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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000000943 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 26489 bases
Position: chrNHOQ01001156.1:14589557-14616045
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000001401	IBN_N	PF03810.19	1.4e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000001418	-	7716	-	ENSGAFP00000001401	892 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	86.277	ENSGAFG00000010401	TNPO2	99	86.164
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	86.614	ENSGAFG00000018993	tnpo2	99	86.614

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSG00000083312	TNPO1	100	94.819	Homo_sapiens
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.758	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	97.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.444	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.556	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.521	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	96.521	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.646	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.646	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.646	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.646	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.197	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.197	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	88.839	ENSAPLG00000009619	-	97	89.908	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.377	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	58.222	ENSANAG00000027118	-	99	60.619	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	ENSANAG00000022453	-	99	91.928	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	82.623	ENSANAG00000025351	-	99	82.623	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.731	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	94.731	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.625	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	94.507	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.265	Bos_taurus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.040	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.317	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.317	Canis_familiaris
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	89.910	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	89.910	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.152	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.152	Capra_hircus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	88.726	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.132	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	91.928	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.377	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.152	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	92.152	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.377	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	94	80.975	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.499	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.713	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.937	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	76.148	ENSCSAVG00000010981	-	99	76.148	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.377	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.415	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.516	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.516	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.094	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	98.094	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.170	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	94.170	Danio_rerio
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	87.151	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	86.704	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	93	92.298	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.298	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	58.380	FBgn0035693	CG8219	99	58.155	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000000943	tnpo1	86	94.757	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	94.757	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000000943	tnpo1	94	85.154	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.392	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.377	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.377	Equus_caballus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	88.998	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	88.178	Esox_lucius
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.377	Felis_catus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.825	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.825	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.040	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.870	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	97.870	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.057	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	93.057	Gadus_morhua
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	92.265	Gallus_gallus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.076	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	96.076	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.049	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	93.049	Gopherus_agassizii
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.377	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	78.251	ENSGGOG00000022535	-	98	78.251	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.525	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	96.525	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	ENSHGLG00000000970	-	99	91.928	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000000943	tnpo1	97	72.506	ENSHGLG00100000963	-	99	71.810	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	91.958	ENSHGLG00100017090	-	99	91.958	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.489	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.489	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.637	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.637	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	91	93.596	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.596	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	87.123	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.123	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	94.283	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	94.283	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	97	91.705	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.705	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.377	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.342	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.377	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.377	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	97.422	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.422	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	96.076	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.076	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	88.901	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.901	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.265	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.134	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	96.134	Mola_mola
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	94.043	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.852	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.852	Monopterus_albus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.258	Mus_caroli
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.265	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.258	Mus_musculus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.152	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	Mus_pahari
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.258	Mus_spretus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.377	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.102	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.102	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.377	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.263	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.263	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.377	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000000943	tnpo1	90	87.730	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	87.705	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	91.928	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.928	Octodon_degus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.768	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	95.768	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	92	93.431	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.431	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	86.480	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	87	96.248	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.248	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	96.625	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	96.625	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	96.963	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.963	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000000943	tnpo1	99	96.738	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	96.738	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.377	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.040	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.265	Ovis_aries
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.377	Pan_paniscus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.377	Panthera_pardus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.377	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000000943	tnpo1	94	82.182	ENSPTRG00000047731	-	100	82.182	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.377	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.377	Papio_anubis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	89.910	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.359	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.049	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	93.049	Pelodiscus_sinensis
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.617	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.393	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	92.415	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.415	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	93.049	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.049	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.432	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	98.432	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.432	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	98.432	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.767	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	98.767	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.543	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	98.543	Poecilia_reticulata
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ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.377	Propithecus_coquereli
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ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	98.655	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	98.655	Xiphophorus_maculatus