EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000007305 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA-splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4879 bases
Position: chrgroupXV:4305132-4310010
Accession: ZDB-GENE-040801-170
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000009699	SYF2	PF08231.12	5.9e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000009719	-	921	-	ENSGACP00000009699	239 (aa)	-	G3NWI0

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000007305's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000007305's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSG00000117614	SYF2	88	83.256	Homo_sapiens
ENSGACG00000007305	syf2	93	90.090	ENSAPOG00000001174	syf2	93	90.090	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000007305	syf2	82	82.564	ENSAMEG00000010134	-	100	82.564	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000007305	syf2	96	78.112	ENSAMEG00000010115	-	88	82.326	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000007305	syf2	98	88.936	ENSACIG00000023688	syf2	89	91.892	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000007305	syf2	93	87.838	ENSAOCG00000010912	syf2	64	89.268	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	ENSAOCG00000022046	syf2	94	90.090	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	ENSAPEG00000018858	syf2	86	90.090	Amphiprion_percula
ENSGACG00000007305	syf2	91	93.088	ENSATEG00000007745	syf2	93	91.892	Anabas_testudineus
ENSGACG00000007305	syf2	84	83.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000007305	syf2	69	68.263	ENSACAG00000026777	-	100	68.263	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000007305	syf2	85	80.882	ENSACAG00000013653	-	100	80.882	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSANAG00000032473	SYF2	88	83.721	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000007305	syf2	93	90.991	ENSACLG00000019916	syf2	93	90.991	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000007305	syf2	100	82.427	ENSAMXG00000004051	syf2	93	86.036	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.273	ENSBTAG00000001651	SYF2	92	82.569	Bos_taurus
ENSGACG00000007305	syf2	87	52.133	WBGene00019402	syf-2	90	51.415	Caenorhabditis_elegans
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSCJAG00000046570	SYF2	88	83.721	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.326	ENSCAFG00000012895	-	87	82.326	Canis_familiaris
ENSGACG00000007305	syf2	87	78.469	ENSCAFG00000030331	-	92	78.469	Canis_familiaris
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.326	ENSCAFG00020021091	-	87	82.326	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000007305	syf2	67	80.503	ENSCAFG00020021094	-	84	80.503	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.178	ENSCHIG00000020874	SYF2	89	83.256	Capra_hircus
ENSGACG00000007305	syf2	98	77.872	ENSTSYG00000005114	SYF2	88	82.326	Carlito_syrichta
ENSGACG00000007305	syf2	83	82.828	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	Cavia_aperea
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.178	ENSCPOG00000005326	SYF2	89	82.569	Cavia_porcellus
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSCCAG00000022459	SYF2	88	83.721	Cebus_capucinus
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSCATG00000026917	SYF2	88	82.791	Cercocebus_atys
ENSGACG00000007305	syf2	98	79.915	ENSCLAG00000008474	SYF2	88	84.186	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSCSAG00000000948	SYF2	88	82.791	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000007305	syf2	73	61.364	ENSCHOG00000005273	-	92	62.275	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSCPBG00000025073	SYF2	87	83.721	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000007305	syf2	88	53.052	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000007305	syf2	88	49.296	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.296	Ciona_savignyi
ENSGACG00000007305	syf2	90	72.093	ENSCANG00000037322	SYF2	87	72.093	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.824	ENSCGRG00001020733	Syf2	89	84.186	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000007305	syf2	82	84.184	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.920	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000007305	syf2	91	89.908	ENSCSEG00000000117	syf2	93	89.189	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000007305	syf2	100	85.774	ENSCVAG00000019543	syf2	100	85.774	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000007305	syf2	100	84.100	ENSDARG00000004706	syf2	93	87.387	Danio_rerio
ENSGACG00000007305	syf2	98	78.481	ENSDNOG00000047605	SYF2	88	83.256	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000007305	syf2	98	79.487	ENSDORG00000001274	Syf2	91	81.982	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000007305	syf2	95	53.070	FBgn0033556	CG12343	98	53.333	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000007305	syf2	94	64.732	ENSETEG00000015729	SYF2	88	68.657	Echinops_telfairi
ENSGACG00000007305	syf2	82	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSEASG00005004224	-	88	83.721	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000007305	syf2	99	68.333	ENSEASG00005004232	-	89	73.953	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000007305	syf2	96	80.172	ENSECAG00000012023	-	88	83.721	Equus_caballus
ENSGACG00000007305	syf2	96	80.172	ENSECAG00000010440	-	90	83.721	Equus_caballus
ENSGACG00000007305	syf2	71	68.786	ENSEEUG00000015084	SYF2	84	72.727	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000007305	syf2	100	84.937	ENSELUG00000003465	syf2	94	88.789	Esox_lucius
ENSGACG00000007305	syf2	97	78.632	ENSFCAG00000043095	-	87	83.256	Felis_catus
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSFCAG00000010324	-	74	83.721	Felis_catus
ENSGACG00000007305	syf2	85	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	87	81.395	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.500	ENSFDAG00000008310	SYF2	88	83.256	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000007305	syf2	94	74.336	ENSFHEG00000007238	syf2	99	74.888	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000007305	syf2	90	90.233	ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.233	Gadus_morhua
ENSGACG00000007305	syf2	93	81.532	ENSGALG00000013639	SYF2	88	81.532	Gallus_gallus
ENSGACG00000007305	syf2	100	86.192	ENSGAFG00000019435	syf2	93	89.189	Gambusia_affinis
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSGAGG00000010670	SYF2	87	83.721	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSGGOG00000012796	SYF2	88	83.256	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000007305	syf2	96	89.956	ENSHBUG00000020477	syf2	95	90.991	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000007305	syf2	90	73.488	ENSHGLG00000004304	-	89	74.419	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSHGLG00000014393	SYF2	88	83.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000007305	syf2	99	76.763	ENSHGLG00100014722	SYF2	88	83.721	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	ENSHCOG00000012904	syf2	73	91.441	Hippocampus_comes
ENSGACG00000007305	syf2	100	84.519	ENSIPUG00000019859	syf2	91	89.401	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000007305	syf2	61	77.397	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	77.397	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000007305	syf2	83	83.417	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000007305	syf2	100	87.866	ENSKMAG00000013856	syf2	94	90.541	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000007305	syf2	91	93.548	ENSLBEG00000014425	syf2	94	91.518	Labrus_bergylta
ENSGACG00000007305	syf2	90	81.860	ENSLACG00000012064	SYF2	99	75.732	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000007305	syf2	100	81.590	ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.929	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000007305	syf2	77	55.978	ENSLAFG00000030814	-	100	55.978	Loxodonta_africana
ENSGACG00000007305	syf2	98	79.487	ENSLAFG00000023150	-	91	81.982	Loxodonta_africana
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSMFAG00000041831	SYF2	88	82.791	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSMMUG00000002968	SYF2	88	82.791	Macaca_mulatta
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSMNEG00000030180	SYF2	88	82.791	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSMLEG00000030248	SYF2	88	82.791	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000007305	syf2	91	91.705	ENSMAMG00000010403	syf2	92	90.541	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.703	ENSMZEG00005006429	syf2	93	90.991	Maylandia_zebra
ENSGACG00000007305	syf2	83	83.417	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	83.417	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000007305	syf2	100	78.512	ENSMAUG00000018974	Syf2	89	85.116	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000007305	syf2	83	83.417	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	Microcebus_murinus
ENSGACG00000007305	syf2	99	78.243	ENSMOCG00000022938	Syf2	89	84.651	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000007305	syf2	98	85.470	ENSMMOG00000002396	syf2	93	88.288	Mola_mola
ENSGACG00000007305	syf2	90	78.802	ENSMODG00000013951	-	95	78.802	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000007305	syf2	100	86.722	ENSMALG00000010706	syf2	93	90.135	Monopterus_albus
ENSGACG00000007305	syf2	90	85.116	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	89	85.116	Mus_caroli
ENSGACG00000007305	syf2	90	85.116	ENSMUSG00000028821	Syf2	89	85.116	Mus_musculus
ENSGACG00000007305	syf2	90	85.116	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	89	85.116	Mus_pahari
ENSGACG00000007305	syf2	90	85.116	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	89	85.116	Mus_spretus
ENSGACG00000007305	syf2	98	76.891	ENSMPUG00000015801	-	87	82.791	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.326	ENSMPUG00000015802	-	87	82.326	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000007305	syf2	97	79.060	ENSMLUG00000001885	SYF2	88	83.256	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000007305	syf2	99	76.132	ENSNGAG00000007912	Syf2	87	83.256	Nannospalax_galili
ENSGACG00000007305	syf2	100	78.601	ENSNBRG00000010720	syf2	94	79.386	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSNLEG00000035185	SYF2	88	83.256	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000007305	syf2	99	75.833	ENSOPRG00000012870	SYF2	88	82.791	Ochotona_princeps
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.326	ENSODEG00000017664	-	90	82.326	Octodon_degus
ENSGACG00000007305	syf2	90	73.488	ENSODEG00000014338	-	89	73.488	Octodon_degus
ENSGACG00000007305	syf2	93	90.541	ENSONIG00000008213	syf2	93	90.541	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000007305	syf2	85	82.178	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSOCUG00000013050	SYF2	88	83.721	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000007305	syf2	97	90.558	ENSORLG00000028820	syf2	96	92.857	Oryzias_latipes
ENSGACG00000007305	syf2	100	89.583	ENSORLG00020018333	syf2	95	92.411	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000007305	syf2	100	89.167	ENSORLG00015014665	syf2	93	92.793	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.285	ENSOMEG00000013911	syf2	94	90.625	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000007305	syf2	96	80.519	ENSOGAG00000009962	SYF2	88	84.186	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000007305	syf2	99	76.230	ENSOARG00000006348	-	88	82.488	Ovis_aries
ENSGACG00000007305	syf2	82	55.897	ENSOARG00000006269	-	100	55.897	Ovis_aries
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSPPAG00000036579	SYF2	88	83.256	Pan_paniscus
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSPPRG00000001638	-	87	83.721	Panthera_pardus
ENSGACG00000007305	syf2	97	78.632	ENSPPRG00000001651	-	87	83.256	Panthera_pardus
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSPTIG00000005711	-	80	82.273	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSPTIG00000007036	-	87	83.256	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSPTRG00000000352	SYF2	88	83.256	Pan_troglodytes
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSPANG00000008139	SYF2	88	82.791	Papio_anubis
ENSGACG00000007305	syf2	100	82.427	ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.311	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	82.326	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000007305	syf2	97	84.120	ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.235	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.824	ENSPEMG00000008283	Syf2	89	84.186	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000007305	syf2	93	81.532	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	81.532	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000007305	syf2	100	84.937	ENSPFOG00000004116	syf2	92	89.640	Poecilia_formosa
ENSGACG00000007305	syf2	97	86.695	ENSPLAG00000006691	syf2	95	89.189	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000007305	syf2	100	83.264	ENSPMEG00000011684	syf2	95	86.036	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000007305	syf2	90	91.163	ENSPREG00000003009	syf2	94	88.839	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSPPYG00000001713	SYF2	88	83.256	Pongo_abelii
ENSGACG00000007305	syf2	100	53.086	ENSPCOG00000027011	SYF2	85	55.963	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000007305	syf2	91	72.477	ENSPVAG00000005841	SYF2	89	72.477	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000007305	syf2	93	90.991	ENSPNYG00000004979	syf2	93	90.991	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000007305	syf2	100	83.264	ENSPNAG00000015570	syf2	93	86.937	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000007305	syf2	90	85.116	ENSRNOG00000060597	Syf2	89	85.116	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000007305	syf2	90	80.465	ENSRBIG00000042970	SYF2	88	80.465	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.791	ENSRROG00000001347	SYF2	88	82.791	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.256	ENSSBOG00000020184	SYF2	88	83.256	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000007305	syf2	93	80.631	ENSSHAG00000015630	-	89	80.631	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000007305	syf2	86	82.524	ENSSHAG00000007152	-	100	82.524	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000007305	syf2	100	82.008	ENSSFOG00015023647	syf2	93	85.973	Scleropages_formosus
ENSGACG00000007305	syf2	100	86.192	ENSSMAG00000009867	syf2	94	87.054	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.285	ENSSDUG00000013072	syf2	100	86.611	Seriola_dumerili
ENSGACG00000007305	syf2	100	88.285	ENSSLDG00000012677	syf2	100	86.611	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000007305	syf2	98	61.966	ENSSARG00000012889	SYF2	88	65.116	Sorex_araneus
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.593	ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.028	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000007305	syf2	100	89.121	ENSSPAG00000009626	syf2	94	89.732	Stegastes_partitus
ENSGACG00000007305	syf2	99	77.273	ENSSSCG00000037481	SYF2	88	83.256	Sus_scrofa
ENSGACG00000007305	syf2	62	53.642	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	54.938	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000007305	syf2	100	82.917	ENSTRUG00000001499	syf2	89	87.387	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000007305	syf2	93	86.036	ENSTNIG00000016912	syf2	99	86.036	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000007305	syf2	99	57.083	ENSTBEG00000017370	SYF2	86	60.930	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000007305	syf2	99	76.860	ENSTTRG00000003550	SYF2	88	82.791	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000007305	syf2	96	78.112	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	81.193	Ursus_americanus
ENSGACG00000007305	syf2	90	81.860	ENSUMAG00000013108	SYF2	87	81.860	Ursus_maritimus
ENSGACG00000007305	syf2	90	83.721	ENSVPAG00000005705	SYF2	88	83.721	Vicugna_pacos
ENSGACG00000007305	syf2	90	82.326	ENSVVUG00000027175	-	87	82.326	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000007305	syf2	86	81.951	ENSVVUG00000027181	-	87	81.860	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000007305	syf2	97	76.724	ENSXETG00000022797	syf2	89	79.279	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000007305	syf2	90	90.698	ENSXMAG00000022698	syf2	93	89.189	Xiphophorus_maculatus