EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGACG00000015841 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15523 bases
Position: chrgroupXIV:1417160-1432682
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000020908	IBN_N	PF03810.19	1.6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000020948	-	2685	-	ENSGACP00000020908	895 (aa)	-	G3PTH2

Gene Model

Click here to download ENSGACG00000015841's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGACG00000015841's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	83.501	ENSGACG00000012449	tnpo2	99	83.501
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	86.149	ENSGACG00000018968	TNPO2	99	86.149

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.079	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.079	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.907	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	92.018	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000015841	tnpo1	86	95.866	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	95.866	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.191	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.191	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.191	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.191	Amphiprion_percula
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.742	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	96.742	Anabas_testudineus
ENSGACG00000015841	tnpo1	98	89.290	ENSAPLG00000009619	-	97	90.023	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.809	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.809	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	58.739	ENSANAG00000027118	-	99	60.841	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.506	ENSANAG00000022453	-	99	92.506	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	83.408	ENSANAG00000025351	-	99	83.315	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	94.719	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.719	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	94.170	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.065	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	93.065	Bos_taurus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.617	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.617	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.116	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	93.116	Canis_familiaris
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	90.674	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.674	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.953	Capra_hircus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	89.718	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	92.047	Carlito_syrichta
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.697	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.697	Cebus_capucinus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	93.146	Cercocebus_atys
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.697	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.697	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.953	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000015841	tnpo1	94	81.257	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	81.257	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.378	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	93.378	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	75.982	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.758	Ciona_savignyi
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.953	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.841	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.841	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.216	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	93.216	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.393	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.393	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.292	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.292	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.603	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.154	Danio_rerio
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	87.388	ENSDNOG00000006647	TNPO1	100	87.388	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000015841	tnpo1	93	93.133	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	93.124	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	58.061	FBgn0035693	CG8219	99	57.835	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000015841	tnpo1	86	94.382	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.382	Echinops_telfairi
ENSGACG00000015841	tnpo1	94	85.357	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	93.146	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.953	Equus_caballus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	88.126	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	87.908	Esox_lucius
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	93.146	Felis_catus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.483	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	93.483	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.617	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.617	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.072	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.072	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.506	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	92.506	Gadus_morhua
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.034	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	93.034	Gallus_gallus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.076	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.076	Gambusia_affinis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.146	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	77.877	ENSGGOG00000022535	-	99	77.877	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	93.146	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.404	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.404	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.506	ENSHGLG00000000970	-	99	92.506	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	73.023	ENSHGLG00100000963	-	99	72.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	92.757	ENSHGLG00100017090	-	99	92.757	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.953	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.180	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.180	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000015841	tnpo1	90	93.588	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.588	Labrus_bergylta
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	86.395	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.395	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.960	ENSLOCG00000011092	tnpo1	98	93.960	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	97	92.494	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.494	Loxodonta_africana
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.953	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.115	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	93.115	Macaca_mulatta
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.953	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.953	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.629	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	96.629	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.067	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.067	Maylandia_zebra
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.833	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.820	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	89.250	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	89.250	Microcebus_murinus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.729	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.729	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000015841	tnpo1	86	95.490	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.490	Mola_mola
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.191	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	93.191	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.393	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.393	Monopterus_albus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.034	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.820	Mus_caroli
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.034	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.820	Mus_musculus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.820	Mus_pahari
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.617	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.820	Mus_spretus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.953	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.015	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	93.015	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.953	Nannospalax_galili
ENSGACG00000015841	tnpo1	86	96.124	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.124	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	93.146	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000015841	tnpo1	91	87.730	ENSOPRG00000012390	TNPO1	90	87.705	Ochotona_princeps
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.282	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	92.282	Octodon_degus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.556	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.556	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000015841	tnpo1	92	93.659	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.659	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	87.150	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	87.150	Oryctolagus_cuniculus
ENSGACG00000015841	tnpo1	86	95.331	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.331	Oryzias_latipes
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.490	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	95.490	Oryzias_latipes_hni
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.716	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	95.716	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.603	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.603	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.953	Otolemur_garnettii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.065	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	93.065	Ovis_aries
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.953	Pan_paniscus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	93.146	Panthera_pardus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	93.146	Panthera_tigris_altaica
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.953	Pan_troglodytes
ENSGACG00000015841	tnpo1	94	81.906	ENSPTRG00000047731	-	100	81.906	Pan_troglodytes
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.953	Papio_anubis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.124	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.124	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.603	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.603	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.154	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	92.593	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.216	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	93.216	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.820	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.820	Phascolarctos_cinereus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.417	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.417	Poecilia_formosa
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.417	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.417	Poecilia_latipinna
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.517	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.517	Poecilia_mexicana
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.300	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.300	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.841	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.841	Pongo_abelii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.953	Propithecus_coquereli
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.953	Pteropus_vampyrus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.184	ENSPNYG00000001522	tnpo1	100	96.184	Pundamilia_nyererei
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.825	ENSPNAG00000021484	tnpo1	100	93.274	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	100	93.146	Rattus_norvegicus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSRBIG00000021642	TNPO1	100	93.146	Rhinopithecus_bieti
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.953	ENSRROG00000035271	TNPO1	99	92.953	Rhinopithecus_roxellana
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	92.809	ENSSBOG00000029256	TNPO1	100	92.809	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	93.801	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	93.801	Sarcophilus_harrisii
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.398	ENSSFOG00015015448	tnpo1	100	95.398	Scleropages_formosus
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	97.430	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	97.430	Scophthalmus_maximus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.191	ENSSDUG00000007943	tnpo1	100	97.191	Seriola_dumerili
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	97.303	ENSSLDG00000014578	tnpo1	100	97.303	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.034	ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.034	Sphenodon_punctatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.966	ENSSPAG00000000258	tnpo1	100	96.966	Stegastes_partitus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.146	Sus_scrofa
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.518	ENSTGUG00000005729	TNPO1	100	91.518	Taeniopygia_guttata
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.393	ENSTRUG00000018491	tnpo1	100	95.393	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000015841	tnpo1	68	91.396	ENSTNIG00000007483	tnpo1	100	91.396	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000015841	tnpo1	86	94.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	86	94.667	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000015841	tnpo1	96	89.591	ENSTTRG00000000209	TNPO1	95	89.591	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSUMAG00000007635	TNPO1	100	93.146	Ursus_maritimus
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	89.038	ENSVPAG00000009601	TNPO1	99	89.038	Vicugna_pacos
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	ENSVVUG00000007338	TNPO1	100	93.146	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.685	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.685	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.521	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.521	Xiphophorus_maculatus