EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000009163 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11042 bases
Position: chrgroupXI:6374574-6385615
Accession: ZDB-GENE-040426-1569
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000012188	GTP_EFTU	PF00009.27	3.8e-44	1	1
ENSGACP00000012188	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	7.8e-13	1	1
ENSGACP00000012188	EFG_IV	PF03764.18	1.1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000012212	-	3302	-	ENSGACP00000012188	971 (aa)	-	G3P3L5

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000009163's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000009163's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000009163	eftud2	86	37.341	ENSGACG00000012793	-	99	37.113
ENSGACG00000009163	eftud2	86	37.747	ENSGACG00000015308	eef2b	99	37.514
ENSGACG00000009163	eftud2	84	32.242	ENSGACG00000012495	efl1	90	32.242

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.043	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	98.043	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	91.872	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.130	ENSACIG00000009096	eftud2	100	94.130	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000009163	eftud2	88	92.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	92.118	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.940	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	97.940	Amphiprion_percula
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.837	ENSATEG00000000457	eftud2	100	97.837	Anabas_testudineus
ENSGACG00000009163	eftud2	99	88.157	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	88.568	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.844	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	91.255	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	91.770	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.146	ENSACLG00000001296	eftud2	100	98.146	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000009163	eftud2	100	93.961	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	93.961	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	91.667	Bos_taurus
ENSGACG00000009163	eftud2	99	70.764	WBGene00001166	eftu-2	99	70.455	Caenorhabditis_elegans
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	91.770	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	91.872	Canis_familiaris
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	91.872	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	91.667	Capra_hircus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	91.770	Carlito_syrichta
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	91.667	Cavia_aperea
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	91.667	Cavia_porcellus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	91.770	Cebus_capucinus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	91.770	Cercocebus_atys
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.152	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	91.461	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	91.770	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000009163	eftud2	91	80.518	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	80.518	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	91.770	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	78.542	ENSCING00000009372	-	100	78.234	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000009163	eftud2	99	78.243	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	91.770	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	91.358	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	91.358	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.734	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	97.734	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	97.116	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	93.936	ENSDARG00000012261	eftud2	100	93.936	Danio_rerio
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	91.461	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	91.667	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	74.719	FBgn0039566	CG4849	100	74.256	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000009163	eftud2	92	97.826	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.826	Echinops_telfairi
ENSGACG00000009163	eftud2	74	93.532	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	91.872	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	91.770	Equus_caballus
ENSGACG00000009163	eftud2	83	99.153	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	99.153	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.027	ENSELUG00000017169	eftud2	100	93.615	Esox_lucius
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	91.770	Felis_catus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	91.564	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	91.667	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.013	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	97.013	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	95.469	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	96.296	Gadus_morhua
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.152	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	93.261	Gallus_gallus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.013	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	97.013	Gambusia_affinis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	91.770	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.043	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	98.043	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	91.461	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	91.461	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000009163	eftud2	100	95.782	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	95.062	Hippocampus_comes
ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.439	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	94.439	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000009163	eftud2	91	92.680	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.492	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000009163	eftud2	95	93.370	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	93.370	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	96.910	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	96.910	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000009163	eftud2	95	97.300	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.588	Labrus_bergylta
ENSGACG00000009163	eftud2	100	92.894	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.336	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	94.027	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	Loxodonta_africana
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	91.770	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	91.770	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	91.770	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.631	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	97.631	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.146	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	98.146	Maylandia_zebra
ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.965	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	91.376	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	91.461	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	91.770	Microcebus_murinus
ENSGACG00000009163	eftud2	92	75.056	ENSMOCG00000017653	-	90	75.169	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSMOCG00000009039	-	100	91.461	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000009163	eftud2	88	98.118	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	98.118	Mola_mola
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	91.770	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000009163	eftud2	88	96.588	ENSMALG00000014501	eftud2	100	96.588	Monopterus_albus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	91.358	Mus_caroli
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.658	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	91.658	Mus_musculus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	91.358	Mus_pahari
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	91.358	Mus_spretus
ENSGACG00000009163	eftud2	97	90.996	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	91.419	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	91.872	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	91.564	Nannospalax_galili
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.043	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	98.043	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000009163	eftud2	97	89.479	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	89.692	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000009163	eftud2	100	87.860	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	88.066	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	83.539	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	83.951	Ochotona_princeps
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSODEG00000018041	-	100	91.152	Octodon_degus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	63.126	ENSODEG00000003385	-	100	63.023	Octodon_degus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.146	ENSONIG00000000912	eftud2	100	98.146	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	91.667	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	ENSORLG00000003109	eftud2	100	97.116	Oryzias_latipes
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.013	ENSORLG00020009865	eftud2	100	97.013	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000009163	eftud2	100	96.910	ENSORLG00015002611	eftud2	100	97.712	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.021	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	90.226	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	91.667	Ovis_aries
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	91.770	Pan_paniscus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	91.872	Panthera_pardus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	91.872	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	91.770	Pan_troglodytes
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	91.770	Papio_anubis
ENSGACG00000009163	eftud2	93	89.416	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	89.857	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	88.877	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	88.568	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.255	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	91.358	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	91.770	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	97.116	Poecilia_formosa
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	97.116	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.116	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	97.116	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.329	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	90.535	Pongo_abelii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	87.757	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	87.963	Procavia_capensis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.667	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	91.872	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000009163	eftud2	100	87.243	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	87.654	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.043	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	98.043	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.542	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	94.542	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.761	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	91.761	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	91.667	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	91.667	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000009163	eftud2	97	33.764	YKL173W	SNU114	91	34.325	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.564	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	91.770	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000009163	eftud2	95	93.370	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	93.370	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000009163	eftud2	100	94.439	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	93.821	Scleropages_formosus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.528	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	97.528	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.146	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	98.146	Seriola_dumerili
ENSGACG00000009163	eftud2	100	98.249	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	98.249	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	83.539	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	83.745	Sorex_araneus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.152	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.358	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.940	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	97.940	Stegastes_partitus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.667	Sus_scrofa
ENSGACG00000009163	eftud2	83	92.164	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.164	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000009163	eftud2	100	96.395	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	96.395	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.692	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	91.692	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000009163	eftud2	100	86.214	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	86.420	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000009163	eftud2	91	89.444	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	89.444	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	90.329	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	90.741	Ursus_americanus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	91.872	Ursus_maritimus
ENSGACG00000009163	eftud2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	91.872	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000009163	eftud2	96	91.791	ENSXETG00000003394	eftud2	98	92.818	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000009163	eftud2	81	97.321	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	97.321	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000009163	eftud2	100	97.013	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	97.013	Xiphophorus_maculatus