EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000006550 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4953 bases
Position: chrgroupI:3340594-3345546
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000008663	SRP54	PF00448.22	8.9e-48	1	1
ENSGACP00000008663	SRP54_N	PF02881.19	1.8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000008682	-	2187	-	ENSGACP00000008663	642 (aa)	-	G3NTJ5

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000006550's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000006550's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.231	ENSG00000182934	SRPRA	100	67.231	Homo_sapiens
ENSGACG00000006550	srpra	100	85.538	ENSAPOG00000017588	srpra	100	86.064	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.492	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	67.435	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000006550	srpra	100	79.507	ENSACIG00000021588	srpra	100	80.835	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000006550	srpra	100	85.692	ENSAOCG00000018884	srpra	100	86.217	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000006550	srpra	100	85.692	ENSAPEG00000022286	srpra	92	86.217	Amphiprion_percula
ENSGACG00000006550	srpra	100	83.103	ENSATEG00000023578	srpra	100	84.580	Anabas_testudineus
ENSGACG00000006550	srpra	94	70.279	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	71.242	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000006550	srpra	100	69.665	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	70.245	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.337	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	67.077	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.435	ENSACLG00000000518	srpra	100	83.308	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000006550	srpra	100	74.143	ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.897	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.667	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.334	Bos_taurus
ENSGACG00000006550	srpra	99	48.308	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.793	Caenorhabditis_elegans
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.183	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	66.923	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000006550	srpra	100	65.789	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	65.997	Canis_familiaris
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.492	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	67.697	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.284	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.026	Capra_hircus
ENSGACG00000006550	srpra	76	85.976	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	62.305	Carlito_syrichta
ENSGACG00000006550	srpra	95	64.648	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.543	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.388	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	65.408	Cebus_capucinus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.852	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	67.852	Cercocebus_atys
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.697	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	66.770	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.492	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.231	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000006550	srpra	53	87.755	ENSCHOG00000010015	-	71	87.755	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000006550	srpra	100	70.615	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	70.968	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000006550	srpra	99	57.209	ENSCING00000008954	-	100	56.992	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000006550	srpra	99	58.257	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.410	Ciona_savignyi
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.852	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	66.924	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.287	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	67.287	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.287	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.622	ENSCSEG00000002374	srpra	100	82.622	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.236	ENSCVAG00000019881	srpra	100	82.236	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	75.191	ENSDARG00000061124	srpra	100	74.885	Danio_rerio
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.474	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.212	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.752	ENSDORG00000016719	Srpr	100	66.822	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000006550	srpra	99	52.294	FBgn0010391	Gtp-bp	100	53.130	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.156	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.156	Echinops_telfairi
ENSGACG00000006550	srpra	50	83.333	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.810	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.315	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.564	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.315	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.564	Equus_caballus
ENSGACG00000006550	srpra	100	63.215	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.906	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.887	ENSELUG00000017643	srpra	100	82.901	Esox_lucius
ENSGACG00000006550	srpra	80	62.956	ENSFCAG00000030894	-	99	60.461	Felis_catus
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.567	ENSFCAG00000011274	-	100	66.564	Felis_catus
ENSGACG00000006550	srpra	99	67.438	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.492	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.132	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000006550	srpra	100	83.410	ENSFHEG00000016959	srpra	100	83.639	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.620	ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.620	Gadus_morhua
ENSGACG00000006550	srpra	100	70.615	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	70.661	Gallus_gallus
ENSGACG00000006550	srpra	100	83.153	ENSGAFG00000000453	srpra	100	83.002	Gambusia_affinis
ENSGACG00000006550	srpra	100	70.923	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	71.275	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.077	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	67.077	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.280	ENSHBUG00000000119	srpra	100	83.153	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.287	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.287	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.927	ENSHCOG00000010749	srpra	100	82.927	Hippocampus_comes
ENSGACG00000006550	srpra	94	74.267	ENSIPUG00000000867	srpra	99	74.430	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.183	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	67.284	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	66.512	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.822	ENSKMAG00000002280	srpra	100	83.053	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000006550	srpra	100	84.793	ENSLBEG00000009608	srpra	100	84.946	Labrus_bergylta
ENSGACG00000006550	srpra	100	71.363	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	72.936	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000006550	srpra	100	73.668	ENSLOCG00000002733	srpra	100	73.668	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.462	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	66.411	Loxodonta_africana
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	67.385	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	67.385	Macaca_mulatta
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	67.852	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.852	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	67.852	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.769	ENSMAMG00000000473	srpra	100	82.462	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.435	ENSMZEG00005013432	srpra	100	83.308	Maylandia_zebra
ENSGACG00000006550	srpra	94	70.115	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	70.492	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.287	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	67.284	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	67.079	Microcebus_murinus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.977	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	66.977	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000006550	srpra	100	79.160	ENSMMOG00000005019	srpra	100	79.160	Mola_mola
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.477	ENSMODG00000004576	-	100	66.463	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000006550	srpra	100	83.846	ENSMALG00000011343	srpra	100	83.920	Monopterus_albus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.977	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.697	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.977	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSGACG00000006550	srpra	100	64.454	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	64.801	Mus_spretus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.183	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	67.233	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.161	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	68.161	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.311	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	66.977	Nannospalax_galili
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.535	ENSNBRG00000017311	srpra	100	83.051	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000006550	srpra	99	64.019	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.721	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000006550	srpra	94	66.776	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	65.196	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000006550	srpra	100	64.142	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.609	Ochotona_princeps
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.588	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	67.588	Octodon_degus
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.818	ENSONIG00000005324	srpra	100	82.389	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.852	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	67.588	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.269	ENSORLG00000014676	srpra	93	94.921	Oryzias_latipes
ENSGACG00000006550	srpra	100	80.586	ENSORLG00020009240	srpra	100	81.664	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.202	ENSORLG00015015405	srpra	100	81.510	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.356	ENSOMEG00000005872	srpra	100	82.435	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.492	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	67.852	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000006550	srpra	100	64.198	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	65.131	Ovis_aries
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.231	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	67.231	Pan_paniscus
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.567	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	66.564	Panthera_pardus
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.413	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	66.410	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.231	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	67.231	Pan_troglodytes
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	67.385	Papio_anubis
ENSGACG00000006550	srpra	100	76.498	ENSPKIG00000016106	srpra	100	77.112	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000006550	srpra	94	70.724	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	71.311	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.269	ENSPMGG00000001393	srpra	100	82.817	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.132	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	67.132	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000006550	srpra	99	61.646	ENSPMAG00000009559	srpra	99	62.519	Petromyzon_marinus
ENSGACG00000006550	srpra	100	66.717	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.228	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.769	ENSPFOG00000003114	srpra	100	83.077	Poecilia_formosa
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.615	ENSPLAG00000007323	srpra	100	82.848	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.769	ENSPMEG00000015658	srpra	100	83.077	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.923	ENSPREG00000004937	srpra	100	83.155	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000006550	srpra	89	85.526	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	85.526	Pongo_abelii
ENSGACG00000006550	srpra	61	89.922	ENSPCAG00000003801	-	61	89.922	Procavia_capensis
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.697	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	66.975	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	67.488	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000006550	srpra	100	82.435	ENSPNYG00000012371	srpra	100	83.308	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000006550	srpra	100	76.417	ENSPNAG00000013476	srpra	100	75.767	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.132	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	67.132	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	67.385	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.802	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	67.538	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000006550	srpra	50	41.935	YDR292C	-	52	41.945	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.183	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	66.923	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000006550	srpra	94	65.971	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	65.359	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000006550	srpra	100	71.851	ENSSFOG00015008837	srpra	100	73.053	Scleropages_formosus
ENSGACG00000006550	srpra	100	77.449	ENSSMAG00000002783	srpra	100	77.138	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000006550	srpra	100	84.427	ENSSDUG00000013920	srpra	100	78.882	Seriola_dumerili
ENSGACG00000006550	srpra	100	84.275	ENSSLDG00000008601	srpra	93	84.275	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000006550	srpra	81	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.558	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	68.721	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	85.583	ENSSPAG00000005103	srpra	100	86.107	Stegastes_partitus
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.203	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.281	Sus_scrofa
ENSGACG00000006550	srpra	94	67.974	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	68.033	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000006550	srpra	100	81.567	ENSTRUG00000006856	srpra	100	81.567	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000006550	srpra	100	78.354	ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.149	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000006550	srpra	100	68.259	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	65.224	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.647	Ursus_americanus
ENSGACG00000006550	srpra	96	61.563	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.722	Ursus_maritimus
ENSGACG00000006550	srpra	69	89.922	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	89.922	Vicugna_pacos
ENSGACG00000006550	srpra	100	67.647	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	67.852	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000006550	srpra	100	60.000	ENSXETG00000003920	srpra	100	61.840	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000006550	srpra	85	94.603	ENSXCOG00000001286	srpra	98	94.603	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000006550	srpra	100	83.155	ENSXMAG00000028401	srpra	100	83.155	Xiphophorus_maculatus