EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000000453 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10675 bases
Position: chrNHOQ01001971.1:2911031-2921705
Accession: ZDB-GENE-030219-11
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000000670	SRP54	PF00448.22	3.1e-48	1	1
ENSGAFP00000000657	SRP54	PF00448.22	3.7e-48	1	1
ENSGAFP00000000670	SRP54_N	PF02881.19	1e-09	1	1
ENSGAFP00000000657	SRP54_N	PF02881.19	1.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000000677	-	1800	-	ENSGAFP00000000670	599 (aa)	-	-
ENSGAFT00000000664	-	4846	-	ENSGAFP00000000657	647 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000000453's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000000453's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.085	ENSG00000182934	SRPRA	100	67.933	Homo_sapiens
ENSGAFG00000000453	srpra	100	90.154	ENSAPOG00000017588	srpra	100	89.692	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.927	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	66.768	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000000453	srpra	100	84.699	ENSACIG00000021588	srpra	100	86.090	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	90.154	ENSAOCG00000018884	srpra	100	89.692	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000000453	srpra	100	90.154	ENSAPEG00000022286	srpra	100	84.314	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000000453	srpra	100	86.503	ENSATEG00000023578	srpra	95	94.529	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000000453	srpra	94	71.010	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	70.779	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000000453	srpra	100	71.710	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	71.041	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.068	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	67.580	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000000453	srpra	100	87.017	ENSACLG00000000518	srpra	100	87.017	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000000453	srpra	100	73.616	ENSAMXG00000009975	srpra	100	73.616	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.322	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	67.976	Bos_taurus
ENSGAFG00000000453	srpra	99	49.375	WBGene00009521	F38A1.8	99	49.057	Caenorhabditis_elegans
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.449	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	67.344	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.273	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	66.459	Canis_familiaris
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.939	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	68.085	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.707	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.226	Capra_hircus
ENSGAFG00000000453	srpra	85	80.282	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	86.984	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000000453	srpra	94	68.475	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.388	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.189	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	67.176	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.727	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	67.523	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.389	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.140	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.218	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	67.732	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000000453	srpra	54	86.735	ENSCHOG00000010015	-	72	86.735	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000000453	srpra	100	70.802	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	70.934	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000000453	srpra	83	76.875	ENSCING00000008954	-	100	56.832	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000000453	srpra	99	58.525	ENSCSAVG00000005602	-	100	58.106	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.576	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	67.884	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.445	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	68.037	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.445	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000000453	srpra	100	85.452	ENSCSEG00000002374	srpra	100	85.145	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	90.505	ENSCVAG00000019881	srpra	100	90.505	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	78.015	ENSDARG00000061124	srpra	100	77.405	Danio_rerio
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.669	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.867	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.365	ENSDORG00000016719	Srpr	100	68.140	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000000453	srpra	99	51.380	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.214	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.134	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.515	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000000453	srpra	54	82.716	ENSEBUG00000002602	srpra	93	71.782	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.933	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	66.718	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.933	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	66.718	Equus_caballus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	62.826	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.462	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	84.839	ENSELUG00000017643	srpra	100	84.793	Esox_lucius
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.024	ENSFCAG00000011274	-	100	66.972	Felis_catus
ENSGAFG00000000453	srpra	80	62.430	ENSFCAG00000030894	-	99	61.027	Felis_catus
ENSGAFG00000000453	srpra	99	68.510	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.588	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	66.517	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	92.934	ENSFHEG00000016959	srpra	100	92.780	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	80.982	ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.298	Gadus_morhua
ENSGAFG00000000453	srpra	100	71.298	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	71.233	Gallus_gallus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	83.002	ENSGACG00000006550	srpra	100	83.153	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	71.104	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	71.235	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.085	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	67.933	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000000453	srpra	100	86.862	ENSHBUG00000000119	srpra	100	86.862	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000000453	srpra	100	66.917	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000000453	srpra	100	66.917	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000000453	srpra	100	85.452	ENSHCOG00000010749	srpra	100	84.992	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000000453	srpra	94	75.120	ENSIPUG00000000867	srpra	99	75.000	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.835	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	67.580	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.786	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.656	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	89.264	ENSKMAG00000002280	srpra	100	89.264	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	87.711	ENSLBEG00000009608	srpra	100	87.558	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000000453	srpra	100	70.091	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.181	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000000453	srpra	100	76.031	ENSLOCG00000002733	srpra	100	75.420	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.043	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	67.018	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.368	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	67.884	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.368	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	67.884	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.293	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	68.140	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.727	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	67.523	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	85.846	ENSMAMG00000000473	srpra	100	86.000	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	87.017	ENSMZEG00005013432	srpra	100	87.017	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000000453	srpra	94	70.292	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	70.388	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.750	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	68.037	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.068	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	67.879	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.445	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	67.732	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000000453	srpra	100	82.126	ENSMMOG00000005019	srpra	100	82.126	Mola_mola
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.598	ENSMODG00000004576	-	100	67.835	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000000453	srpra	100	88.154	ENSMALG00000011343	srpra	100	88.154	Monopterus_albus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.092	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.997	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.293	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSGAFG00000000453	srpra	100	64.629	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	63.925	Mus_spretus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.237	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	66.927	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.530	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	66.361	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.606	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	67.530	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000000453	srpra	100	86.244	ENSNBRG00000017311	srpra	100	86.244	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000000453	srpra	99	64.373	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	66.986	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000000453	srpra	94	66.934	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	66.238	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000000453	srpra	92	73.479	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	63.339	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.437	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	67.933	Octodon_degus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	86.553	ENSONIG00000005324	srpra	100	86.553	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.449	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	67.884	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	85.626	ENSORLG00000014676	srpra	100	85.471	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000000453	srpra	100	85.471	ENSORLG00020009240	srpra	100	85.317	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000000453	srpra	100	85.162	ENSORLG00015015405	srpra	100	85.008	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000000453	srpra	100	86.090	ENSOMEG00000005872	srpra	100	85.935	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.271	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	67.606	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000000453	srpra	100	64.840	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	64.939	Ovis_aries
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.085	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	67.933	Pan_paniscus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.024	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	66.972	Panthera_pardus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.873	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	66.820	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.085	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	67.933	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.368	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	67.884	Papio_anubis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	76.805	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.805	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000000453	srpra	94	70.436	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	70.305	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	84.308	ENSPMGG00000001393	srpra	100	82.615	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.598	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	67.884	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000000453	srpra	99	61.787	ENSPMAG00000009559	srpra	99	62.615	Petromyzon_marinus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.037	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.879	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	96.308	ENSPFOG00000003114	srpra	100	96.308	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000000453	srpra	100	96.308	ENSPLAG00000007323	srpra	100	96.308	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000000453	srpra	100	96.462	ENSPMEG00000015658	srpra	100	96.462	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000000453	srpra	100	96.462	ENSPREG00000004937	srpra	100	96.462	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000000453	srpra	89	85.526	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	85.526	Pongo_abelii
ENSGAFG00000000453	srpra	63	89.922	ENSPCAG00000003801	-	63	89.922	Procavia_capensis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.068	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	67.580	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.428	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	67.555	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	87.017	ENSPNYG00000012371	srpra	100	87.017	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000000453	srpra	100	78.988	ENSPNAG00000013476	srpra	100	78.681	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.293	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	67.884	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.437	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	67.884	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.519	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	68.037	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000000453	srpra	54	42.274	YDR292C	-	52	42.249	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGAFG00000000453	srpra	100	66.917	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.428	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000000453	srpra	94	67.099	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.775	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000000453	srpra	100	77.152	ENSSFOG00015008837	srpra	100	78.808	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	82.680	ENSSMAG00000002783	srpra	100	82.680	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	88.786	ENSSDUG00000013920	srpra	100	85.738	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000000453	srpra	100	88.633	ENSSLDG00000008601	srpra	93	88.018	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000000453	srpra	81	85.366	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	85.366	Sorex_araneus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.271	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	67.922	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	87.883	ENSSPAG00000005103	srpra	100	89.571	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.533	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.134	Sus_scrofa
ENSGAFG00000000453	srpra	94	68.720	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	67.747	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000000453	srpra	100	84.639	ENSTRUG00000006856	srpra	100	84.259	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000000453	srpra	100	78.939	ENSTNIG00000010316	srpra	100	78.788	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000000453	srpra	100	67.863	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	67.391	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.333	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.927	Ursus_americanus
ENSGAFG00000000453	srpra	96	62.364	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	62.267	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000000453	srpra	69	89.922	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	89.922	Vicugna_pacos
ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.845	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	67.976	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000000453	srpra	100	59.970	ENSXETG00000003920	srpra	100	60.239	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000000453	srpra	89	92.655	ENSXCOG00000001286	srpra	100	97.885	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000000453	srpra	100	97.218	ENSXMAG00000028401	srpra	100	97.218	Xiphophorus_maculatus