EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000002683 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago4
Alias: Ago4|eif2c4|fd14f04|wu:fd14f04
Full Name: argonaute RISC catalytic component 4
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11316 bases
Position: chrgroupX:2713466-2724781
Accession: ZDB-GENE-030131-5357
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000003513	PAZ	PF02170.22	1.8e-28	1	1
ENSGACP00000003513	Piwi	PF02171.17	1.8e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000003525	-	2586	-	ENSGACP00000003513	862 (aa)	-	G3NDW2

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000002683's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000002683's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000002683	ago4	88	84.273	ENSGACG00000012443	ago1	100	84.273
ENSGACG00000002683	ago4	92	81.459	ENSGACG00000012453	ago3a	100	81.459
ENSGACG00000002683	ago4	99	79.953	ENSGACG00000006796	ago2	99	79.953
ENSGACG00000002683	ago4	97	80.638	ENSGACG00000002455	AGO3	100	80.638

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSG00000134698	AGO4	99	97.558	Homo_sapiens
ENSGACG00000002683	ago4	96	98.323	ENSAPOG00000023867	ago4	99	98.323	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSAMEG00000000573	AGO4	99	97.442	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000002683	ago4	92	99.874	ENSACIG00000014548	ago4	100	99.874	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000002683	ago4	92	95.214	ENSAPEG00000022426	ago4	100	95.214	Amphiprion_percula
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.393	ENSATEG00000006717	ago4	100	98.509	Anabas_testudineus
ENSGACG00000002683	ago4	98	97.757	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	97.757	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.624	ENSACAG00000017275	AGO4	99	96.624	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.550	ENSANAG00000031428	AGO4	99	97.550	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.387	ENSACLG00000005181	ago4	99	98.278	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.048	ENSAMXG00000010318	ago4	100	98.111	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.860	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	96.860	Bos_taurus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	97.666	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	97.859	Canis_familiaris
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.674	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	97.674	Capra_hircus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.550	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	97.550	Carlito_syrichta
ENSGACG00000002683	ago4	94	93.541	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	93.541	Cavia_aperea
ENSGACG00000002683	ago4	99	95.780	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	95.780	Cavia_porcellus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	97.666	Cebus_capucinus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	ENSCATG00000043421	AGO4	100	97.933	Cercocebus_atys
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.538	ENSCLAG00000012097	AGO4	99	97.538	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	97.558	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000002683	ago4	80	98.347	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	98.347	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000002683	ago4	100	97.100	ENSCPBG00000018602	AGO4	99	97.100	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	ENSCANG00000016914	AGO4	100	97.666	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.977	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	96.977	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.304	ENSCGRG00000013335	Ago4	99	97.304	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000002683	ago4	92	93.719	ENSCSEG00000010696	ago4	100	93.719	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000002683	ago4	99	99.535	ENSDARG00000100854	ago4	99	99.535	Danio_rerio
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.326	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	97.326	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSDORG00000008933	Ago4	99	97.442	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000002683	ago4	60	97.537	ENSETEG00000018390	AGO4	83	97.537	Echinops_telfairi
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSEASG00005012079	AGO4	99	97.558	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSECAG00000024686	AGO4	99	97.558	Equus_caballus
ENSGACG00000002683	ago4	79	93.617	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	93.617	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.157	ENSELUG00000023873	ago4	99	98.157	Esox_lucius
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	97.442	Felis_catus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSFDAG00000021483	AGO4	99	97.773	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000002683	ago4	97	90.311	ENSFHEG00000019658	ago4	100	90.311	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000002683	ago4	99	99.185	ENSGMOG00000009544	ago4	99	99.185	Gadus_morhua
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSGALG00000039713	AGO4	100	97.733	Gallus_gallus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.048	ENSGAFG00000017239	ago4	99	98.048	Gambusia_affinis
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.733	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	97.733	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000002683	ago4	99	94.477	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	94.477	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.278	ENSHBUG00000001525	ago4	99	98.278	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	97.442	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.770	ENSHGLG00100005233	AGO4	100	97.770	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.163	ENSHCOG00000003725	ago4	99	98.163	Hippocampus_comes
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.278	ENSIPUG00000015600	ago4	99	98.278	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSSTOG00000004725	AGO4	99	97.442	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.163	ENSKMAG00000018602	ago4	99	98.163	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.719	ENSLBEG00000010670	ago4	99	97.719	Labrus_bergylta
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.558	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.589	ENSLOCG00000000584	ago4	99	97.589	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000002683	ago4	93	97.129	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	97.129	Loxodonta_africana
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.666	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	97.666	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.552	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	97.222	Macaca_mulatta
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.655	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	97.222	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSMLEG00000039490	AGO4	99	97.773	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.278	ENSMAMG00000003874	ago4	100	98.246	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.387	ENSMZEG00005026346	ago4	99	98.278	Maylandia_zebra
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.200	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	97.200	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000002683	ago4	83	97.122	ENSMAUG00000021743	Ago4	99	95.707	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.541	ENSMICG00000033507	AGO4	99	97.541	Microcebus_murinus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.093	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	97.093	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000002683	ago4	92	98.489	ENSMMOG00000013473	ago4	100	98.489	Mola_mola
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSMODG00000017888	AGO4	99	97.558	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.783	ENSMALG00000011797	ago4	99	97.783	Monopterus_albus
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.744	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	96.744	Mus_caroli
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.512	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	96.512	Mus_musculus
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.279	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	96.279	Mus_pahari
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.512	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	96.512	Mus_spretus
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	97.859	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.970	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	96.970	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSNGAG00000020544	Ago4	99	97.773	Nannospalax_galili
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.278	ENSNBRG00000013492	ago4	99	98.278	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSNLEG00000011125	AGO4	99	97.773	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000002683	ago4	89	96.605	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	96.605	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000002683	ago4	99	90.621	ENSOPRG00000012309	AGO4	99	90.621	Ochotona_princeps
ENSGACG00000002683	ago4	93	97.744	ENSODEG00000006355	AGO4	97	97.744	Octodon_degus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.950	ENSONIG00000013603	ago4	99	98.278	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSOANG00000002082	AGO4	100	97.859	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.326	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	97.326	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.393	ENSORLG00000009865	ago4	92	98.393	Oryzias_latipes
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.393	ENSORLG00020016978	ago4	92	98.393	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.393	ENSORLG00015008800	ago4	92	98.393	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.393	ENSOMEG00000006399	ago4	100	98.048	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000002683	ago4	93	96.746	ENSOGAG00000004233	-	100	96.746	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000002683	ago4	99	89.369	ENSOGAG00000027107	-	99	89.369	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.209	ENSOARG00000019568	AGO4	98	97.209	Ovis_aries
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSPPAG00000031752	AGO4	99	97.773	Pan_paniscus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	97.442	Panthera_pardus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSPTIG00000020262	AGO4	99	97.773	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	97.558	Pan_troglodytes
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSPANG00000007232	AGO4	100	97.859	Papio_anubis
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.819	ENSPKIG00000022598	ago4	99	97.819	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.550	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	97.550	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000002683	ago4	92	99.748	ENSPMGG00000023325	ago4	100	99.748	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000002683	ago4	100	86.806	ENSPEMG00000022651	-	96	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	97.558	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.163	ENSPFOG00000001935	ago4	99	98.163	Poecilia_formosa
ENSGACG00000002683	ago4	99	99.419	ENSPLAG00000011534	ago4	99	99.419	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.163	ENSPMEG00000005049	ago4	99	98.163	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.270	ENSPREG00000010315	ago4	99	98.163	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.773	ENSPPYG00000001552	AGO4	99	97.773	Pongo_abelii
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.541	ENSPCOG00000015935	AGO4	99	97.541	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000002683	ago4	87	96.970	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	96.970	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.278	ENSPNYG00000002089	ago4	99	98.278	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.721	ENSPNAG00000005191	ago4	99	98.721	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000002683	ago4	69	97.152	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	97.152	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000002683	ago4	99	96.710	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	97.222	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSRROG00000035783	AGO4	100	97.859	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000002683	ago4	99	93.728	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	97.622	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.100	ENSSHAG00000017320	AGO4	99	97.100	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.163	ENSSFOG00015022028	ago4	100	98.261	Scleropages_formosus
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.272	ENSSMAG00000000808	ago4	92	97.619	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.386	ENSSDUG00000020781	ago4	100	99.244	Seriola_dumerili
ENSGACG00000002683	ago4	92	99.874	ENSSLDG00000021841	ago4	100	99.874	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000002683	ago4	78	97.506	ENSSARG00000011504	AGO4	79	97.506	Sorex_araneus
ENSGACG00000002683	ago4	99	97.093	ENSSPUG00000000889	AGO4	99	97.093	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000002683	ago4	99	92.706	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	91.995	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.048	ENSTRUG00000008052	ago4	99	98.048	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000002683	ago4	99	99.533	ENSTNIG00000006331	ago4	99	99.533	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000002683	ago4	77	97.143	ENSTBEG00000016478	AGO4	76	97.143	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000002683	ago4	99	94.021	ENSTTRG00000015086	AGO4	99	94.021	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSUAMG00000027156	-	100	97.859	Ursus_americanus
ENSGACG00000002683	ago4	99	95.698	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	94.296	Ursus_maritimus
ENSGACG00000002683	ago4	88	97.101	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	97.101	Vicugna_pacos
ENSGACG00000002683	ago4	92	97.859	ENSVVUG00000000465	-	100	97.859	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000002683	ago4	100	84.455	ENSXETG00000009664	ago4	99	84.455	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000002683	ago4	99	98.163	ENSXMAG00000016657	ago4	99	98.163	Xiphophorus_maculatus