EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000002718 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11468 bases
Position: chrgroupVI:1326936-1338403
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000003569	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.2e-29	1	2
ENSGACP00000003569	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.2e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000003581	-	2315	-	ENSGACP00000003569	743 (aa)	-	G3NE18

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000002718's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000002718's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000002718	papolg	64	53.027	ENSGACG00000006142	-	99	53.027

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	ENSG00000115421	PAPOLG	100	87.607	Homo_sapiens
ENSGACG00000002718	papolg	100	91.834	ENSAPOG00000004798	papolg	99	84.791	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000002718	papolg	99	72.000	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	71.448	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000002718	papolg	100	83.311	ENSACIG00000010546	papolg	99	82.638	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000002718	papolg	100	91.566	ENSAOCG00000010254	papolg	89	92.236	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000002718	papolg	100	91.566	ENSAPEG00000006944	papolg	89	92.236	Amphiprion_percula
ENSGACG00000002718	papolg	100	91.968	ENSATEG00000009007	papolg	89	91.968	Anabas_testudineus
ENSGACG00000002718	papolg	98	67.206	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.757	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000002718	papolg	81	60.000	ENSACAG00000015048	-	100	59.446	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.771	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	71.600	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.073	ENSACLG00000015592	papolg	89	88.204	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000002718	papolg	100	77.559	ENSAMXG00000004611	papolg	100	77.748	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.318	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	71.580	Bos_taurus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	71.904	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.883	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	71.144	Canis_familiaris
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.748	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	71.014	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.318	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	71.448	Capra_hircus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.202	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	70.292	Carlito_syrichta
ENSGACG00000002718	papolg	51	81.365	ENSCAPG00000014901	-	100	81.365	Cavia_aperea
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.693	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	71.523	Cavia_porcellus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	71.904	Cebus_capucinus
ENSGACG00000002718	papolg	91	81.818	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.818	Cercocebus_atys
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.450	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	71.202	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.941	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	71.771	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000002718	papolg	89	69.778	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	69.585	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000002718	papolg	66	64.228	ENSCING00000024664	-	91	64.228	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000002718	papolg	65	64.948	ENSCSAVG00000009085	-	97	64.948	Ciona_savignyi
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.941	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	71.771	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000002718	papolg	99	71.791	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	71.448	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000002718	papolg	99	71.791	ENSCGRG00000005552	-	100	71.448	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000002718	papolg	100	86.406	ENSCSEG00000000771	papolg	99	85.464	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000002718	papolg	100	85.976	ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.400	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000002718	papolg	100	79.681	ENSDARG00000012141	papolg	100	78.215	Danio_rerio
ENSGACG00000002718	papolg	100	69.577	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	69.312	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000002718	papolg	58	86.247	ENSDORG00000016228	Papolg	100	86.247	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000002718	papolg	100	58.808	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	57.825	Echinops_telfairi
ENSGACG00000002718	papolg	61	59.121	ENSEBUG00000005042	-	77	59.121	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000002718	papolg	59	72.165	ENSEBUG00000004020	papolg	98	57.377	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.127	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	71.070	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.127	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	71.028	Equus_caballus
ENSGACG00000002718	papolg	100	63.974	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	63.974	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000002718	papolg	100	80.631	ENSELUG00000014497	papolg	98	80.659	Esox_lucius
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.354	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	71.618	Felis_catus
ENSGACG00000002718	papolg	98	61.134	ENSFALG00000011079	PAPOLG	96	60.512	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.825	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	71.656	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000002718	papolg	67	84.294	ENSFHEG00000019080	papolg	90	83.166	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000002718	papolg	88	94.075	ENSGMOG00000018772	papolg	94	94.075	Gadus_morhua
ENSGACG00000002718	papolg	100	63.200	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	62.350	Gallus_gallus
ENSGACG00000002718	papolg	100	86.148	ENSGAFG00000003263	papolg	89	86.358	Gambusia_affinis
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.941	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	71.771	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.073	ENSHBUG00000004882	papolg	89	88.228	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000002718	papolg	99	72.230	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	72.059	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.259	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	72.090	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.725	ENSHCOG00000006782	papolg	89	88.591	Hippocampus_comes
ENSGACG00000002718	papolg	100	77.719	ENSIPUG00000021642	papolg	100	77.658	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.863	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.693	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000002718	papolg	58	86.480	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	86.480	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.117	ENSKMAG00000016439	papolg	97	82.013	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000002718	papolg	100	87.018	ENSLBEG00000023218	papolg	89	87.018	Labrus_bergylta
ENSGACG00000002718	papolg	99	65.765	ENSLACG00000009543	PAPOLG	98	65.765	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000002718	papolg	100	78.080	ENSLOCG00000016130	papolg	100	77.618	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.673	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	Loxodonta_africana
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.207	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	72.000	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.207	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	72.000	Macaca_mulatta
ENSGACG00000002718	papolg	100	64.815	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	63.926	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.941	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	71.771	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000002718	papolg	100	90.094	ENSMAMG00000010667	papolg	99	83.580	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.073	ENSMZEG00005018140	papolg	99	84.647	Maylandia_zebra
ENSGACG00000002718	papolg	98	64.372	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	64.450	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000002718	papolg	99	72.423	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	71.984	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.693	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	71.600	Microcebus_murinus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.751	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.414	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000002718	papolg	100	89.453	ENSMMOG00000008020	papolg	99	88.652	Mola_mola
ENSGACG00000002718	papolg	98	71.678	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	71.198	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000002718	papolg	100	90.361	ENSMALG00000007012	papolg	89	89.826	Monopterus_albus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.053	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	87.089	Mus_caroli
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	87.089	Mus_musculus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.523	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	71.353	Mus_pahari
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	87.089	Mus_spretus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	71.485	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000002718	papolg	99	71.909	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	71.736	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.353	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	71.353	Nannospalax_galili
ENSGACG00000002718	papolg	100	78.324	ENSNBRG00000011943	papolg	99	78.884	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000002718	papolg	58	86.014	ENSNLEG00000009507	-	100	86.014	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000002718	papolg	63	68.502	ENSMEUG00000013605	-	68	68.502	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.731	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	71.561	Ochotona_princeps
ENSGACG00000002718	papolg	57	83.215	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	83.215	Octodon_degus
ENSGACG00000002718	papolg	100	81.575	ENSONIG00000002985	papolg	100	81.442	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000002718	papolg	99	71.333	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	71.084	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.863	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	71.693	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000002718	papolg	100	87.450	ENSORLG00000001577	papolg	89	87.583	Oryzias_latipes
ENSGACG00000002718	papolg	100	87.316	ENSORLG00020002482	papolg	89	87.450	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000002718	papolg	100	87.450	ENSORLG00015008836	papolg	89	87.583	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.235	ENSOMEG00000001406	papolg	89	88.102	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000002718	papolg	58	61.124	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	60.674	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.185	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	71.315	Ovis_aries
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	71.904	Pan_paniscus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.354	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	71.618	Panthera_pardus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.222	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	71.485	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	71.904	Pan_troglodytes
ENSGACG00000002718	papolg	100	68.700	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	68.526	Papio_anubis
ENSGACG00000002718	papolg	92	76.513	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	75.606	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000002718	papolg	100	76.253	ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.564	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000002718	papolg	98	68.514	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	98	68.428	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000002718	papolg	99	72.594	ENSPEMG00000008960	-	100	71.126	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000002718	papolg	99	52.749	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.618	Petromyzon_marinus
ENSGACG00000002718	papolg	66	64.185	ENSPMAG00000004864	-	98	64.185	Petromyzon_marinus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.598	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	71.126	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000002718	papolg	100	86.298	ENSPFOG00000012909	papolg	99	86.968	Poecilia_formosa
ENSGACG00000002718	papolg	100	86.016	ENSPLAG00000018445	papolg	89	86.755	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000002718	papolg	100	86.790	ENSPMEG00000003961	papolg	89	86.207	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000002718	papolg	100	85.771	ENSPREG00000010358	papolg	89	85.903	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.941	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	71.771	Pongo_abelii
ENSGACG00000002718	papolg	99	65.047	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	64.603	Procavia_capensis
ENSGACG00000002718	papolg	100	65.344	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	65.344	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000002718	papolg	88	81.607	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	81.607	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000002718	papolg	100	88.073	ENSPNYG00000006729	papolg	99	84.388	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000002718	papolg	100	78.100	ENSPNAG00000015521	papolg	100	77.381	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.848	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	72.244	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000002718	papolg	100	67.420	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	66.578	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.074	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	71.257	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.340	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	72.170	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000002718	papolg	94	71.488	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	70.990	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000002718	papolg	100	73.844	ENSSFOG00015002383	papolg	100	73.844	Scleropages_formosus
ENSGACG00000002718	papolg	100	66.222	ENSSFOG00015011874	papolg	100	65.688	Scleropages_formosus
ENSGACG00000002718	papolg	88	97.662	ENSSMAG00000015598	papolg	95	86.003	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000002718	papolg	100	90.763	ENSSDUG00000000912	papolg	99	84.657	Seriola_dumerili
ENSGACG00000002718	papolg	100	90.629	ENSSLDG00000001217	papolg	89	90.629	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000002718	papolg	100	68.609	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	68.966	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000002718	papolg	100	90.564	ENSSPAG00000009004	papolg	99	84.450	Stegastes_partitus
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.090	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.788	Sus_scrofa
ENSGACG00000002718	papolg	72	72.608	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	72.608	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000002718	papolg	100	84.027	ENSTRUG00000006410	papolg	99	82.907	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000002718	papolg	100	81.242	ENSTNIG00000017106	papolg	100	81.060	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000002718	papolg	99	65.287	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	99	65.107	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000002718	papolg	100	67.989	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	67.682	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000002718	papolg	100	71.429	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	71.448	Ursus_americanus
ENSGACG00000002718	papolg	99	72.193	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	71.448	Ursus_maritimus
ENSGACG00000002718	papolg	99	68.850	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	99	68.414	Vicugna_pacos
ENSGACG00000002718	papolg	100	72.090	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	71.353	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000002718	papolg	100	68.302	ENSXETG00000002208	papolg	100	68.302	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000002718	papolg	68	95.472	ENSXCOG00000006611	papolg	75	95.472	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000002718	papolg	75	92.927	ENSXMAG00000007383	papolg	97	92.927	Xiphophorus_maculatus