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Description

Ensembl ID: ENSGACG00000019736 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: xpo1a
Alias: im:7151655
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) a
Gene Type: protein_coding
Species: Gasterosteus_aculeatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10396 bases
Position: chrgroupIX:19264037-19274432
Accession: ZDB-GENE-050309-201
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGACP00000026073	CRM1_C	PF08767.11	2.2e-131	1	1
ENSGACP00000026073	Xpo1	PF08389.12	6.8e-42	1	1
ENSGACP00000026073	IBN_N	PF03810.19	2.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGACT00000026124	-	4429	-	ENSGACP00000026073	1066 (aa)	-	G3Q859

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.624	ENSGACG00000002743	-	100	92.624

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSG00000082898	XPO1	100	90.850	Homo_sapiens
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	96.364	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	96.364	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.624	ENSAPOG00000004984	-	100	92.624	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.604	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	91.604	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	98.075	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	98.075	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	93.617	ENSACIG00000010818	-	100	93.617	Amphilophus_citrinellus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.874	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	98.874	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSAOCG00000010121	-	100	92.717	Amphiprion_ocellaris
ENSGACG00000019736	xpo1a	91	98.861	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	98.861	Amphiprion_percula
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSAPEG00000007038	-	100	92.717	Amphiprion_percula
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSATEG00000008816	-	100	92.717	Anabas_testudineus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.124	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	98.124	Anabas_testudineus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	91.783	Anas_platyrhynchos
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	ENSACAG00000002501	XPO1	100	91.783	Anolis_carolinensis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSANAG00000020802	XPO1	100	90.850	Aotus_nancymaae
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	98.182	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	98.182	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.624	ENSACLG00000015192	-	100	92.624	Astatotilapia_calliptera
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	93.538	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.538	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.184	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	93.184	Astyanax_mexicanus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	91.690	Bos_taurus
ENSGACG00000019736	xpo1a	98	52.448	WBGene00002078	xpo-1	98	52.448	Caenorhabditis_elegans
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	90.850	Callithrix_jacchus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	91.690	Canis_familiaris
ENSGACG00000019736	xpo1a	93	91.984	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	91.984	Canis_lupus_dingo
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	91.690	Capra_hircus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	91.690	Carlito_syrichta
ENSGACG00000019736	xpo1a	53	87.589	ENSCAPG00000006454	-	100	87.589	Cavia_aperea
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.196	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	90.196	Cavia_porcellus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	73.562	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	73.748	Cebus_capucinus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	89.106	ENSCATG00000032674	XPO1	100	91.489	Cercocebus_atys
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.410	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	91.410	Chinchilla_lanigera
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	90.850	Chlorocebus_sabaeus
ENSGACG00000019736	xpo1a	83	93.385	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	93.385	Choloepus_hoffmanni
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	91.783	Chrysemys_picta_bellii
ENSGACG00000019736	xpo1a	99	79.792	ENSCING00000024562	-	99	79.792	Ciona_intestinalis
ENSGACG00000019736	xpo1a	99	78.371	ENSCSAVG00000005965	-	99	78.371	Ciona_savignyi
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	86.741	ENSCANG00000028883	XPO1	100	90.603	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.663	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	90.663	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.663	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	90.663	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	92.447	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	92.447	Cynoglossus_semilaevis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	96.904	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	96.904	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.344	ENSCVAG00000016788	-	100	92.344	Cyprinodon_variegatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	94.211	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.975	Danio_rerio
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.091	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	93.091	Danio_rerio
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	91.783	Dasypus_novemcinctus
ENSGACG00000019736	xpo1a	91	89.026	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	89.026	Dipodomys_ordii
ENSGACG00000019736	xpo1a	99	68.956	FBgn0020497	emb	99	68.956	Drosophila_melanogaster
ENSGACG00000019736	xpo1a	94	91.513	ENSETEG00000018045	XPO1	94	91.513	Echinops_telfairi
ENSGACG00000019736	xpo1a	90	77.697	ENSEBUG00000012580	-	100	85.954	Eptatretus_burgeri
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSEASG00005007223	XPO1	100	91.690	Equus_asinus_asinus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSECAG00000024920	XPO1	100	91.806	Equus_caballus
ENSGACG00000019736	xpo1a	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSGACG00000019736	xpo1a	87	90.471	ENSELUG00000014306	-	99	90.471	Esox_lucius
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	95.745	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.745	Esox_lucius
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	91.690	Felis_catus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.597	ENSFALG00000010989	XPO1	100	91.597	Ficedula_albicollis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.009	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	90.009	Fukomys_damarensis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.186	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	97.186	Fundulus_heteroclitus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	94.934	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.934	Gadus_morhua
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	86.928	ENSGMOG00000019063	-	100	86.928	Gadus_morhua
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	ENSGALG00000029476	XPO1	100	91.783	Gallus_gallus
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	97.433	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	97.433	Gambusia_affinis
ENSGACG00000019736	xpo1a	91	92.894	ENSGAFG00000003355	-	98	92.894	Gambusia_affinis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	91.690	Gopherus_agassizii
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	90.850	Gorilla_gorilla
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.405	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	98.405	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSHBUG00000020037	-	100	92.717	Haplochromis_burtoni
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.317	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	91.317	Heterocephalus_glaber_female
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.317	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	91.317	Heterocephalus_glaber_male
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	92.660	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	92.660	Hippocampus_comes
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	94.304	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.304	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.184	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	93.184	Ictalurus_punctatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.503	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	91.503	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.503	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	91.503	Jaculus_jaculus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.186	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	97.186	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.437	ENSKMAG00000016218	-	100	92.437	Kryptolebias_marmoratus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSLBEG00000005740	-	100	92.717	Labrus_bergylta
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	95.527	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	95.527	Labrus_bergylta
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	71.653	ENSLACG00000018213	XPO1	100	71.653	Latimeria_chalumnae
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.997	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	92.997	Lepisosteus_oculatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.410	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	91.410	Loxodonta_africana
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	90.850	Macaca_fascicularis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	90.850	Macaca_mulatta
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	90.850	Macaca_nemestrina
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	89.116	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	89.116	Mandrillus_leucophaeus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSMAMG00000010568	-	100	92.717	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.124	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	98.124	Mastacembelus_armatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.405	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	98.405	Maylandia_zebra
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.624	ENSMZEG00005018158	-	98	93.100	Maylandia_zebra
ENSGACG00000019736	xpo1a	68	91.460	ENSMGAG00000001496	-	100	91.460	Meleagris_gallopavo
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.663	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	90.663	Mesocricetus_auratus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSMICG00000027770	XPO1	100	91.690	Microcebus_murinus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.943	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	90.943	Microtus_ochrogaster
ENSGACG00000019736	xpo1a	87	93.597	ENSMMOG00000008001	-	99	93.597	Mola_mola
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	98.610	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	98.610	Mola_mola
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.663	ENSMODG00000002831	XPO1	100	90.663	Monodelphis_domestica
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.530	ENSMALG00000007085	-	100	92.530	Monopterus_albus
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	96.281	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	96.281	Monopterus_albus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	90.850	Mus_caroli
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	90.850	Mus_musculus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.756	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	90.756	Mus_pahari
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	90.850	Mus_spretus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	91.690	Mustela_putorius_furo
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.597	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	91.597	Myotis_lucifugus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.597	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	91.597	Nannospalax_galili
ENSGACG00000019736	xpo1a	95	92.766	ENSNBRG00000012229	-	100	93.723	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	98.405	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	98.405	Neolamprologus_brichardi
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	87.261	ENSNLEG00000009680	XPO1	100	87.261	Nomascus_leucogenys
ENSGACG00000019736	xpo1a	63	93.750	ENSMEUG00000013277	-	63	93.750	Notamacropus_eugenii
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	86.555	ENSOPRG00000012615	XPO1	100	86.555	Ochotona_princeps
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.476	ENSODEG00000012632	XPO1	100	90.476	Octodon_degus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	94.752	ENSONIG00000000019	xpo1a	100	94.752	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000019736	xpo1a	93	93.373	ENSONIG00000002969	-	99	93.373	Oreochromis_niloticus
ENSGACG00000019736	xpo1a	96	92.016	ENSOANG00000012417	XPO1	100	92.016	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSGACG00000019736	xpo1a	91	93.100	ENSORLG00015008640	-	98	93.100	Oryzias_latipes_hsok
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	96.043	ENSOMEG00000007343	xpo1a	100	96.043	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.717	ENSOMEG00000001384	-	100	93.511	Oryzias_melastigma
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	88.175	ENSOGAG00000000143	XPO1	100	88.175	Otolemur_garnettii
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.277	ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.671	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.437	ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.437	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.715	ENSPSIG00000014457	XPO1	100	92.367	Pelodiscus_sinensis
ENSGACG00000019736	xpo1a	86	96.292	ENSPMGG00000019000	XPO1	100	96.292	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.943	ENSPEMG00000010103	Xpo1	100	90.943	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.280	ENSPMEG00000003659	xpo1a	100	97.280	Poecilia_mexicana
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.373	ENSPREG00000020796	xpo1a	100	97.373	Poecilia_reticulata
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.530	ENSPREG00000010135	-	100	92.530	Poecilia_reticulata
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.464	ENSPNAG00000008916	xpo1b	100	93.464	Pygocentrus_nattereri
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	90.850	ENSRNOG00000009935	Xpo1	100	90.850	Rattus_norvegicus
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ENSGACG00000019736	xpo1a	98	47.364	YGR218W	CRM1	99	47.364	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.371	ENSSFOG00015011598	xpo1b	100	93.371	Scleropages_formosus
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ENSGACG00000019736	xpo1a	52	98.727	ENSSLDG00000017407	xpo1a	95	98.727	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.624	ENSSLDG00000019530	-	100	92.624	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGACG00000019736	xpo1a	91	91.226	ENSSARG00000014000	-	91	91.226	Sorex_araneus
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.783	ENSSSCG00000028228	XPO1	100	92.553	Sus_scrofa
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ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.530	ENSTRUG00000005571	-	100	92.530	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000019736	xpo1a	99	98.023	ENSTRUG00000001415	xpo1a	100	98.023	Takifugu_rubripes
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	96.435	ENSTNIG00000003360	xpo1a	100	96.435	Tetraodon_nigroviridis
ENSGACG00000019736	xpo1a	63	94.904	ENSTBEG00000014485	-	70	94.904	Tupaia_belangeri
ENSGACG00000019736	xpo1a	95	81.818	ENSTTRG00000013369	XPO1	100	81.818	Tursiops_truncatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSUAMG00000026512	XPO1	100	91.690	Ursus_americanus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.597	ENSUMAG00000019859	XPO1	100	91.597	Ursus_maritimus
ENSGACG00000019736	xpo1a	95	87.292	ENSVPAG00000011446	XPO1	100	87.292	Vicugna_pacos
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.690	ENSVVUG00000012009	XPO1	100	91.690	Vulpes_vulpes
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.130	ENSXETG00000002224	xpo1	100	91.130	Xenopus_tropicalis
ENSGACG00000019736	xpo1a	88	97.326	ENSXCOG00000011889	XPO1	100	97.326	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000019736	xpo1a	82	94.885	ENSXCOG00000006625	-	99	94.885	Xiphophorus_couchianus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	97.373	ENSXMAG00000005790	xpo1a	100	97.373	Xiphophorus_maculatus
ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.344	ENSXMAG00000007353	-	100	92.344	Xiphophorus_maculatus