EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000012443 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ago1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: argonaute RISC catalytic component 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7065 bases
Position: chrgroupXX:13677919-13684983
Accession: ZDB-GENE-110606-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000016454	PAZ	PF02170.22	5.7e-29	1	1
ENSGACP00000016454	Piwi	PF02171.17	2.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000016486	-	2256	-	ENSGACP00000016454	751 (aa)	-	G3PFT0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000012443	ago1	99	85.302	ENSGACG00000012453	ago3a	95	85.302
ENSGACG00000012443	ago1	100	83.910	ENSGACG00000006796	ago2	87	83.910
ENSGACG00000012443	ago1	100	84.273	ENSGACG00000002683	ago4	88	84.273
ENSGACG00000012443	ago1	99	84.868	ENSGACG00000002455	AGO3	91	84.868

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSG00000092847	AGO1	96	97.204	Homo_sapiens
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSAPOG00000024299	ago1	96	98.849	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSAMEG00000000504	AGO1	87	97.204	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000012443	ago1	94	92.766	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.766	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSAOCG00000017727	ago1	87	99.334	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSAPEG00000004458	ago1	88	99.334	Amphiprion_percula
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSATEG00000008523	ago1	87	99.334	Anabas_testudineus
ENSGACG00000012443	ago1	100	90.199	ENSAPLG00000010440	AGO1	86	90.199	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	ENSACAG00000029174	AGO1	96	97.071	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSANAG00000037711	AGO1	87	97.204	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSACLG00000000890	ago1	95	94.133	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000012443	ago1	92	99.419	ENSAMXG00000001917	ago1	98	99.419	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSBTAG00000012253	AGO1	87	97.204	Bos_taurus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCJAG00000032023	AGO1	87	97.204	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCAFG00000003443	AGO1	87	97.204	Canis_familiaris
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCAFG00020009251	AGO1	90	96.937	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000012443	ago1	100	96.804	ENSCHIG00000011848	-	88	95.899	Capra_hircus
ENSGACG00000012443	ago1	100	76.165	ENSTSYG00000032426	-	99	77.809	Carlito_syrichta
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSTSYG00000009767	-	88	97.204	Carlito_syrichta
ENSGACG00000012443	ago1	81	98.361	ENSCAPG00000010228	AGO1	84	97.581	Cavia_aperea
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCPOG00000011568	AGO1	87	97.204	Cavia_porcellus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCCAG00000011823	AGO1	87	97.204	Cebus_capucinus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCATG00000031521	AGO1	96	97.204	Cercocebus_atys
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCLAG00000011507	AGO1	88	97.204	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCSAG00000001091	AGO1	87	97.204	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000012443	ago1	84	91.473	ENSCHOG00000011591	AGO1	74	91.473	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	ENSCPBG00000018594	AGO1	87	97.071	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCANG00000039798	AGO1	87	97.204	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCGRG00001022708	Ago1	87	97.204	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSCGRG00000010386	Ago1	88	97.204	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.258	ENSCSEG00000001051	ago1	88	97.258	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSCVAG00000018173	ago1	87	99.334	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSDARG00000092644	ago1	87	99.201	Danio_rerio
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSDNOG00000008077	AGO1	96	97.204	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000012443	ago1	92	96.335	ENSDORG00000008494	Ago1	88	96.335	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000012443	ago1	82	89.756	ENSETEG00000007626	AGO1	85	89.756	Echinops_telfairi
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSEASG00005012086	AGO1	87	97.204	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSECAG00000024353	AGO1	87	97.204	Equus_caballus
ENSGACG00000012443	ago1	100	88.415	ENSEEUG00000005349	AGO1	87	88.415	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.068	ENSELUG00000016803	ago1	96	99.068	Esox_lucius
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSFCAG00000000746	AGO1	87	97.204	Felis_catus
ENSGACG00000012443	ago1	100	91.501	ENSFALG00000000790	AGO1	96	91.501	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSFDAG00000017210	AGO1	87	97.204	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.467	ENSFHEG00000017927	ago1	90	99.467	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000012443	ago1	100	86.551	ENSGMOG00000019413	ago1	100	86.551	Gadus_morhua
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	ENSGALG00000002249	AGO1	87	97.071	Gallus_gallus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSGAFG00000009775	ago1	87	99.334	Gambusia_affinis
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	ENSGAGG00000012893	-	96	97.071	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSGGOG00000003316	AGO1	87	97.204	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSHBUG00000010459	ago1	95	94.133	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSHGLG00000011540	AGO1	87	97.204	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSHGLG00100005568	AGO1	87	97.204	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSHCOG00000005708	ago1	88	99.334	Hippocampus_comes
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.068	ENSIPUG00000023216	ago1	96	94.814	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSSTOG00000010857	AGO1	87	97.204	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSJJAG00000019449	Ago1	87	97.204	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSKMAG00000019464	ago1	87	99.334	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSLBEG00000007694	ago1	97	94.783	Labrus_bergylta
ENSGACG00000012443	ago1	100	91.345	ENSLACG00000017009	AGO1	88	91.345	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000012443	ago1	100	94.541	ENSLOCG00000000504	AGO1	87	94.541	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSLAFG00000010835	AGO1	88	97.204	Loxodonta_africana
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSMFAG00000002846	AGO1	87	97.204	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000012443	ago1	100	92.011	ENSMMUG00000006251	AGO1	89	91.425	Macaca_mulatta
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSMNEG00000028881	AGO1	96	97.204	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSMLEG00000038388	AGO1	87	97.204	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSMAMG00000008381	ago1	99	96.237	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSMZEG00005007996	ago1	95	94.133	Maylandia_zebra
ENSGACG00000012443	ago1	100	91.029	ENSMGAG00000003822	AGO1	88	91.029	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSMAUG00000015189	Ago1	87	97.204	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSMICG00000016147	AGO1	87	97.204	Microcebus_murinus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	ENSMOCG00000000537	Ago1	87	97.071	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000012443	ago1	90	99.257	ENSMMOG00000018459	ago1	93	99.257	Mola_mola
ENSGACG00000012443	ago1	100	96.937	ENSMODG00000023335	AGO1	87	96.937	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSMALG00000011057	ago1	89	99.197	Monopterus_albus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	97.482	Mus_caroli
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	97.482	Mus_musculus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	97.482	Mus_pahari
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	97.482	Mus_spretus
ENSGACG00000012443	ago1	96	97.503	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	97.503	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000012443	ago1	56	96.437	ENSMLUG00000009628	AGO1	80	96.437	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSNGAG00000017448	Ago1	88	97.204	Nannospalax_galili
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSNBRG00000010867	ago1	96	99.201	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSNLEG00000011181	AGO1	87	97.204	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000012443	ago1	91	91.429	ENSMEUG00000013429	AGO1	87	91.429	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000012443	ago1	83	98.299	ENSOPRG00000012325	AGO1	73	98.299	Ochotona_princeps
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSODEG00000005321	AGO1	87	97.204	Octodon_degus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.201	ENSONIG00000016345	ago1	88	99.201	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000012443	ago1	100	88.196	ENSOANG00000002080	AGO1	87	88.196	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.071	ENSOCUG00000023116	AGO1	87	97.071	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSORLG00000014965	ago1	87	99.334	Oryzias_latipes
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSORLG00020018253	ago1	87	99.334	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSORLG00015003287	ago1	87	99.334	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSOMEG00000020528	ago1	87	99.334	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSOGAG00000010279	AGO1	87	97.204	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSOARG00000019591	AGO1	87	97.204	Ovis_aries
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPPAG00000034838	AGO1	87	97.204	Pan_paniscus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPPRG00000006475	AGO1	87	97.204	Panthera_pardus
ENSGACG00000012443	ago1	100	96.937	ENSPTIG00000020991	AGO1	87	96.937	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPTRG00000000528	AGO1	87	97.204	Pan_troglodytes
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPANG00000009060	AGO1	87	97.204	Papio_anubis
ENSGACG00000012443	ago1	100	96.149	ENSPSIG00000017482	AGO1	89	96.149	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000012443	ago1	92	98.403	ENSPMGG00000024099	ago1	98	98.403	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPEMG00000023313	Ago1	87	97.204	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000012443	ago1	100	96.937	ENSPCIG00000000172	AGO1	87	96.937	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSPFOG00000005867	ago1	87	99.334	Poecilia_formosa
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.991	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.991	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000012443	ago1	100	99.334	ENSPREG00000006534	ago1	87	99.334	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPPYG00000001551	AGO1	87	97.204	Pongo_abelii
ENSGACG00000012443	ago1	55	98.868	ENSPCAG00000005604	AGO1	55	98.868	Procavia_capensis
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPCOG00000022061	AGO1	96	97.204	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	ENSPVAG00000005082	AGO1	87	97.204	Pteropus_vampyrus
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