EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000012619 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9778 bases
Position: chrgroupXV:13188955-13198732
Accession: ZDB-GENE-111117-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000016692	NRDE-2	PF08424.10	5.5e-98	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000016726	-	3534	-	ENSGACP00000016692	1178 (aa)	-	G3PGG8
ENSGACT00000016728	-	785	-	ENSGACP00000016694	210 (aa)	-	G3PGH0

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000012619's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000012619's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.475	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.667	Homo_sapiens
ENSGACG00000012619	nrde2	100	74.606	ENSAPOG00000009202	nrde2	99	74.917	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.683	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	46.583	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000012619	nrde2	97	72.435	ENSACIG00000014783	nrde2	100	72.420	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	76.147	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	76.123	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000012619	nrde2	100	75.396	ENSAPEG00000001711	nrde2	99	75.374	Amphiprion_percula
ENSGACG00000012619	nrde2	100	75.415	ENSATEG00000010247	nrde2	99	75.394	Anabas_testudineus
ENSGACG00000012619	nrde2	98	46.740	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	46.791	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000012619	nrde2	99	44.417	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	44.581	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.485	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	45.778	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.538	ENSACLG00000025154	nrde2	100	72.917	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000012619	nrde2	85	73.810	ENSAMXG00000034642	nrde2	93	48.426	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.399	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	48.336	Bos_taurus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.527	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	48.173	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	44.722	ENSCAFG00000017515	NRDE2	100	45.289	Canis_familiaris
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.862	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	46.937	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.267	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	47.591	Capra_hircus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.276	ENSTSYG00000000161	NRDE2	100	47.667	Carlito_syrichta
ENSGACG00000012619	nrde2	97	47.094	ENSCAPG00000012039	NRDE2	100	47.587	Cavia_aperea
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.306	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	47.790	Cavia_porcellus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.990	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	47.508	Cebus_capucinus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.683	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	47.421	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.896	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	48.167	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000012619	nrde2	74	47.599	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	47.978	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.795	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	45.944	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.811	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	48.083	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.488	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	47.351	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.683	ENSCGRG00000005062	Nrde2	100	46.932	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000012619	nrde2	97	66.985	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	66.752	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000012619	nrde2	100	69.199	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	69.115	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	55.138	ENSDARG00000074726	nrde2	100	54.728	Danio_rerio
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.633	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	47.185	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000012619	nrde2	79	48.459	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	49.579	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000012619	nrde2	60	45.751	ENSETEG00000000198	NRDE2	60	46.379	Echinops_telfairi
ENSGACG00000012619	nrde2	99	39.152	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	39.626	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000012619	nrde2	99	48.401	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	49.083	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	48.111	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	48.917	Equus_caballus
ENSGACG00000012619	nrde2	66	60.150	ENSEEUG00000004026	-	69	60.150	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	58.828	ENSELUG00000005973	nrde2	100	58.794	Esox_lucius
ENSGACG00000012619	nrde2	100	47.671	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	47.920	Felis_catus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.160	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	46.230	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.633	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	47.500	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000012619	nrde2	100	71.429	ENSFHEG00000021385	nrde2	99	71.512	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000012619	nrde2	65	71.273	ENSGMOG00000015815	nrde2	100	65.871	Gadus_morhua
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.750	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	46.956	Gallus_gallus
ENSGACG00000012619	nrde2	94	71.712	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	73.139	Gambusia_affinis
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.774	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	45.968	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.306	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	47.667	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.538	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	73.083	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.667	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	47.118	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000012619	nrde2	97	46.867	ENSHGLG00100017736	NRDE2	99	47.194	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000012619	nrde2	91	66.636	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	66.333	Hippocampus_comes
ENSGACG00000012619	nrde2	100	49.583	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	49.415	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.621	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	46.782	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.784	ENSJJAG00000000907	Nrde2	100	47.142	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.328	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	72.149	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000012619	nrde2	94	75.177	ENSLBEG00000021428	nrde2	100	75.353	Labrus_bergylta
ENSGACG00000012619	nrde2	71	50.588	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.824	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000012619	nrde2	100	55.305	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	55.259	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000012619	nrde2	98	46.690	ENSLAFG00000004966	NRDE2	99	46.843	Loxodonta_africana
ENSGACG00000012619	nrde2	79	50.321	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	67.157	Macaca_mulatta
ENSGACG00000012619	nrde2	100	75.330	ENSMAMG00000013452	nrde2	99	75.495	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.705	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	73.000	Maylandia_zebra
ENSGACG00000012619	nrde2	86	47.652	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	47.745	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.812	ENSMAUG00000018578	Nrde2	100	47.924	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.603	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	47.891	Microcebus_murinus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.212	ENSMOCG00000014472	Nrde2	100	45.710	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000012619	nrde2	74	69.360	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	69.697	Mola_mola
ENSGACG00000012619	nrde2	94	45.134	ENSMODG00000002711	NRDE2	100	45.267	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000012619	nrde2	91	73.013	ENSMALG00000021869	nrde2	98	74.002	Monopterus_albus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.786	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	100	48.470	Mus_caroli
ENSGACG00000012619	nrde2	99	48.167	ENSMUSG00000021179	Nrde2	100	48.680	Mus_musculus
ENSGACG00000012619	nrde2	87	49.807	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	100	48.384	Mus_pahari
ENSGACG00000012619	nrde2	99	48.030	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	90	61.988	Mus_spretus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.599	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	47.049	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.141	ENSMLUG00000007484	NRDE2	100	47.264	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.141	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	46.844	Nannospalax_galili
ENSGACG00000012619	nrde2	92	73.588	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	74.085	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.750	ENSNLEG00000017032	NRDE2	100	47.196	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000012619	nrde2	74	48.400	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.400	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000012619	nrde2	59	62.222	ENSOPRG00000001375	-	60	64.356	Ochotona_princeps
ENSGACG00000012619	nrde2	97	46.062	ENSODEG00000012422	NRDE2	100	46.441	Octodon_degus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.333	ENSONIG00000019512	nrde2	100	72.296	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.852	ENSOCUG00000010083	NRDE2	99	48.164	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000012619	nrde2	91	68.216	ENSORLG00000017730	nrde2	99	67.405	Oryzias_latipes
ENSGACG00000012619	nrde2	100	67.352	ENSORLG00020015965	nrde2	100	67.599	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000012619	nrde2	100	68.174	ENSORLG00015012437	nrde2	100	68.092	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000012619	nrde2	100	69.702	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	69.959	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.039	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	47.761	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000012619	nrde2	97	45.626	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	45.883	Ovis_aries
ENSGACG00000012619	nrde2	97	47.545	ENSPPAG00000034133	NRDE2	98	50.529	Pan_paniscus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	47.342	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	48.003	Panthera_pardus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	47.259	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	47.920	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.475	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	47.750	Pan_troglodytes
ENSGACG00000012619	nrde2	100	49.668	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	49.834	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.179	ENSPSIG00000005588	NRDE2	100	46.160	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000012619	nrde2	97	64.706	ENSPMGG00000024089	nrde2	100	64.706	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.672	ENSPEMG00000023707	Nrde2	100	48.350	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000012619	nrde2	53	43.284	ENSPMAG00000003270	-	99	45.210	Petromyzon_marinus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	45.988	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.775	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	70.257	ENSPFOG00000013217	nrde2	99	70.257	Poecilia_formosa
ENSGACG00000012619	nrde2	100	71.888	ENSPLAG00000022350	nrde2	99	71.888	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000012619	nrde2	100	71.888	ENSPMEG00000000778	nrde2	99	72.066	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.374	ENSPREG00000009066	nrde2	99	72.291	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000012619	nrde2	84	48.352	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	48.667	Pongo_abelii
ENSGACG00000012619	nrde2	71	69.231	ENSPCAG00000016399	NRDE2	72	69.231	Procavia_capensis
ENSGACG00000012619	nrde2	94	46.140	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	46.737	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000012619	nrde2	97	45.376	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	45.290	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000012619	nrde2	98	72.851	ENSPNYG00000022833	nrde2	98	75.026	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000012619	nrde2	91	55.403	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	55.576	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000012619	nrde2	90	46.514	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	47.339	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.152	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	47.833	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.932	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	47.025	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000012619	nrde2	100	51.667	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.917	Scleropages_formosus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	73.602	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	73.689	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	76.708	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	76.500	Seriola_dumerili
ENSGACG00000012619	nrde2	94	74.956	ENSSLDG00000023798	nrde2	100	75.067	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000012619	nrde2	92	46.550	ENSSPUG00000006348	NRDE2	99	46.642	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000012619	nrde2	94	75.404	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	75.763	Stegastes_partitus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.859	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	47.898	Sus_scrofa
ENSGACG00000012619	nrde2	98	46.846	ENSTGUG00000012462	-	99	47.199	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000012619	nrde2	78	69.256	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	69.471	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000012619	nrde2	85	52.125	ENSTBEG00000011834	NRDE2	85	51.974	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000012619	nrde2	99	47.029	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	47.355	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000012619	nrde2	89	47.570	ENSUAMG00000004159	NRDE2	95	48.390	Ursus_americanus
ENSGACG00000012619	nrde2	89	46.798	ENSUMAG00000006393	NRDE2	97	46.250	Ursus_maritimus
ENSGACG00000012619	nrde2	99	46.192	ENSVVUG00000018202	NRDE2	100	46.903	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000012619	nrde2	99	42.523	ENSXETG00000015708	nrde2	100	43.059	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000012619	nrde2	94	69.390	ENSXCOG00000013298	nrde2	99	70.018	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000012619	nrde2	100	72.231	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	72.231	Xiphophorus_maculatus