG00000050405 | rs4883482 | 12 | 50183134 | ? | Cardiovascular disease | 30595370 | EFO_0000319 | ||
ENSG00000050405 | rs2160994 | 12 | 50256274 | ? | Eosinophil counts | 30595370 | EFO_0004842 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ENSG00000050405 | LIMA1 | 98 | 82.569 | ENSMUSG00000023022 | Lima1 | 100 | 82.569 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0001725 | stress fiber | 10618726. | IDA | Component |
GO:0001726 | ruffle | - | ISS | Component |
GO:0003785 | actin monomer binding | 12566430. | IDA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 18093941.20309963.24694988.29880681. | IPI | Function |
GO:0005829 | cytosol | - | IDA | Component |
GO:0005886 | plasma membrane | - | IDA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 21423176. | HDA | Component |
GO:0005925 | focal adhesion | 10618726.24694988. | IDA | Component |
GO:0008203 | cholesterol metabolic process | - | IEA | Process |
GO:0015629 | actin cytoskeleton | - | IDA | Component |
GO:0016477 | cell migration | - | ISS | Process |
GO:0030299 | intestinal cholesterol absorption | - | ISS | Process |
GO:0030835 | negative regulation of actin filament depolymerization | 12566430. | IDA | Process |
GO:0031526 | brush border membrane | - | ISS | Component |
GO:0031529 | ruffle organization | 12566430. | IDA | Process |
GO:0032154 | cleavage furrow | 20309963. | IDA | Component |
GO:0042632 | cholesterol homeostasis | - | ISS | Process |
GO:0045296 | cadherin binding | 25468996. | HDA | Function |
GO:0046872 | metal ion binding | - | IEA | Function |
GO:0051015 | actin filament binding | 12566430. | IDA | Function |
GO:0051017 | actin filament bundle assembly | 12566430. | IDA | Process |
Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
---|---|---|---|---|---|---|---|
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BLCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
BRCA | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
CESC | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
COAD | |||||||
ESCA | |||||||
ESCA | |||||||
ESCA | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
GBM | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
HNSC | |||||||
KICH | |||||||
KIRC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRC | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
KIRP | |||||||
LAML | |||||||
LGG | |||||||
LGG | |||||||
LGG | |||||||
LIHC | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUAD | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
LUSC | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
OV | |||||||
PAAD | |||||||
PAAD | |||||||
PAAD | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
READ | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
SKCM | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
STAD | |||||||
THCA | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCEC | |||||||
UCS |
Cancer | Type | Freq | Q-value |
---|---|---|---|
DLBC | |||
READ | |||
STAD |
Cancer | P-value | Q-value |
---|---|---|
THYM | ||
KIRC | ||
ACC | ||
HNSC | ||
PAAD | ||
UVM |