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Description

Ensembl ID: ENSGACG00000001637 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: aco1
Alias: IRP1|wu:fo75b03
Full Name: aconitase 1%2C soluble
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24530 bases
Position: chrscaffold_106:301947-326476
Accession: ZDB-GENE-031118-76
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000002197	Aconitase	PF00330.20	2.5e-179	1	1
ENSGACP00000002197	Aconitase_C	PF00694.19	6.8e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000002203	-	2685	-	ENSGACP00000002197	894 (aa)	-	G3NA55

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000001637	aco1	99	59.259	ENSGACG00000007341	ireb2	96	56.410

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.511	ENSG00000122729	ACO1	99	81.511	Homo_sapiens
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.150	ENSAPOG00000008670	aco1	100	89.150	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.194	ENSAMEG00000003746	ACO1	99	81.194	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.374	ENSACIG00000014377	aco1	100	89.374	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.933	ENSAOCG00000007699	aco1	100	89.933	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.821	ENSAPEG00000014370	aco1	100	89.821	Amphiprion_percula
ENSGACG00000001637	aco1	100	90.604	ENSATEG00000000560	aco1	100	90.604	Anabas_testudineus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.828	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	81.828	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000001637	aco1	96	80.233	ENSACAG00000001541	ACO1	99	80.233	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.135	ENSANAG00000003359	ACO1	99	80.135	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.709	ENSACLG00000007755	aco1	100	89.709	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000001637	aco1	99	86.374	ENSAMXG00000002499	aco1	99	86.374	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.172	ENSBTAG00000000555	ACO1	99	81.172	Bos_taurus
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.722	ENSCJAG00000007687	ACO1	99	80.722	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.540	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	80.540	Canis_familiaris
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.722	ENSCAFG00020014553	ACO1	99	80.722	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.285	ENSCHIG00000007667	ACO1	99	81.285	Capra_hircus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.623	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	81.623	Carlito_syrichta
ENSGACG00000001637	aco1	99	65.804	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	65.692	Cavia_aperea
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.215	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	81.215	Cavia_porcellus
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.609	ENSCCAG00000022465	ACO1	99	80.609	Cebus_capucinus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.398	ENSCATG00000045333	ACO1	99	81.398	Cercocebus_atys
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.315	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	80.315	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.830	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	80.830	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000001637	aco1	90	63.827	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	63.664	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.151	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	81.151	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.172	ENSCANG00000014847	ACO1	99	81.172	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.890	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	81.890	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.990	ENSCGRG00000004877	-	100	80.990	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000001637	aco1	100	86.465	ENSCSEG00000018262	aco1	100	86.465	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000001637	aco1	100	81.096	ENSCVAG00000020264	aco1	100	81.096	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	85.586	ENSDARG00000026376	aco1	99	85.586	Danio_rerio
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.623	ENSDNOG00000003951	ACO1	99	81.623	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.552	ENSDORG00000014246	Aco1	100	81.552	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000001637	aco1	85	62.434	ENSETEG00000012415	-	85	62.434	Echinops_telfairi
ENSGACG00000001637	aco1	99	55.355	ENSEBUG00000015441	aco1	97	55.355	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.623	ENSEASG00005004602	ACO1	99	81.623	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.511	ENSECAG00000014846	ACO1	99	81.511	Equus_caballus
ENSGACG00000001637	aco1	99	70.349	ENSEEUG00000015174	ACO1	99	70.349	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000001637	aco1	99	85.923	ENSELUG00000016812	aco1	97	85.923	Esox_lucius
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.834	ENSFCAG00000001293	ACO1	99	80.834	Felis_catus
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.054	ENSFALG00000001167	ACO1	99	82.054	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.215	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	81.215	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000001637	aco1	100	88.591	ENSFHEG00000005619	aco1	100	88.591	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000001637	aco1	99	83.632	ENSGMOG00000005514	aco1	99	83.632	Gadus_morhua
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.167	ENSGALG00000002162	ACO1	99	82.167	Gallus_gallus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.038	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	81.038	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.398	ENSGGOG00000016306	ACO1	99	81.398	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.485	ENSHBUG00000008952	aco1	100	89.485	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.652	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	80.652	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.652	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	80.652	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000001637	aco1	100	84.564	ENSHCOG00000015881	aco1	100	84.564	Hippocampus_comes
ENSGACG00000001637	aco1	99	85.569	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	85.569	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.207	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	82.207	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.552	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	81.552	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000001637	aco1	100	88.591	ENSKMAG00000015759	aco1	100	88.591	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000001637	aco1	100	86.145	ENSLBEG00000013866	aco1	100	86.145	Labrus_bergylta
ENSGACG00000001637	aco1	75	69.809	ENSLACG00000000936	ACO1	99	69.630	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.751	ENSLOCG00000011082	aco1	99	82.751	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	79.256	ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.256	Loxodonta_africana
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.285	ENSMFAG00000001702	ACO1	99	81.285	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.398	ENSMMUG00000008196	ACO1	99	81.398	Macaca_mulatta
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.172	ENSMNEG00000045040	ACO1	99	81.172	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.398	ENSMLEG00000005636	ACO1	99	81.398	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000001637	aco1	100	90.716	ENSMAMG00000002915	aco1	100	90.716	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	86.176	ENSMZEG00005012733	aco1	100	85.842	Maylandia_zebra
ENSGACG00000001637	aco1	99	66.518	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	66.518	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.665	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	81.665	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.060	ENSMICG00000006540	ACO1	99	81.060	Microcebus_murinus
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.115	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	82.115	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000001637	aco1	99	89.562	ENSMMOG00000020282	aco1	99	89.562	Mola_mola
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.722	ENSMODG00000004463	ACO1	99	80.722	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000001637	aco1	100	90.268	ENSMALG00000019764	aco1	100	90.268	Monopterus_albus
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.227	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	82.227	Mus_caroli
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.340	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	82.340	Mus_musculus
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.115	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	82.115	Mus_pahari
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.340	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	82.340	Mus_spretus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.849	ENSMPUG00000004340	ACO1	99	81.849	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000001637	aco1	99	79.707	ENSMLUG00000003029	ACO1	99	79.707	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.552	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	81.552	Nannospalax_galili
ENSGACG00000001637	aco1	100	71.079	ENSNBRG00000008973	aco1	100	71.301	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.285	ENSNLEG00000003409	ACO1	99	81.285	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000001637	aco1	89	75.973	ENSMEUG00000014756	ACO1	89	75.973	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000001637	aco1	99	77.615	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	77.615	Ochotona_princeps
ENSGACG00000001637	aco1	99	78.290	ENSODEG00000001240	-	100	78.290	Octodon_degus
ENSGACG00000001637	aco1	99	75.591	ENSODEG00000015432	-	100	75.366	Octodon_degus
ENSGACG00000001637	aco1	100	89.821	ENSONIG00000019869	aco1	100	89.821	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000001637	aco1	81	82.296	ENSOANG00000012132	ACO1	100	82.296	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.936	ENSOCUG00000015960	ACO1	99	80.713	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000001637	aco1	99	89.326	ENSORLG00000020656	aco1	100	89.326	Oryzias_latipes
ENSGACG00000001637	aco1	99	88.876	ENSORLG00020010991	aco1	100	88.876	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000001637	aco1	100	88.702	ENSORLG00015011785	aco1	100	88.702	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000001637	aco1	99	87.430	ENSOMEG00000000660	aco1	99	87.430	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.736	ENSOGAG00000010522	ACO1	99	81.736	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.942	ENSOARG00000014707	ACO1	99	80.942	Ovis_aries
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.511	ENSPPAG00000033498	ACO1	99	81.511	Pan_paniscus
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.834	ENSPPRG00000009875	ACO1	99	80.834	Panthera_pardus
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.381	ENSPTIG00000016606	ACO1	99	80.381	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.511	ENSPTRG00000020843	ACO1	99	81.511	Pan_troglodytes
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.398	ENSPANG00000025270	ACO1	99	81.398	Papio_anubis
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.979	ENSPKIG00000023168	aco1	99	82.979	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000001637	aco1	99	81.151	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	81.151	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000001637	aco1	100	88.143	ENSPMGG00000020708	aco1	100	88.143	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000001637	aco1	99	82.002	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	82.002	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000001637	aco1	99	80.226	ENSPCIG00000029321	ACO1	99	81.418	Phascolarctos_cinereus
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ENSGACG00000001637	aco1	77	84.906	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	84.906	Procavia_capensis
ENSGACG00000001637	aco1	88	82.152	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	82.152	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000001637	aco1	96	76.581	ENSPVAG00000002372	ACO1	99	76.581	Pteropus_vampyrus
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