EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000002382 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: SKI2 homolog%2C superkiller viralicidic activity 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24991 bases
Position: chrNHOQ01002733.1:460325-485315
Accession: ZDB-GENE-010430-5
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000003595	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.1e-29	1	1
ENSGAFP00000003595	DEAD	PF00270.29	2.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000003641	-	4669	-	ENSGAFP00000003595	1246 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000002382's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000002382's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSGAFG00000002382	skiv2l	76	37.219	ENSGAFG00000012425	mtrex	94	36.223

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.347	ENSG00000204351	SKIV2L	99	61.155	Homo_sapiens
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.048	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	90.048	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.298	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	61.344	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	88.583	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.502	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.530	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	90.530	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.369	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	90.369	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.369	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	90.369	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	62.559	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	62.830	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.989	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	61.788	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	89.968	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	89.968	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	82.574	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	82.734	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.396	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	61.441	Bos_taurus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	96	40.892	WBGene00008502	skih-2	99	41.289	Caenorhabditis_elegans
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.637	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	61.441	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.107	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	61.155	Canis_familiaris
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.107	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	61.155	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.637	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	61.679	Capra_hircus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.062	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	61.124	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.259	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	61.067	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.748	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	61.551	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.396	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	61.441	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.458	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	61.265	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.668	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	61.472	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	84	65.268	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	59.506	Chrysemys_picta_bellii
ENSGAFG00000002382	skiv2l	93	50.987	ENSCING00000005576	-	99	50.987	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.316	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	60.556	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.847	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	61.569	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	86.887	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	87.047	Cynoglossus_semilaevis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	94.944	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	94.980	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	83.933	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	83.693	Danio_rerio
ENSGAFG00000002382	skiv2l	92	65.557	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	93	65.621	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	93	45.553	FBgn0039117	tst	97	45.636	Drosophila_melanogaster
ENSGAFG00000002382	skiv2l	68	70.886	ENSETEG00000009522	SKIV2L	69	70.886	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000002382	skiv2l	91	55.137	ENSEBUG00000013680	-	98	54.712	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000002382	skiv2l	92	62.425	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	63.108	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	93	61.304	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	61.770	Equus_caballus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	52	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	85.040	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	87.146	Esox_lucius
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.538	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	61.581	Felis_catus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	59.952	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	60.174	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	93.740	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	93.740	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	81.285	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	80.884	Gadus_morhua
ENSGAFG00000002382	skiv2l	76	56.517	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.302	Gallus_gallus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.489	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	88.489	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.458	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	61.265	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.048	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	90.048	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.946	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.821	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	59.262	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	59.163	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000002382	skiv2l	98	81.648	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	81.648	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	81.920	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	82.276	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.599	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	61.758	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	56	64.286	ENSLACG00000002986	-	60	64.286	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.464	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.599	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.396	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	61.441	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.396	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	61.441	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.396	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	61.441	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.316	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	61.362	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	89.727	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	89.727	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.048	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	90.048	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000002382	skiv2l	61	59.512	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	49.351	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.285	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	61.173	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.588	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	61.709	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.289	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	60.143	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	84.795	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	84.795	Mola_mola
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.429	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	61.788	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	84.375	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.295	Monopterus_albus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.767	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	61.490	Mus_caroli
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.526	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	61.490	Mus_musculus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.817	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	61.776	Mus_pahari
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.526	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	61.490	Mus_spretus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.626	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	61.076	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.298	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	61.107	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	86.221	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	86.221	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.740	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	60.589	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000002382	skiv2l	78	61.607	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.062	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.107	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	61.124	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.508	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	61.313	Octodon_degus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.449	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	90.449	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.748	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	61.788	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.542	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	88.542	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.381	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	88.381	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.381	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	88.381	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.933	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	88.933	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.668	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	61.472	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	58.072	ENSOARG00000002411	-	99	58.107	Ovis_aries
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.845	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	60.773	Pan_paniscus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.588	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	61.630	Panthera_pardus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.187	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	61.234	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.427	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	61.234	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.463	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	60.632	Papio_anubis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	78.759	ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.520	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	85.334	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	85.496	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.334	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	61.221	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.265	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	61.295	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	97.913	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	97.913	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	97.753	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	97.753	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	97.994	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	97.994	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	90.008	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	90.008	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.187	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	60.997	Pongo_abelii
ENSGAFG00000002382	skiv2l	77	61.311	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	61.311	Procavia_capensis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.588	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	61.630	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	62.039	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	61.837	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	82.609	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	82.609	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	84.253	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	83.814	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.847	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	61.569	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.447	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	60.616	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.557	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	61.599	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000002382	skiv2l	90	39.917	YLR398C	-	90	40.249	Saccharomyces_cerevisiae
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	62.229	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	61.867	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	60.983	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	60.301	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	82.203	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	81.883	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	88.925	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	88.988	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	90.369	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	90.369	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	83.159	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	83.159	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	59.382	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	59.228	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	95	90.593	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.593	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.203	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.441	Sus_scrofa
ENSGAFG00000002382	skiv2l	70	86.096	ENSTRUG00000000966	skiv2l	84	86.096	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	84.067	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	84.307	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	93	62.699	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.699	Tupaia_belangeri
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	57.223	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	57.403	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.427	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	61.472	Ursus_americanus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	92	62.596	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	62.852	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.107	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	61.270	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	58.987	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	58.987	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	96.938	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	96.938	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	98.154	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	98.154	Xiphophorus_maculatus