EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSGAFG00000003263 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Gambusia_affinis
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 21432 bases
Position: chrNHOQ01001229.1:3480189-3501620
Accession: ZDB-GENE-040426-1256
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSGAFP00000004793	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-28	1	2
ENSGAFP00000004793	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.9e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSGAFT00000004850	-	3350	-	ENSGAFP00000004793	846 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSGAFG00000003263's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSGAFG00000003263's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.332	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.752	Homo_sapiens
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.816	ENSAPOG00000004798	papolg	100	86.525	Acanthochromis_polyacanthus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.814	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	68.865	Ailuropoda_melanoleuca
ENSGAFG00000003263	papolg	89	79.443	ENSACIG00000010546	papolg	99	80.106	Amphilophus_citrinellus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	86.052	ENSAOCG00000010254	papolg	100	86.761	Amphiprion_ocellaris
ENSGAFG00000003263	papolg	100	86.052	ENSAPEG00000006944	papolg	100	86.643	Amphiprion_percula
ENSGAFG00000003263	papolg	100	86.170	ENSATEG00000009007	papolg	100	86.879	Anabas_testudineus
ENSGAFG00000003263	papolg	88	65.741	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.516	Anas_platyrhynchos
ENSGAFG00000003263	papolg	72	58.533	ENSACAG00000015048	-	67	74.194	Anolis_carolinensis
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.261	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	68.857	Aotus_nancymaae
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.781	ENSACLG00000015592	papolg	100	85.932	Astatotilapia_calliptera
ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.459	ENSAMXG00000004611	papolg	100	75.328	Astyanax_mexicanus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.829	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	68.497	Bos_taurus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.868	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	69.120	Callithrix_jacchus
ENSGAFG00000003263	papolg	96	69.393	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.455	Canis_familiaris
ENSGAFG00000003263	papolg	99	68.979	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.206	Canis_lupus_dingo
ENSGAFG00000003263	papolg	96	69.829	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.579	Capra_hircus
ENSGAFG00000003263	papolg	98	69.786	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	68.816	Carlito_syrichta
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.412	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.889	Cavia_porcellus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.000	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	69.251	Cebus_capucinus
ENSGAFG00000003263	papolg	81	81.385	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	81.385	Cercocebus_atys
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.132	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.668	Chinchilla_lanigera
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.868	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	69.120	Chlorocebus_sabaeus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	67.552	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	65.936	Choloepus_hoffmanni
ENSGAFG00000003263	papolg	58	64.097	ENSCING00000024664	-	92	64.097	Ciona_intestinalis
ENSGAFG00000003263	papolg	57	65.155	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.737	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	68.988	Colobus_angolensis_palliatus
ENSGAFG00000003263	papolg	88	69.907	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	68.783	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSGAFG00000003263	papolg	88	69.907	ENSCGRG00000005552	-	100	68.783	Cricetulus_griseus_crigri
ENSGAFG00000003263	papolg	100	89.542	ENSCVAG00000016602	papolg	94	98.400	Cyprinodon_variegatus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.722	ENSDARG00000012141	papolg	100	75.591	Danio_rerio
ENSGAFG00000003263	papolg	89	67.589	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	66.930	Dasypus_novemcinctus
ENSGAFG00000003263	papolg	51	85.548	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.548	Dipodomys_ordii
ENSGAFG00000003263	papolg	89	57.461	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	56.579	Echinops_telfairi
ENSGAFG00000003263	papolg	52	72.280	ENSEBUG00000004020	papolg	90	72.280	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000003263	papolg	54	59.170	ENSEBUG00000005042	-	78	59.170	Eptatretus_burgeri
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.342	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	68.407	Equus_asinus_asinus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.342	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	68.289	Equus_caballus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	62.254	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	62.137	Erinaceus_europaeus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	71.411	ENSELUG00000014497	papolg	99	75.838	Esox_lucius
ENSGAFG00000003263	papolg	99	70.000	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	68.668	Felis_catus
ENSGAFG00000003263	papolg	87	59.920	ENSFALG00000011079	PAPOLG	70	73.221	Ficedula_albicollis
ENSGAFG00000003263	papolg	91	68.992	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	99	67.821	Fukomys_damarensis
ENSGAFG00000003263	papolg	64	87.593	ENSFHEG00000019080	papolg	97	88.214	Fundulus_heteroclitus
ENSGAFG00000003263	papolg	77	92.599	ENSGMOG00000018772	papolg	94	92.599	Gadus_morhua
ENSGAFG00000003263	papolg	89	61.873	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	61.295	Gallus_gallus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	86.358	ENSGACG00000002718	papolg	100	86.148	Gasterosteus_aculeatus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.463	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	69.251	Gorilla_gorilla
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.781	ENSHBUG00000004882	papolg	100	85.934	Haplochromis_burtoni
ENSGAFG00000003263	papolg	88	69.894	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	68.553	Heterocephalus_glaber_female
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.000	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	68.668	Heterocephalus_glaber_male
ENSGAFG00000003263	papolg	100	84.988	ENSHCOG00000006782	papolg	100	84.570	Hippocampus_comes
ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.263	ENSIPUG00000021642	papolg	100	75.265	Ictalurus_punctatus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.669	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.799	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSGAFG00000003263	papolg	51	85.781	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.781	Jaculus_jaculus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	87.028	ENSKMAG00000016439	papolg	100	86.792	Kryptolebias_marmoratus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	81.766	ENSLBEG00000023218	papolg	100	82.454	Labrus_bergylta
ENSGAFG00000003263	papolg	99	63.241	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	63.109	Latimeria_chalumnae
ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.921	ENSLOCG00000016130	papolg	100	75.293	Lepisosteus_oculatus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.908	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	Loxodonta_africana
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.737	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	69.251	Macaca_fascicularis
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.737	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	69.251	Macaca_mulatta
ENSGAFG00000003263	papolg	89	62.614	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	62.141	Macaca_nemestrina
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.474	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	68.988	Mandrillus_leucophaeus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.461	ENSMAMG00000010667	papolg	100	86.293	Mastacembelus_armatus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.781	ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.932	Maylandia_zebra
ENSGAFG00000003263	papolg	88	63.418	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	98	62.101	Meleagris_gallopavo
ENSGAFG00000003263	papolg	88	70.292	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	69.079	Mesocricetus_auratus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.342	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	68.816	Microcebus_murinus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.503	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	69.060	Microtus_ochrogaster
ENSGAFG00000003263	papolg	99	85.582	ENSMMOG00000008020	papolg	99	85.847	Mola_mola
ENSGAFG00000003263	papolg	88	68.966	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	69.118	Monodelphis_domestica
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.697	ENSMALG00000007012	papolg	100	86.052	Monopterus_albus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.224	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.385	Mus_caroli
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.092	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.385	Mus_musculus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.709	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	68.734	Mus_pahari
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.092	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.385	Mus_spretus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.657	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	68.586	Mustela_putorius_furo
ENSGAFG00000003263	papolg	88	68.956	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	68.742	Myotis_lucifugus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.412	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	69.342	Nannospalax_galili
ENSGAFG00000003263	papolg	89	75.362	ENSNBRG00000011943	papolg	99	75.754	Neolamprologus_brichardi
ENSGAFG00000003263	papolg	51	85.315	ENSNLEG00000009507	-	100	85.315	Nomascus_leucogenys
ENSGAFG00000003263	papolg	54	68.471	ENSMEUG00000013605	-	67	68.471	Notamacropus_eugenii
ENSGAFG00000003263	papolg	99	68.816	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	68.016	Ochotona_princeps
ENSGAFG00000003263	papolg	50	82.742	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.742	Octodon_degus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	78.278	ENSONIG00000002985	papolg	100	78.940	Oreochromis_niloticus
ENSGAFG00000003263	papolg	97	69.190	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	69.190	Ornithorhynchus_anatinus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.669	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	68.407	Oryctolagus_cuniculus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.495	ENSORLG00000001577	papolg	100	85.377	Oryzias_latipes
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.395	ENSORLG00020002482	papolg	100	85.967	Oryzias_latipes_hni
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.495	ENSORLG00015008836	papolg	100	85.377	Oryzias_latipes_hsok
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.124	ENSOMEG00000001406	papolg	100	86.068	Oryzias_melastigma
ENSGAFG00000003263	papolg	52	56.532	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	56.044	Otolemur_garnettii
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.829	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	68.579	Ovis_aries
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.332	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	69.120	Pan_paniscus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	70.132	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	68.799	Panthera_pardus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	70.000	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	68.668	Panthera_tigris_altaica
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.332	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	69.120	Pan_troglodytes
ENSGAFG00000003263	papolg	89	66.404	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	65.924	Papio_anubis
ENSGAFG00000003263	papolg	83	74.507	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	86.796	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000003263	papolg	98	74.574	ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.788	Paramormyrops_kingsleyae
ENSGAFG00000003263	papolg	88	70.509	ENSPEMG00000008960	-	100	69.374	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSGAFG00000003263	papolg	88	51.546	ENSPMAG00000002961	papolg	73	62.681	Petromyzon_marinus
ENSGAFG00000003263	papolg	58	64.386	ENSPMAG00000004864	-	98	64.386	Petromyzon_marinus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.060	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	69.079	Phascolarctos_cinereus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	96.694	ENSPFOG00000012909	papolg	100	96.694	Poecilia_formosa
ENSGAFG00000003263	papolg	100	96.454	ENSPLAG00000018445	papolg	100	96.454	Poecilia_latipinna
ENSGAFG00000003263	papolg	100	95.991	ENSPMEG00000003961	papolg	100	96.226	Poecilia_mexicana
ENSGAFG00000003263	papolg	100	94.588	ENSPREG00000010358	papolg	100	94.824	Poecilia_reticulata
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.474	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	68.725	Pongo_abelii
ENSGAFG00000003263	papolg	96	64.000	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	86	83.439	Procavia_capensis
ENSGAFG00000003263	papolg	89	63.179	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	62.549	Propithecus_coquereli
ENSGAFG00000003263	papolg	76	81.421	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	87	81.421	Pteropus_vampyrus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	85.781	ENSPNYG00000006729	papolg	95	95.691	Pundamilia_nyererei
ENSGAFG00000003263	papolg	99	75.033	ENSPNAG00000015521	papolg	100	75.033	Pygocentrus_nattereri
ENSGAFG00000003263	papolg	89	70.118	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	69.271	Rattus_norvegicus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	65.040	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	64.567	Rhinopithecus_bieti
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.525	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	69.029	Rhinopithecus_roxellana
ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.868	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	69.382	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSGAFG00000003263	papolg	94	68.880	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	69.038	Sarcophilus_harrisii
ENSGAFG00000003263	papolg	89	72.644	ENSSFOG00015002383	papolg	79	87.729	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000003263	papolg	89	64.744	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.136	Scleropages_formosus
ENSGAFG00000003263	papolg	67	94.580	ENSSMAG00000015598	papolg	100	83.986	Scophthalmus_maximus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	87.470	ENSSDUG00000000912	papolg	100	87.161	Seriola_dumerili
ENSGAFG00000003263	papolg	100	87.352	ENSSLDG00000001217	papolg	100	87.044	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSGAFG00000003263	papolg	89	67.411	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	67.150	Sphenodon_punctatus
ENSGAFG00000003263	papolg	100	86.199	ENSSPAG00000009004	papolg	100	86.753	Stegastes_partitus
ENSGAFG00000003263	papolg	99	70.000	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.799	Sus_scrofa
ENSGAFG00000003263	papolg	63	73.120	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	73.120	Taeniopygia_guttata
ENSGAFG00000003263	papolg	89	80.662	ENSTRUG00000006410	papolg	99	80.662	Takifugu_rubripes
ENSGAFG00000003263	papolg	89	77.690	ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.575	Tetraodon_nigroviridis
ENSGAFG00000003263	papolg	88	63.395	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	62.105	Tupaia_belangeri
ENSGAFG00000003263	papolg	96	65.526	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	65.658	Tursiops_truncatus
ENSGAFG00000003263	papolg	97	68.146	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	68.915	Ursus_americanus
ENSGAFG00000003263	papolg	96	68.997	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	68.915	Ursus_maritimus
ENSGAFG00000003263	papolg	88	65.390	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.395	Vicugna_pacos
ENSGAFG00000003263	papolg	96	69.525	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.586	Vulpes_vulpes
ENSGAFG00000003263	papolg	89	67.104	ENSXETG00000002208	papolg	100	66.273	Xenopus_tropicalis
ENSGAFG00000003263	papolg	59	98.798	ENSXCOG00000006611	papolg	73	98.798	Xiphophorus_couchianus
ENSGAFG00000003263	papolg	65	96.200	ENSXMAG00000007383	papolg	96	96.200	Xiphophorus_maculatus