EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000015633 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1 (Drosophila)
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8461 bases
Position: chrgroupXIV:459429-467889
Accession: ZDB-GENE-080522-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000020617	ResIII	PF04851.15	1.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000020656	-	3933	-	ENSGACP00000020617	1311 (aa)	-	G3PSN1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000015633	sbno1	77	60.408	ENSGACG00000013190	si:ch73-63e15.2	78	63.946

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.642	ENSG00000139697	SBNO1	94	78.947	Homo_sapiens
ENSGACG00000015633	sbno1	87	92.254	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	92.428	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.767	ENSAMEG00000015151	SBNO1	94	78.995	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.285	ENSACIG00000008088	sbno1	96	87.509	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.375	ENSAOCG00000014859	sbno1	93	89.827	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.299	ENSAPEG00000006069	sbno1	93	89.751	Amphiprion_percula
ENSGACG00000015633	sbno1	99	90.240	ENSATEG00000006667	sbno1	94	90.240	Anabas_testudineus
ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.809	ENSAPLG00000015674	SBNO1	94	78.995	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000015633	sbno1	98	77.186	ENSACAG00000015441	SBNO1	85	77.494	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.249	ENSANAG00000029958	-	96	83.848	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.020	ENSACLG00000024913	sbno1	97	86.927	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000015633	sbno1	99	83.308	ENSAMXG00000019473	sbno1	95	83.308	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.947	ENSBTAG00000020505	SBNO1	97	78.983	Bos_taurus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.566	ENSCJAG00000016599	SBNO1	94	78.871	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.827	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	84.921	Canis_familiaris
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.032	ENSCAFG00020015363	SBNO1	96	82.117	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	ENSCHIG00000008382	SBNO1	96	84.489	Capra_hircus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.871	ENSTSYG00000012749	SBNO1	96	79.027	Carlito_syrichta
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.672	ENSCAPG00000000384	SBNO1	98	84.672	Cavia_aperea
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.672	ENSCPOG00000008109	SBNO1	96	84.672	Cavia_porcellus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	73.913	ENSCCAG00000035316	SBNO1	96	75.977	Cebus_capucinus
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.058	ENSCATG00000008239	SBNO1	97	84.058	Cercocebus_atys
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.672	ENSCLAG00000008995	SBNO1	96	84.672	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000015633	sbno1	88	82.266	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	82.526	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	72.366	ENSCHOG00000008814	SBNO1	94	72.290	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.268	ENSCPBG00000025968	SBNO1	95	78.241	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000015633	sbno1	99	74.943	ENSCANG00000042688	-	94	74.638	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.490	ENSCGRG00001017470	Sbno1	96	83.394	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.490	ENSCGRG00000004756	Sbno1	96	83.394	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.195	ENSCSEG00000011919	sbno1	95	88.271	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.838	ENSCVAG00000007038	sbno1	94	87.913	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	84.043	ENSDARG00000099080	sbno1	94	84.043	Danio_rerio
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.269	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	78.298	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	72.366	ENSDORG00000015261	Sbno1	93	72.498	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000015633	sbno1	92	71.565	ENSETEG00000005620	SBNO1	87	71.565	Echinops_telfairi
ENSGACG00000015633	sbno1	74	64.307	ENSEBUG00000013823	sbno1	88	63.591	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	ENSECAG00000006127	SBNO1	96	79.252	Equus_caballus
ENSGACG00000015633	sbno1	81	80.226	ENSEEUG00000003793	SBNO1	77	80.226	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	82.485	ENSELUG00000002886	sbno1	95	82.759	Esox_lucius
ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	ENSFCAG00000015331	SBNO1	94	79.252	Felis_catus
ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.886	ENSFALG00000009273	SBNO1	94	79.224	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.032	ENSFDAG00000014232	SBNO1	96	80.177	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.027	ENSFHEG00000007360	sbno1	97	85.736	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	85.671	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.823	Gadus_morhua
ENSGACG00000015633	sbno1	88	78.929	ENSGALG00000003392	SBNO1	93	78.929	Gallus_gallus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.805	ENSGAFG00000003960	sbno1	96	88.636	Gambusia_affinis
ENSGACG00000015633	sbno1	98	77.649	ENSGAGG00000001065	SBNO1	96	83.244	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	ENSGGOG00000015000	SBNO1	96	84.489	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000015633	sbno1	99	80.460	ENSHBUG00000011910	sbno1	96	80.350	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.799	ENSHGLG00000014165	-	96	84.268	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000015633	sbno1	91	91.321	ENSHCOG00000003246	sbno1	92	91.321	Hippocampus_comes
ENSGACG00000015633	sbno1	99	82.576	ENSIPUG00000015830	Sbno1	93	83.409	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	ENSSTOG00000023221	SBNO1	96	84.489	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.947	ENSJJAG00000001741	Sbno1	96	80.874	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.489	ENSKMAG00000009696	sbno1	97	88.520	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.839	ENSLBEG00000007623	sbno1	94	88.839	Labrus_bergylta
ENSGACG00000015633	sbno1	100	74.359	ENSLACG00000017227	SBNO1	93	77.444	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000015633	sbno1	99	83.905	ENSLOCG00000005725	sbno1	91	83.841	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.642	ENSLAFG00000002135	SBNO1	94	78.871	Loxodonta_africana
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.642	ENSMFAG00000031429	SBNO1	96	81.047	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.642	ENSMMUG00000011496	SBNO1	96	81.047	Macaca_mulatta
ENSGACG00000015633	sbno1	95	84.489	ENSMLEG00000033260	SBNO1	96	84.489	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.632	ENSMAMG00000005473	sbno1	94	89.331	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.964	ENSMGAG00000003274	SBNO1	94	79.224	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000015633	sbno1	99	77.574	ENSMICG00000006573	-	96	80.944	Microcebus_murinus
ENSGACG00000015633	sbno1	94	83.759	ENSMOCG00000009390	Sbno1	96	83.759	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000015633	sbno1	99	84.247	ENSMMOG00000008691	sbno1	95	84.784	Mola_mola
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.225	ENSMODG00000012470	SBNO1	93	78.712	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.606	ENSMALG00000001056	sbno1	97	86.752	Monopterus_albus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.843	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.351	Mus_caroli
ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.351	Mus_musculus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.947	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.351	Mus_pahari
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.871	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.351	Mus_spretus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	ENSMPUG00000001658	SBNO1	94	79.252	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.642	ENSMLUG00000017159	SBNO1	94	78.566	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.947	ENSNGAG00000012620	Sbno1	94	85.039	Nannospalax_galili
ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.326	ENSNBRG00000019189	sbno1	97	88.226	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000015633	sbno1	99	75.532	ENSNLEG00000001502	SBNO1	96	76.277	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000015633	sbno1	60	71.875	ENSMEUG00000008768	-	82	76.596	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000015633	sbno1	100	77.896	ENSOPRG00000011054	SBNO1	94	78.387	Ochotona_princeps
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.672	ENSODEG00000009997	SBNO1	96	84.672	Octodon_degus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.339	ENSONIG00000015348	sbno1	94	89.189	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	77.803	ENSOCUG00000002441	SBNO1	89	78.187	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.237	ENSORLG00000001593	sbno1	94	87.162	Oryzias_latipes
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.303	ENSORLG00020015216	sbno1	94	87.228	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.528	ENSORLG00015002726	sbno1	94	87.453	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000015633	sbno1	99	87.763	ENSOMEG00000019313	sbno1	95	87.669	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.751	ENSOARG00000004404	SBNO1	94	78.979	Ovis_aries
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	ENSPPAG00000024635	SBNO1	96	84.489	Pan_paniscus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	ENSPPRG00000022092	SBNO1	94	79.252	Panthera_pardus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	79.024	ENSPTIG00000017803	SBNO1	94	79.252	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	ENSPTRG00000005597	SBNO1	96	84.489	Pan_troglodytes
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.489	ENSPANG00000011640	SBNO1	96	84.489	Papio_anubis
ENSGACG00000015633	sbno1	99	82.192	ENSPKIG00000001441	sbno1	94	81.963	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000015633	sbno1	91	75.021	ENSPSIG00000009256	-	94	75.433	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000015633	sbno1	98	78.351	ENSPSIG00000009572	-	97	78.393	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000015633	sbno1	94	83.942	ENSPEMG00000016087	Sbno1	96	83.942	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.522	ENSPCIG00000010985	SBNO1	96	78.653	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.406	ENSPFOG00000005069	sbno1	94	89.557	Poecilia_formosa
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.482	ENSPLAG00000015015	sbno1	94	89.632	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000015633	sbno1	100	89.347	ENSPMEG00000021212	sbno1	95	89.497	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000015633	sbno1	100	88.747	ENSPREG00000017746	sbno1	95	88.897	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.550	ENSPPYG00000005084	SBNO1	94	78.855	Pongo_abelii
ENSGACG00000015633	sbno1	82	78.704	ENSPCAG00000008634	SBNO1	82	73.765	Procavia_capensis
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.191	ENSPCOG00000024277	SBNO1	96	84.191	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000015633	sbno1	85	84.137	ENSPVAG00000015304	SBNO1	81	84.137	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.023	ENSPNYG00000004291	sbno1	94	88.872	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000015633	sbno1	99	82.300	ENSPNAG00000015622	sbno1	94	82.589	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000015633	sbno1	94	84.124	ENSRNOG00000001064	Sbno1	96	84.124	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000015633	sbno1	95	84.489	ENSRROG00000034230	SBNO1	96	84.489	Rhinopithecus_roxellana
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ENSGACG00000015633	sbno1	100	82.473	ENSSFOG00015019025	sbno1	97	82.246	Scleropages_formosus
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