Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000623321 | ATRX-211 | 1860 | - | ENSP00000485127 | 528 (aa) | - | A0A096LNN3 |
ENST00000460639 | ATRX-204 | 461 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000623706 | ATRX-212 | 7245 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000493470 | ATRX-207 | 2967 | - | ENSP00000485408 | 293 (aa) | - | A0A096LP59 |
ENST00000625063 | ATRX-219 | 593 | - | ENSP00000485099 | 198 (aa) | - | A0A096LNL6 |
ENST00000637175 | ATRX-223 | 100 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000400866 | ATRX-203 | 814 | - | ENSP00000383663 | 198 (aa) | - | H0Y3T0 |
ENST00000623242 | ATRX-209 | 725 | - | ENSP00000485183 | 66 (aa) | - | A0A096LNR8 |
ENST00000636152 | ATRX-221 | 100 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000624166 | ATRX-214 | 4272 | - | ENSP00000485103 | 1351 (aa) | - | A0A096LNL9 |
ENST00000623316 | ATRX-210 | 803 | - | ENSP00000485274 | 175 (aa) | - | A0A096LNX6 |
ENST00000395603 | ATRX-202 | 10218 | XM_005262157 | ENSP00000378967 | 2454 (aa) | XP_005262214 | P46100 |
ENST00000624668 | ATRX-217 | 583 | - | ENSP00000485100 | 108 (aa) | - | A0A096LNL7 |
ENST00000624766 | ATRX-218 | 580 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000479487 | ATRX-205 | 408 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000622960 | ATRX-208 | 628 | - | ENSP00000485587 | 47 (aa) | - | A0A096LPG6 |
ENST00000624032 | ATRX-213 | 3071 | - | ENSP00000485253 | 954 (aa) | - | A0A096LNW1 |
ENST00000480283 | ATRX-206 | 10455 | - | ENSP00000480196 | 164 (aa) | - | A0A087WWG0 |
ENST00000624403 | ATRX-216 | 583 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000636868 | ATRX-222 | 100 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000373344 | ATRX-201 | 11167 | XM_005262153 | ENSP00000362441 | 2492 (aa) | XP_005262210 | P46100 |
ENST00000637959 | ATRX-224 | 86 | - | - | - (aa) | - | - |
ENST00000635865 | ATRX-220 | 100 | - | ENSP00000490150 | 6 (aa) | - | UPI0007E52B90 |
ENST00000624193 | ATRX-215 | 463 | - | - | - (aa) | - | - |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
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ENSG00000085224 | ATRX | 99 | 93.909 | ENSMUSG00000031229 | Atrx | 100 | 93.333 | Mus_musculus |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
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GO:0000212 | meiotic spindle organization | - | IEA | Process |
GO:0000780 | condensed nuclear chromosome, centromeric region | - | IEA | Component |
GO:0000784 | nuclear chromosome, telomeric region | - | ISS | Component |
GO:0000784 | nuclear chromosome, telomeric region | - | ISS | Component |
GO:0000981 | DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific | - | ISA | Function |
GO:0003677 | DNA binding | - | IEA | Function |
GO:0003682 | chromatin binding | 27029610. | IDA | Function |
GO:0004386 | helicase activity | - | IEA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 10699177.12953102.17296936.22102817.22391447.24651726.25417162.26373281.26496610.27029610. | IPI | Function |
GO:0005524 | ATP binding | - | IEA | Function |
GO:0005634 | nucleus | 7874112. | TAS | Component |
GO:0005654 | nucleoplasm | - | IDA | Component |
GO:0005720 | nuclear heterochromatin | 10570185. | TAS | Component |
GO:0005721 | pericentric heterochromatin | - | ISS | Component |
GO:0006281 | DNA repair | - | IEA | Process |
GO:0006306 | DNA methylation | 10742099. | TAS | Process |
GO:0006334 | nucleosome assembly | 20651253. | IDA | Process |
GO:0006336 | DNA replication-independent nucleosome assembly | 22391447. | IMP | Process |
GO:0006338 | chromatin remodeling | 20651253. | IDA | Process |
GO:0006355 | regulation of transcription, DNA-templated | 7697714. | TAS | Process |
GO:0007283 | spermatogenesis | - | IEA | Process |
GO:0010571 | positive regulation of nuclear cell cycle DNA replication | - | ISS | Process |
GO:0015616 | DNA translocase activity | 12953102. | IDA | Function |
GO:0016604 | nuclear body | - | IDA | Component |
GO:0016605 | PML body | - | ISS | Component |
GO:0030330 | DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator | - | ISS | Process |
GO:0030900 | forebrain development | - | IEA | Process |
GO:0031297 | replication fork processing | - | ISS | Process |
GO:0031618 | nuclear pericentric heterochromatin | - | IEA | Component |
GO:0031933 | telomeric heterochromatin | - | ISS | Component |
GO:0032206 | positive regulation of telomere maintenance | - | ISS | Process |
GO:0035064 | methylated histone binding | 21421568. | IDA | Function |
GO:0035128 | post-embryonic forelimb morphogenesis | - | IEA | Process |
GO:0035264 | multicellular organism growth | - | IEA | Process |
GO:0042393 | histone binding | 20211137.22391447. | IDA | Function |
GO:0045944 | positive regulation of transcription by RNA polymerase II | 22391447. | IMP | Process |
GO:0046872 | metal ion binding | - | IEA | Function |
GO:0060009 | Sertoli cell development | - | IEA | Process |
GO:0070087 | chromo shadow domain binding | 15882967. | IPI | Function |
GO:0070192 | chromosome organization involved in meiotic cell cycle | - | IEA | Process |
GO:0070198 | protein localization to chromosome, telomeric region | - | ISS | Process |
GO:0072520 | seminiferous tubule development | - | IEA | Process |
GO:0072711 | cellular response to hydroxyurea | - | ISS | Process |
GO:1900112 | regulation of histone H3-K9 trimethylation | 27029610. | IMP | Process |
GO:1901581 | negative regulation of telomeric RNA transcription from RNA pol II promoter | - | ISS | Process |
GO:1901582 | positive regulation of telomeric RNA transcription from RNA pol II promoter | 26055325. | IMP | Process |
GO:1904908 | negative regulation of maintenance of mitotic sister chromatid cohesion, telomeric | 26373281. | IMP | Process |
GO:1990707 | nuclear subtelomeric heterochromatin | 26055325. | IDA | Component |
Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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KIRC | ||
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SKCM | ||
BRCA | ||
ESCA | ||
PCPG | ||
KICH | ||
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LIHC | ||
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