EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000009399 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9313 bases
Position: chrgroupXIII:9284993-9294305
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000012404	MMR_HSR1	PF01926.23	5.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000012419	-	1712	-	ENSGACP00000012395	291 (aa)	-	G3P472
ENSGACT00000012428	-	806	-	ENSGACP00000012404	258 (aa)	-	G3P481

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	64	74.231

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	60	95.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	62	74.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	63	74.231	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.615	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	58	74.615	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	58	95.349	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.961	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	58	94.961	Amphiprion_percula
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.615	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	58	74.615	Amphiprion_percula
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	58	74.231	Anabas_testudineus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Anabas_testudineus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	99	72.374	ENSACAG00000028632	-	57	72.374	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.664	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	58	73.664	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	88.803	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	58	88.803	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.485	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	60	73.485	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	95	72.065	ENSCING00000020807	-	65	72.065	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	95	69.636	ENSCSAVG00000009987	-	55	69.636	Ciona_savignyi
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.462	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	60	73.462	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.961	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	52	94.961	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.846	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	62	73.846	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	58	95.349	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	92.664	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	59	92.664	Danio_rerio
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.615	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	72.959	Danio_rerio
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	91	68.220	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	64	68.220	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	99	89.844	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	70	84.436	Esox_lucius
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.946	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	58	73.946	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.736	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	58	95.736	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	87	73.568	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	56	73.568	Gadus_morhua
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.462	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	58	73.462	Gambusia_affinis
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	51	94.574	Gambusia_affinis
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.046	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	58	74.046	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.077	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	58	73.077	Hippocampus_comes
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	94.094	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	57	94.094	Hippocampus_comes
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	90.734	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	58	90.734	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	92	71.730	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	53	71.730	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.846	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	64	73.846	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.077	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	58	73.077	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.186	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	58	94.186	Labrus_bergylta
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	81.961	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	56	81.961	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	75.294	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	57	75.294	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	76.062	ENSLACG00000004899	-	58	76.062	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	87.549	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	57	87.549	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	58	93.798	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.462	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	63	73.462	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Maylandia_zebra
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.664	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	58	73.664	Maylandia_zebra
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	70.498	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	57	70.498	Mola_mola
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	91.860	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	59	91.860	Monopterus_albus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	58	74.231	Monopterus_albus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.615	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	59	74.615	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.574	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	58	94.574	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.046	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	58	74.046	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.961	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	58	94.961	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	58	74.231	Oryzias_latipes
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	87.597	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	56	87.597	Oryzias_latipes
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.846	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	58	73.846	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.023	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	58	93.023	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.186	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	58	94.186	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	74.231	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	59	74.231	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	93.798	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	59	93.798	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	75.385	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	60	75.385	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	72.201	ENSPKIG00000023918	-	57	72.201	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	86.873	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	58	86.873	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	99	74.419	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	62	72.453	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	73.664	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	58	73.664	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	91.473	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	58	91.473	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.595	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	57	94.595	Poecilia_formosa
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