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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSGACG00000007245 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4256 bases
Position: chrgroupV:9476331-9480586
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000009757	eRF1_2	PF03464.15	1.6e-32	1	1
ENSGACP00000009677	eRF1_2	PF03464.15	3.9e-14	1	1
ENSGACP00000009757	eRF1_3	PF03465.15	5.2e-25	1	1
ENSGACP00000009757	eRF1_1	PF03463.15	1.4e-52	1	1
ENSGACP00000009677	eRF1_1	PF03463.15	1.8e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000009777	-	1593	-	ENSGACP00000009757	385 (aa)	-	G3NWN8
ENSGACT00000009697	-	2434	-	ENSGACP00000009677	187 (aa)	-	G3NWF8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSG00000152684	PELO	100	80.260	Homo_sapiens
ENSGACG00000007245	pelo	97	93.956	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000007245	pelo	97	93.956	ENSAPOG00000023700	-	90	93.117	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000007245	pelo	100	92.987	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.987	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSAMEG00000007734	PELO	100	80.519	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000007245	pelo	97	93.407	ENSACIG00000014386	pelo	97	91.716	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000007245	pelo	100	93.247	ENSAOCG00000023717	pelo	100	93.247	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000007245	pelo	100	93.247	ENSAPEG00000011235	pelo	100	93.247	Amphiprion_percula
ENSGACG00000007245	pelo	100	93.766	ENSATEG00000019550	pelo	100	93.766	Anabas_testudineus
ENSGACG00000007245	pelo	77	70.805	ENSAPLG00000013265	PELO	100	70.805	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000007245	pelo	97	80.220	ENSACAG00000004352	PELO	100	79.481	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSANAG00000014096	PELO	100	80.000	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.649	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000007245	pelo	97	92.857	ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.192	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000007245	pelo	100	79.740	ENSBTAG00000003268	PELO	99	79.740	Bos_taurus
ENSGACG00000007245	pelo	97	62.983	WBGene00011280	pelo-1	100	59.580	Caenorhabditis_elegans
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSCJAG00000035190	PELO	100	80.000	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	ENSCAFG00020023234	PELO	100	80.779	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000007245	pelo	100	79.481	ENSCHIG00000016410	PELO	99	79.481	Capra_hircus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSTSYG00000005203	PELO	100	80.519	Carlito_syrichta
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	ENSCPOG00000027406	PELO	100	80.779	Cavia_porcellus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSCCAG00000035600	PELO	100	80.000	Cebus_capucinus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSCATG00000011829	PELO	100	80.260	Cercocebus_atys
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSCLAG00000005043	PELO	100	80.260	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSCSAG00000016692	PELO	100	80.260	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSCHOG00000000523	PELO	100	80.260	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000007245	pelo	97	81.868	ENSCPBG00000007544	PELO	100	80.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000007245	pelo	97	70.879	ENSCING00000001979	-	100	64.935	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000007245	pelo	97	70.879	ENSCSAVG00000006158	-	100	66.494	Ciona_savignyi
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSCANG00000023382	PELO	100	80.260	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000007245	pelo	97	81.319	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	80.260	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000007245	pelo	97	82.967	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	81.039	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000007245	pelo	100	91.948	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.948	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000007245	pelo	100	91.948	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.948	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000007245	pelo	97	92.308	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.091	Danio_rerio
ENSGACG00000007245	pelo	97	81.868	ENSDNOG00000036721	PELO	100	77.202	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000007245	pelo	100	81.299	ENSDORG00000016689	Pelo	100	81.299	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000007245	pelo	97	71.429	FBgn0011207	pelo	97	66.580	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000007245	pelo	91	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSEASG00005013348	PELO	100	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000007245	pelo	100	92.208	ENSELUG00000023229	pelo	100	92.208	Esox_lucius
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSFCAG00000032341	PELO	100	80.519	Felis_catus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSFALG00000004559	PELO	100	80.260	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000007245	pelo	97	82.967	ENSFDAG00000002076	PELO	88	80.986	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000007245	pelo	100	91.429	ENSFHEG00000009769	pelo	100	91.429	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000007245	pelo	97	93.956	ENSGMOG00000005849	pelo	100	90.649	Gadus_morhua
ENSGACG00000007245	pelo	97	93.407	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.390	Gambusia_affinis
ENSGACG00000007245	pelo	97	81.319	ENSGAGG00000004018	PELO	100	79.740	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSGGOG00000012635	PELO	100	80.260	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.649	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	ENSHGLG00000005932	PELO	100	80.779	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000007245	pelo	100	78.701	ENSHGLG00100017627	PELO	100	78.701	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000007245	pelo	100	90.130	ENSHCOG00000016782	pelo	100	90.130	Hippocampus_comes
ENSGACG00000007245	pelo	100	88.831	ENSIPUG00000020627	pelo	100	88.831	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSSTOG00000027378	PELO	100	80.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000007245	pelo	97	82.418	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	78.442	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000007245	pelo	100	92.208	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.208	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000007245	pelo	97	97.802	ENSLBEG00000022399	pelo	100	93.247	Labrus_bergylta
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSLAFG00000020551	PELO	100	80.000	Loxodonta_africana
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSMFAG00000000651	PELO	100	80.260	Macaca_fascicularis
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ENSGACG00000007245	pelo	97	94.505	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	ENSMZEG00005014258	pelo	100	90.649	Maylandia_zebra
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ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	80.519	Microtus_ochrogaster
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ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	80.260	Mus_pahari
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	80.000	Mus_spretus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSMLUG00000024132	PELO	100	80.260	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	80.779	Nannospalax_galili
ENSGACG00000007245	pelo	100	90.649	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.649	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSNLEG00000035970	PELO	100	80.260	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000007245	pelo	100	79.481	ENSMEUG00000005468	PELO	100	79.481	Notamacropus_eugenii
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ENSGACG00000007245	pelo	100	80.779	ENSODEG00000017579	PELO	100	80.779	Octodon_degus
ENSGACG00000007245	pelo	97	92.857	ENSONIG00000011511	pelo	100	91.429	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSOCUG00000023902	PELO	100	80.260	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000007245	pelo	100	92.987	ENSORLG00000005827	pelo	100	92.987	Oryzias_latipes
ENSGACG00000007245	pelo	100	93.247	ENSORLG00020016456	pelo	100	93.247	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000007245	pelo	100	93.766	ENSORLG00015014447	pelo	100	93.889	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000007245	pelo	100	93.247	ENSOMEG00000021567	pelo	100	93.247	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSOGAG00000027940	PELO	100	80.519	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000007245	pelo	100	79.740	ENSOARG00000008324	PELO	99	79.740	Ovis_aries
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSPPAG00000038951	PELO	100	80.260	Pan_paniscus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSPPRG00000018800	PELO	100	80.519	Panthera_pardus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSPTIG00000019988	PELO	100	80.519	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.000	Pan_troglodytes
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.260	ENSPANG00000010902	PELO	100	80.260	Papio_anubis
ENSGACG00000007245	pelo	100	90.390	ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.390	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000007245	pelo	97	81.868	ENSPSIG00000004971	PELO	100	80.260	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000007245	pelo	97	93.407	ENSPMGG00000014561	pelo	94	92.126	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.519	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	80.519	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000007245	pelo	100	80.000	ENSPCIG00000004880	PELO	100	80.000	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000007245	pelo	100	91.169	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.169	Poecilia_formosa
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ENSGACG00000007245	pelo	97	32.895	YNL001W	-	97	32.895	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSGACG00000007245	pelo	63	77.869	ENSSHAG00000010770	PELO	100	77.869	Sarcophilus_harrisii
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