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Description

Ensembl ID: ENSGACG00000014562 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17491 bases
Position: chrgroupVIII:19137824-19155314
Accession: ZDB-GENE-070706-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000019216	Xpo1	PF08389.12	2.5e-20	1	1
ENSGACP00000019216	IBN_N	PF03810.19	7.8e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000019254	-	2898	-	ENSGACP00000019216	965 (aa)	-	G3PNN3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000014562	ipo13	99	67.113	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	67.218

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSG00000117408	IPO13	99	80.105	Homo_sapiens
ENSGACG00000014562	ipo13	98	68.789	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	68.724	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	95.426	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	95.426	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.084	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000014562	ipo13	95	90.662	ENSACIG00000008146	ipo13	100	90.456	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000014562	ipo13	97	68.632	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	68.632	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	95.114	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	95.114	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000014562	ipo13	98	67.364	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	98	67.259	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000014562	ipo13	99	95.218	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	95.218	Amphiprion_percula
ENSGACG00000014562	ipo13	98	67.469	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	98	67.364	Amphiprion_percula
ENSGACG00000014562	ipo13	97	66.596	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	66.596	Anabas_testudineus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.595	ENSATEG00000018367	ipo13	100	94.595	Anabas_testudineus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	79.439	ENSAPLG00000001349	IPO13	99	79.501	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.611	ENSACAG00000014300	IPO13	99	80.611	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSANAG00000034183	IPO13	99	80.105	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000014562	ipo13	96	95.558	ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.558	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000014562	ipo13	99	67.971	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	67.868	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000014562	ipo13	98	63.828	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	63.828	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	89.200	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	89.200	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.241	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	79.162	Bos_taurus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.295	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	80.209	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.084	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	80.000	Canis_familiaris
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.084	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	80.000	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.347	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	79.267	Capra_hircus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	80.105	Carlito_syrichta
ENSGACG00000014562	ipo13	86	78.947	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	78.947	Cavia_aperea
ENSGACG00000014562	ipo13	97	79.766	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	79.683	Cavia_porcellus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.295	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	80.105	Cebus_capucinus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSCATG00000041276	IPO13	99	80.105	Cercocebus_atys
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.874	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	79.791	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	80.105	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000014562	ipo13	95	80.828	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	80.828	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000014562	ipo13	98	37.669	ENSCING00000001863	-	100	37.578	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000014562	ipo13	97	36.430	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.326	Ciona_savignyi
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSCANG00000009091	IPO13	99	80.105	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.031	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	78.953	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.031	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	78.953	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000014562	ipo13	99	61.929	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	61.929	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000014562	ipo13	100	91.511	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	91.684	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.699	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	94.699	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000014562	ipo13	96	64.787	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	100	64.619	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	64.842	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	63.779	Danio_rerio
ENSGACG00000014562	ipo13	98	89.263	ENSDARG00000060618	ipo13	99	89.263	Danio_rerio
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	79.895	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.084	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	80.000	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000014562	ipo13	98	66.840	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.451	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.084	ENSEASG00005001738	IPO13	99	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.084	ENSECAG00000015508	IPO13	99	80.000	Equus_caballus
ENSGACG00000014562	ipo13	67	84.656	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	84.656	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	91.580	ENSELUG00000001498	ipo13	100	91.580	Esox_lucius
ENSGACG00000014562	ipo13	99	65.041	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	65.041	Esox_lucius
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	79.895	Felis_catus
ENSGACG00000014562	ipo13	95	80.543	ENSFALG00000005368	IPO13	100	80.610	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.768	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	79.583	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000014562	ipo13	99	66.047	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	66.047	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.595	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	94.595	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	58.951	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	59.110	Gadus_morhua
ENSGACG00000014562	ipo13	99	93.361	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	93.361	Gadus_morhua
ENSGACG00000014562	ipo13	99	80.187	ENSGALG00000010087	IPO13	100	80.249	Gallus_gallus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	95.218	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.218	Gambusia_affinis
ENSGACG00000014562	ipo13	99	65.841	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	65.841	Gambusia_affinis
ENSGACG00000014562	ipo13	97	80.745	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	80.745	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	80.105	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000014562	ipo13	99	67.044	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	66.941	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.906	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	94.906	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.768	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	79.686	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.768	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	79.686	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000014562	ipo13	99	90.644	ENSHCOG00000018408	ipo13	100	90.644	Hippocampus_comes
ENSGACG00000014562	ipo13	97	62.553	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	62.553	Hippocampus_comes
ENSGACG00000014562	ipo13	99	59.186	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	99	59.186	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	87.838	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	87.838	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	79.895	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	79.895	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.130	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	94.130	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	67.183	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	67.183	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000014562	ipo13	100	93.478	ENSLBEG00000007442	ipo13	99	93.478	Labrus_bergylta
ENSGACG00000014562	ipo13	99	65.806	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	65.979	Labrus_bergylta
ENSGACG00000014562	ipo13	82	31.613	ENSLACG00000002351	TNPO3	99	31.613	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000014562	ipo13	97	75.767	ENSLACG00000016657	IPO13	98	75.767	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000014562	ipo13	99	83.854	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	83.854	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	78.361	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	78.288	Loxodonta_africana
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	80.105	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	80.105	Macaca_mulatta
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	80.105	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000014562	ipo13	98	80.190	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	80.105	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.491	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	94.491	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	67.958	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	67.958	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000014562	ipo13	99	67.868	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	67.765	Maylandia_zebra
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.906	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	94.906	Maylandia_zebra
ENSGACG00000014562	ipo13	97	79.193	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	79.255	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000014562	ipo13	81	80.995	ENSMAUG00000013018	Ipo13	98	80.886	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000014562	ipo13	92	82.682	ENSMICG00000011003	IPO13	99	73.613	Microcebus_murinus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.241	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	79.162	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000014562	ipo13	99	64.767	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	65.413	Mola_mola
ENSGACG00000014562	ipo13	97	92.226	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	92.226	Mola_mola
ENSGACG00000014562	ipo13	95	79.521	ENSMODG00000003017	IPO13	100	79.521	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000014562	ipo13	95	93.167	ENSMALG00000010805	ipo13	100	93.167	Monopterus_albus
ENSGACG00000014562	ipo13	81	66.751	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	66.751	Monopterus_albus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	99	79.895	Mus_caroli
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.874	ENSMUSG00000033365	Ipo13	99	79.791	Mus_musculus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	82.421	MGP_PahariEiJ_G0028698	Ipo13	99	82.421	Mus_pahari
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.874	MGP_SPRETEiJ_G0027339	Ipo13	99	79.791	Mus_spretus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	74.430	ENSMPUG00000013635	IPO13	99	74.314	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	ENSMLUG00000006360	IPO13	99	79.791	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.895	ENSNGAG00000013019	Ipo13	99	79.791	Nannospalax_galili
ENSGACG00000014562	ipo13	99	54.733	ENSNBRG00000006781	si:ch73-182a11.2	99	54.630	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000014562	ipo13	99	94.906	ENSNBRG00000023538	ipo13	100	94.906	Neolamprologus_brichardi
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ENSGACG00000014562	ipo13	90	79.167	ENSMEUG00000002835	IPO13	93	79.167	Notamacropus_eugenii
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