EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000002927 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: SKI2 homolog%2C superkiller viralicidic activity 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11601 bases
Position: chrgroupX:3306525-3318125
Accession: ZDB-GENE-010430-5
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000003834	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.6e-29	1	1
ENSGACP00000003834	DEAD	PF00270.29	9.9e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000003847	-	3937	-	ENSGACP00000003834	1244 (aa)	-	G3NET3

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000002927's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000002927's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000002927	skiv2l	75	36.583	ENSGACG00000016260	mtrex	96	36.164

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.274	ENSG00000204351	SKIV2L	99	60.079	Homo_sapiens
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.569	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	88.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.355	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.238	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	86.360	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	86.360	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.969	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	88.969	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.729	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	88.729	Amphiprion_percula
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.889	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	88.889	Anabas_testudineus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	62.480	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	62.763	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.662	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	60.461	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.729	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	88.729	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	80.732	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	80.812	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.582	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	60.382	Bos_taurus
ENSGACG00000002927	skiv2l	95	40.775	WBGene00008502	skih-2	99	40.388	Caenorhabditis_elegans
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.467	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.382	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.258	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	60.223	Canis_familiaris
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.258	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	60.223	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.596	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	60.397	Capra_hircus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.081	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	59.762	Carlito_syrichta
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.356	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	59.936	Cavia_porcellus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.743	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	60.541	Cebus_capucinus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.582	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	60.461	Cercocebus_atys
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.435	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.000	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.775	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	60.461	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000002927	skiv2l	84	65.832	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	92	66.069	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000002927	skiv2l	91	51.215	ENSCING00000005576	-	98	51.042	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.582	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.144	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.726	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	60.541	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	85.188	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	85.268	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.620	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	88.489	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	82.166	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	82.166	Danio_rerio
ENSGACG00000002927	skiv2l	92	64.083	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	57.753	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000002927	skiv2l	91	46.200	FBgn0039117	tst	95	46.247	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000002927	skiv2l	68	72.152	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	72.152	Echinops_telfairi
ENSGACG00000002927	skiv2l	90	54.670	ENSEBUG00000013680	-	98	53.683	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000002927	skiv2l	92	61.565	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	61.803	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000002927	skiv2l	93	60.443	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	60.621	Equus_caballus
ENSGACG00000002927	skiv2l	51	73.518	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	73.518	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	84.701	ENSELUG00000000181	skiv2l	100	84.622	Esox_lucius
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.420	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	60.302	Felis_catus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.182	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.159	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.329	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	88.329	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	82.091	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	82.091	Gadus_morhua
ENSGACG00000002927	skiv2l	77	56.309	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	55.828	Gallus_gallus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.489	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.489	Gambusia_affinis
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.501	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	60.302	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.729	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	88.729	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.821	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.413	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.131	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	58.744	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	81.654	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	81.491	Hippocampus_comes
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	80.637	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	80.891	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.508	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.587	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	56	64.286	ENSLACG00000002986	-	60	64.286	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.405	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.223	Loxodonta_africana
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.662	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	60.541	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.662	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	60.541	Macaca_mulatta
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.516	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.397	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.420	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	60.302	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.809	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	88.809	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.649	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	88.649	Maylandia_zebra
ENSGACG00000002927	skiv2l	67	49.779	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	49.889	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.631	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.301	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.709	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	60.745	Microcebus_murinus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.645	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	59.303	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	84.900	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	84.900	Mola_mola
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.766	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.859	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	83.413	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.413	Monopterus_albus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.677	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	60.159	Mus_caroli
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.694	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	60.254	Mus_musculus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.936	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	60.652	Mus_pahari
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.533	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	60.095	Mus_spretus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.405	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.159	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.903	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	59.715	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	85.084	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	85.084	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.806	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.743	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000002927	skiv2l	78	61.947	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.435	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	60.159	Ochotona_princeps
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.435	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	60.000	Octodon_degus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	89.139	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	89.139	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.838	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	60.635	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	87.231	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	87.231	Oryzias_latipes
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	87.071	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	87.071	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	86.991	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	86.991	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	87.200	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	87.200	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.579	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	60.380	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	57.256	ENSOARG00000002411	-	99	57.110	Ovis_aries
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.161	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	60.175	Pan_paniscus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.435	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	60.317	Panthera_pardus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.032	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.921	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.582	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.382	Pan_troglodytes
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.566	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	59.666	Papio_anubis
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	77.681	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	77.496	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	85.044	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	85.299	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.291	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	59.826	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.731	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.683	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.249	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	88.249	Poecilia_formosa
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.090	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	88.090	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.249	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	88.249	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	83.589	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	83.589	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.097	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.905	Pongo_abelii
ENSGACG00000002927	skiv2l	76	62.745	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	62.745	Procavia_capensis
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.613	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	60.493	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.757	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.686	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	84.087	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	82.229	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	82.215	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	82.043	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.968	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	60.524	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	59.551	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	59.556	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.662	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.541	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000002927	skiv2l	90	39.439	YLR398C	-	90	39.421	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.743	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.541	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.064	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.380	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	80.366	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	80.366	Scleropages_formosus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	89.185	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	89.129	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	89.448	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	89.448	Seriola_dumerili
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	83.065	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.065	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	59.598	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	59.690	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	95	89.731	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.731	Stegastes_partitus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.541	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.524	Sus_scrofa
ENSGACG00000002927	skiv2l	69	85.027	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.956	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	84.282	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.147	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000002927	skiv2l	93	62.990	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.990	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	56.567	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.508	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.516	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.397	Ursus_americanus
ENSGACG00000002927	skiv2l	92	61.717	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	61.803	Ursus_maritimus
ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.193	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	60.191	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	58.333	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.689	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.359	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	88.359	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.329	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	88.169	Xiphophorus_maculatus