EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000006425 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1914 bases
Position: chrgroupX:9129310-9131223
Accession: ZDB-GENE-041007-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000008495	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	2.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000008514	-	786	-	ENSGACP00000008495	262 (aa)	-	G3NT27

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSG00000105849	TWISTNB	66	48.548	Homo_sapiens
ENSGACG00000006425	twistnb	93	70.270	ENSAPOG00000011796	twistnb	68	70.656	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000006425	twistnb	92	67.589	ENSACIG00000020400	twistnb	68	67.589	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000006425	twistnb	93	69.884	ENSAOCG00000024200	twistnb	68	70.656	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000006425	twistnb	92	70.155	ENSAPEG00000016750	twistnb	68	70.930	Amphiprion_percula
ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.651	ENSATEG00000017956	twistnb	67	69.048	Anabas_testudineus
ENSGACG00000006425	twistnb	64	55.952	ENSACAG00000011817	TWISTNB	85	55.952	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000006425	twistnb	87	48.018	ENSANAG00000026418	TWISTNB	64	48.899	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.254	ENSACLG00000022280	twistnb	63	68.254	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000006425	twistnb	73	59.162	ENSAMXG00000035868	twistnb	76	50.199	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000006425	twistnb	74	52.577	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	66	49.351	Bos_taurus
ENSGACG00000006425	twistnb	87	48.899	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	64	50.661	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	60	50.000	Canis_familiaris
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	56	50.000	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000006425	twistnb	74	52.577	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	66	50.000	Capra_hircus
ENSGACG00000006425	twistnb	85	47.982	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	62	49.776	Carlito_syrichta
ENSGACG00000006425	twistnb	69	54.945	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	63	50.698	Cavia_porcellus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	64	50.220	Cebus_capucinus
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.067	ENSCATG00000035621	TWISTNB	74	47.082	Cercocebus_atys
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	64	50.000	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.067	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	74	47.082	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	58.046	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	71	47.934	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSCANG00000038759	TWISTNB	64	50.220	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	ENSCGRG00001000499	Twistnb	66	50.220	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000006425	twistnb	75	73.171	ENSCVAG00000014324	twistnb	73	60.507	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000006425	twistnb	69	63.536	ENSDARG00000024416	twistnb	57	57.014	Danio_rerio
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	ENSDNOG00000006438	-	62	53.023	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000006425	twistnb	87	48.899	ENSDORG00000007795	Twistnb	67	50.439	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.172	ENSEASG00005021702	TWISTNB	62	48.472	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.172	ENSECAG00000014563	TWISTNB	62	48.684	Equus_caballus
ENSGACG00000006425	twistnb	75	66.497	ENSELUG00000000098	TWISTNB	66	56.780	Esox_lucius
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.172	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	73	45.267	Felis_catus
ENSGACG00000006425	twistnb	60	56.410	ENSFALG00000009761	TWISTNB	50	57.516	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	61	51.675	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000006425	twistnb	77	72.170	ENSFHEG00000013318	twistnb	69	65.323	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000006425	twistnb	72	79.894	ENSGAFG00000018309	twistnb	72	65.530	Gambusia_affinis
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.008	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	74	47.471	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.254	ENSHBUG00000020155	twistnb	63	68.254	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	60	51.923	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	60	51.923	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000006425	twistnb	92	62.934	ENSHCOG00000010590	twistnb	61	65.637	Hippocampus_comes
ENSGACG00000006425	twistnb	77	57.426	ENSIPUG00000004117	twistnb	71	48.828	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	60	50.870	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSJJAG00000015887	Twistnb	64	50.000	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000006425	twistnb	91	67.470	ENSKMAG00000001591	twistnb	68	67.331	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000006425	twistnb	77	77.723	ENSLBEG00000024225	twistnb	68	66.016	Labrus_bergylta
ENSGACG00000006425	twistnb	66	59.195	ENSLACG00000010508	TWISTNB	50	59.195	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000006425	twistnb	68	62.921	ENSLOCG00000011399	twistnb	63	57.692	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	62	51.174	Loxodonta_africana
ENSGACG00000006425	twistnb	100	44.318	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	74	46.693	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000006425	twistnb	100	44.318	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	74	46.693	Macaca_mulatta
ENSGACG00000006425	twistnb	100	44.318	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	74	46.693	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.067	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	74	47.082	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.254	ENSMZEG00005007561	twistnb	63	68.254	Maylandia_zebra
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSMICG00000036489	TWISTNB	66	50.000	Microcebus_murinus
ENSGACG00000006425	twistnb	100	43.182	ENSMOCG00000003458	Twistnb	77	44.664	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000006425	twistnb	89	60.000	ENSMMOG00000020085	twistnb	68	61.597	Mola_mola
ENSGACG00000006425	twistnb	74	68.116	ENSMALG00000016407	twistnb	70	61.194	Monopterus_albus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	63	51.852	Mus_caroli
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSMUSG00000020561	Twistnb	61	51.923	Mus_musculus
ENSGACG00000006425	twistnb	99	44.697	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	76	44.402	Mus_pahari
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	61	51.923	Mus_spretus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	60	49.327	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000006425	twistnb	65	52.632	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	66	47.887	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000006425	twistnb	64	57.143	ENSNGAG00000022455	Twistnb	84	57.143	Nannospalax_galili
ENSGACG00000006425	twistnb	91	69.512	ENSNBRG00000008652	twistnb	67	69.200	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.442	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	74	47.471	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000006425	twistnb	85	46.696	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	63	48.879	Ochotona_princeps
ENSGACG00000006425	twistnb	95	46.400	ENSODEG00000007222	TWISTNB	75	46.415	Octodon_degus
ENSGACG00000006425	twistnb	89	67.490	ENSORLG00000004005	twistnb	61	67.059	Oryzias_latipes
ENSGACG00000006425	twistnb	100	67.033	ENSORLG00020002579	twistnb	67	67.194	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000006425	twistnb	100	66.667	ENSORLG00015013403	twistnb	60	67.059	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000006425	twistnb	66	57.471	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	65	51.082	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000006425	twistnb	74	52.577	ENSOARG00000009803	TWISTNB	65	50.435	Ovis_aries
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.442	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	74	47.471	Pan_paniscus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.172	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	73	45.643	Panthera_pardus
ENSGACG00000006425	twistnb	63	56.364	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	79	46.025	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.442	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	74	47.471	Pan_troglodytes
ENSGACG00000006425	twistnb	100	46.642	ENSPANG00000015736	TWISTNB	74	46.899	Papio_anubis
ENSGACG00000006425	twistnb	75	59.391	ENSPKIG00000025635	twistnb	67	51.653	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000006425	twistnb	100	63.899	ENSPMGG00000019023	twistnb	68	65.098	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000006425	twistnb	100	44.444	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	72	46.154	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.172	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	66	47.718	Pongo_abelii
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	66	48.707	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000006425	twistnb	65	57.895	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	63	48.899	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000006425	twistnb	93	68.379	ENSPNYG00000002674	twistnb	67	68.254	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000006425	twistnb	74	57.216	ENSPNAG00000011956	twistnb	59	55.349	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	ENSRNOG00000010750	Twistnb	64	52.582	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	63	50.220	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSRROG00000040155	TWISTNB	64	50.220	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000006425	twistnb	92	47.303	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	67	48.963	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000006425	twistnb	67	58.523	ENSSFOG00015012788	twistnb	76	49.167	Scleropages_formosus
ENSGACG00000006425	twistnb	93	67.984	ENSSMAG00000012792	twistnb	68	67.984	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000006425	twistnb	93	67.181	ENSSDUG00000007038	twistnb	68	67.181	Seriola_dumerili
ENSGACG00000006425	twistnb	64	54.762	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	62	48.792	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000006425	twistnb	93	71.032	ENSSPAG00000005871	twistnb	67	71.429	Stegastes_partitus
ENSGACG00000006425	twistnb	86	48.018	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	48.899	Sus_scrofa
ENSGACG00000006425	twistnb	57	58.000	ENSTGUG00000002645	TWISTNB	99	58.000	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000006425	twistnb	100	58.052	ENSTNIG00000017778	twistnb	74	59.127	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000006425	twistnb	88	49.565	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	64	51.082	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.747	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	62	50.242	Ursus_americanus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	55.172	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	62	49.519	Ursus_maritimus
ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.322	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	61	50.943	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000006425	twistnb	75	78.571	ENSXCOG00000020199	twistnb	69	67.480	Xiphophorus_couchianus