Protein ID | Domain | Pfam ID | E-value | Domain number | Total number |
---|---|---|---|---|---|
ENSP00000341247 | PAM2 | PF07145.15 | 1.1e-05 | 1 | 1 |
ENSP00000341247 | GTP_EFTU | PF00009.27 | 2.9e-45 | 1 | 1 |
ENSP00000341247 | GTP_EFTU_D2 | PF03144.25 | 7.3e-07 | 1 | 1 |
ENSP00000341247 | GTP_EFTU_D3 | PF03143.17 | 2.9e-30 | 1 | 1 |
Transcript ID | Name | Length | RefSeq ID | Protein ID | Length | RefSeq ID | UniportKB ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ENST00000340438 | GSPT2-201 | 2802 | - | ENSP00000341247 | 628 (aa) | - | Q8IYD1 |
Pathway ID | Pathway Name | Source |
---|---|---|
hsa03015 | mRNA surveillance pathway | KEGG |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Paralog | Gene Symbol | Coverage | Identiy |
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ENSG00000189369 | GSPT2 | 68 | 37.613 | ENSG00000156508 | EEF1A1 | 98 | 51.408 |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 68 | 36.878 | ENSG00000101210 | EEF1A2 | 97 | 52.381 |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 99 | 87.279 | ENSG00000103342 | GSPT1 | 100 | 93.788 |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 75 | 40.292 | ENSG00000112339 | HBS1L | 94 | 42.945 |
Ensembl ID | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Ortholog | Gene Symbol | Coverage | Identiy | Species |
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ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.949 | ENSAMEG00000019869 | GSPT2 | 98 | 94.013 | Ailuropoda_melanoleuca |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 96.656 | ENSANAG00000031086 | GSPT2 | 100 | 96.656 | Aotus_nancymaae |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 98 | 92.283 | ENSBTAG00000013311 | GSPT2 | 98 | 92.765 | Bos_taurus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 97.134 | ENSCJAG00000000368 | GSPT2 | 100 | 97.134 | Callithrix_jacchus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 94.108 | ENSCAFG00020020040 | GSPT2 | 98 | 94.175 | Canis_lupus_dingo |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.312 | ENSCPOG00000007083 | GSPT2 | 98 | 93.366 | Cavia_porcellus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 97.293 | ENSCCAG00000032215 | GSPT2 | 100 | 97.293 | Cebus_capucinus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 99.363 | ENSCSAG00000000126 | GSPT2 | 100 | 99.363 | Chlorocebus_sabaeus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 90.252 | ENSCGRG00001002796 | Gspt2 | 99 | 89.776 | Cricetulus_griseus_chok1gshd |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 90.252 | ENSCGRG00000018704 | Gspt2 | 99 | 89.776 | Cricetulus_griseus_crigri |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 88.854 | ENSDNOG00000011822 | GSPT2 | 98 | 88.835 | Dasypus_novemcinctus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 92.834 | ENSDORG00000012719 | Gspt2 | 97 | 92.880 | Dipodomys_ordii |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 76 | 73.478 | ENSEBUG00000004339 | GSPT2 | 90 | 73.478 | Eptatretus_burgeri |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 98 | 90.081 | ENSEEUG00000005355 | GSPT2 | 99 | 89.644 | Erinaceus_europaeus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.949 | ENSFCAG00000001558 | GSPT2 | 98 | 94.013 | Felis_catus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 94.586 | ENSFDAG00000009123 | GSPT2 | 98 | 94.660 | Fukomys_damarensis |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.312 | ENSHGLG00000001568 | GSPT2 | 98 | 93.528 | Heterocephalus_glaber_female |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 92.516 | ENSHGLG00100005633 | GSPT2 | 98 | 92.718 | Heterocephalus_glaber_male |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 95.223 | ENSSTOG00000008532 | GSPT2 | 98 | 95.307 | Ictidomys_tridecemlineatus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 88.235 | ENSJJAG00000000985 | Gspt2 | 96 | 88.673 | Jaculus_jaculus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 99 | 90.851 | ENSLAFG00000002545 | GSPT2 | 99 | 91.100 | Loxodonta_africana |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 98.885 | ENSMFAG00000036045 | GSPT2 | 100 | 98.885 | Macaca_fascicularis |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 98.885 | ENSMMUG00000029293 | GSPT2 | 100 | 98.885 | Macaca_mulatta |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 99 | 87.520 | ENSMOCG00000001273 | Gspt2 | 98 | 87.220 | Microtus_ochrogaster |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 88.854 | MGP_CAROLIEiJ_G0033239 | Gspt2 | 99 | 88.517 | Mus_caroli |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 88.854 | ENSMUSG00000071723 | Gspt2 | 99 | 88.517 | Mus_musculus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 88.540 | MGP_PahariEiJ_G0031780 | Gspt2 | 99 | 88.198 | Mus_pahari |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 88.697 | MGP_SPRETEiJ_G0034406 | Gspt2 | 99 | 88.517 | Mus_spretus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.471 | ENSMPUG00000018783 | GSPT2 | 98 | 93.528 | Mustela_putorius_furo |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 92.528 | ENSMLUG00000014559 | GSPT2 | 98 | 92.569 | Myotis_lucifugus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 98 | 89.968 | ENSNGAG00000013281 | Gspt2 | 98 | 88.997 | Nannospalax_galili |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 94.904 | ENSOGAG00000005266 | GSPT2 | 98 | 94.984 | Otolemur_garnettii |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 94 | 93.909 | ENSOARG00000005636 | GSPT2 | 99 | 93.456 | Ovis_aries |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.471 | ENSPPRG00000011599 | GSPT2 | 98 | 93.689 | Panthera_pardus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 92.994 | ENSPTIG00000008104 | GSPT2 | 98 | 93.042 | Panthera_tigris_altaica |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 98.089 | ENSPPYG00000020360 | GSPT2 | 100 | 98.089 | Pongo_abelii |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 84 | 92.762 | ENSPCAG00000013962 | GSPT2 | 100 | 92.762 | Procavia_capensis |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 89.185 | ENSRNOG00000048817 | Gspt2 | 99 | 89.490 | Rattus_norvegicus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 96.815 | ENSRBIG00000034444 | GSPT2 | 100 | 96.815 | Rhinopithecus_bieti |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 96.975 | ENSSBOG00000036422 | GSPT2 | 100 | 96.975 | Saimiri_boliviensis_boliviensis |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 89 | 86.964 | ENSSARG00000011841 | GSPT2 | 100 | 87.143 | Sorex_araneus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 97 | 92.869 | ENSSSCG00000012317 | GSPT2 | 94 | 92.751 | Sus_scrofa |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 92.259 | ENSTTRG00000010721 | GSPT2 | 98 | 92.926 | Tursiops_truncatus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 100 | 93.323 | ENSUAMG00000011563 | GSPT2 | 98 | 93.851 | Ursus_americanus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 79 | 96.994 | ENSUMAG00000013348 | GSPT2 | 100 | 96.994 | Ursus_maritimus |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 98 | 93.659 | ENSVPAG00000003204 | GSPT2 | 98 | 93.689 | Vicugna_pacos |
ENSG00000189369 | GSPT2 | 97 | 93.954 | ENSVVUG00000005605 | GSPT2 | 98 | 94.020 | Vulpes_vulpes |
Go ID | Go_term | PubmedID | Evidence | Category |
---|---|---|---|---|
GO:0000184 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay | - | TAS | Process |
GO:0002184 | cytoplasmic translational termination | 21873635. | IBA | Process |
GO:0003723 | RNA binding | 22658674.22681889. | HDA | Function |
GO:0003747 | translation release factor activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0003924 | GTPase activity | 21873635. | IBA | Function |
GO:0005515 | protein binding | 9712840.14685257.18447585.23340509. | IPI | Function |
GO:0005525 | GTP binding | - | IEA | Function |
GO:0005829 | cytosol | - | TAS | Component |
GO:0006412 | translation | 21873635. | IBA | Process |
GO:0007049 | cell cycle | - | IEA | Process |
GO:0018444 | translation release factor complex | 21873635. | IBA | Component |
PID | Title | Article | Time | Author | Doi |
---|---|---|---|---|---|
24466059 |
Cancer | Chr | Position | Mutation Type | dbSNP | Protein-change | Allele Freq | RBD |
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Cancer | P-value | Q-value |
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BRCA | ||
ESCA | ||
TGCT | ||
READ | ||
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