EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSGACG00000002276 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8300 bases
Position: chrgroupXXI:3782069-3790368
Accession: ZDB-GENE-041014-307
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000002961	RIX1	PF08167.12	4e-11	1	1
ENSGACP00000002961	IBN_N	PF03810.19	2.6e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000002972	-	3374	-	ENSGACP00000002961	1088 (aa)	-	G3NCB2

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.767	ENSG00000196497	IPO4	99	45.906	Homo_sapiens
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.006	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	79.098	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.977	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	44.977	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.063	ENSACIG00000004246	ipo4	100	79.247	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	81.927	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	82.202	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.018	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	82.294	Amphiprion_percula
ENSGACG00000002276	ipo4	92	84.608	ENSATEG00000017082	ipo4	99	84.608	Anabas_testudineus
ENSGACG00000002276	ipo4	84	46.659	ENSACAG00000003973	-	97	47.129	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.395	ENSANAG00000037973	IPO4	99	45.446	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000002276	ipo4	99	78.453	ENSACLG00000019742	ipo4	100	78.453	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000002276	ipo4	99	69.705	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	69.613	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.161	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	45.438	Bos_taurus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.953	ENSCJAG00000006937	IPO4	99	45.998	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.698	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	46.501	Canis_familiaris
ENSGACG00000002276	ipo4	98	46.289	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	45.227	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000002276	ipo4	98	45.107	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	45.429	Capra_hircus
ENSGACG00000002276	ipo4	98	45.412	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	45.556	Carlito_syrichta
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.175	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	46.090	Cavia_porcellus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.860	ENSCCAG00000037929	IPO4	99	45.991	Cebus_capucinus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.047	ENSCATG00000040395	IPO4	99	46.182	Cercocebus_atys
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.899	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	46.090	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000002276	ipo4	90	45.122	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	42.449	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000002276	ipo4	92	36.019	ENSCING00000008639	-	99	35.922	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000002276	ipo4	94	35.472	ENSCSAVG00000011482	-	99	36.127	Ciona_savignyi
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.860	ENSCANG00000029513	IPO4	99	45.998	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	43.756	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	43.993	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000002276	ipo4	99	43.756	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	43.993	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000002276	ipo4	99	75.207	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	75.115	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000002276	ipo4	99	73.500	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	73.838	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	73.438	ENSDARG00000041493	ipo4	100	73.438	Danio_rerio
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.111	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	46.019	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.488	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.630	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000002276	ipo4	96	31.163	FBgn0042177	CG32164	97	31.047	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000002276	ipo4	96	31.447	FBgn0042178	CG32165	97	31.204	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.802	ENSETEG00000018381	IPO4	99	44.802	Echinops_telfairi
ENSGACG00000002276	ipo4	90	47.310	ENSEASG00005011954	IPO4	96	47.513	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.452	ENSECAG00000009909	IPO4	99	46.359	Equus_caballus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	71.674	ENSELUG00000020628	ipo4	100	73.394	Esox_lucius
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.267	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	46.133	Felis_catus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	42.713	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	42.621	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000002276	ipo4	89	81.335	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	81.335	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.022	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	76.304	Gadus_morhua
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.102	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	79.670	Gambusia_affinis
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.860	ENSGGOG00000016062	IPO4	99	45.998	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.466	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	79.466	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.706	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	45.622	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.429	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	45.346	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000002276	ipo4	99	75.725	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	75.815	Hippocampus_comes
ENSGACG00000002276	ipo4	99	72.007	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	72.007	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.991	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	46.090	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.074	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	45.304	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	78.696	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	78.696	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.061	ENSLBEG00000024952	ipo4	100	82.061	Labrus_bergylta
ENSGACG00000002276	ipo4	99	50.269	ENSLACG00000001428	IPO4	100	50.135	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000002276	ipo4	79	68.031	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	67.857	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.596	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	45.596	Loxodonta_africana
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.047	ENSMFAG00000000743	IPO4	99	46.182	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.047	ENSMMUG00000012481	IPO4	99	46.182	Macaca_mulatta
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.953	ENSMNEG00000043531	IPO4	99	46.090	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.047	ENSMLEG00000042067	IPO4	99	46.182	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	81.492	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	81.400	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.466	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	79.466	Maylandia_zebra
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.783	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	44.977	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000002276	ipo4	98	46.598	ENSMICG00000001719	IPO4	99	46.274	Microcebus_murinus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.558	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.628	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.010	ENSMMOG00000005264	ipo4	100	79.652	Mola_mola
ENSGACG00000002276	ipo4	99	43.941	ENSMODG00000003337	IPO4	96	44.004	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000002276	ipo4	99	79.320	ENSMALG00000001587	ipo4	100	79.596	Monopterus_albus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.751	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	98	46.468	Mus_caroli
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.496	ENSMUSG00000002319	Ipo4	98	46.221	Mus_musculus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.537	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	46.460	Mus_pahari
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.866	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	98	46.658	Mus_spretus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.820	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	47.053	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.926	ENSMLUG00000025277	IPO4	85	46.111	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.968	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	45.069	Nannospalax_galili
ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.965	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	83.057	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.933	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	46.303	Ochotona_princeps
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.544	ENSODEG00000002609	IPO4	99	46.366	Octodon_degus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.689	ENSONIG00000014574	ipo4	100	82.689	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.046	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	45.330	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.016	ENSORLG00000006457	ipo4	99	78.257	Oryzias_latipes
ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.737	ENSORLG00020004286	ipo4	100	77.921	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000002276	ipo4	99	77.921	ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.105	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000002276	ipo4	99	76.859	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	77.043	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000002276	ipo4	98	44.828	ENSOGAG00000010642	IPO4	99	44.649	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000002276	ipo4	98	44.631	ENSOARG00000019188	IPO4	99	44.911	Ovis_aries
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.860	ENSPPAG00000035476	IPO4	99	45.991	Pan_paniscus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.544	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	46.409	Panthera_pardus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.452	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	46.317	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000002276	ipo4	99	45.767	ENSPTRG00000006200	IPO4	99	45.906	Pan_troglodytes
ENSGACG00000002276	ipo4	99	46.140	ENSPANG00000026278	IPO4	99	46.274	Papio_anubis
ENSGACG00000002276	ipo4	99	66.330	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	66.300	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000002276	ipo4	99	67.435	ENSPKIG00000007683	-	99	66.514	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000002276	ipo4	99	72.018	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	72.294	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.188	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	44.373	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000002276	ipo4	94	46.484	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	46.491	Phascolarctos_cinereus
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ENSGACG00000002276	ipo4	98	45.318	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	45.463	Propithecus_coquereli
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